然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉錄譜(Fig. 4G)。使用pseudobulk RNA-seq分析和預轉移體外培養的基因比較,生成了持續細胞的基因標記,其標志是記憶相關基因(Sell,Foxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達和效應相關基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(Fig. 4H-I)。對先前的體外單細胞數據(Fig. 2H-J)的進一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續性特征的細胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig. 4J-K)。這些數據表明,抑制CDK4/6促進T細胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。公共比較毒理基因組學數據庫。標志物課題第三方實驗室
隨后,作者研究了YTHDC2是否通過SLC7A11抑制胱氨酸攝取。當YTHDC2在H1299細胞中過表達時,并過表達SLC7A11完全恢復了受損的胱氨酸攝取(圖4E-G)。ATF4是SLC7A11轉錄的關鍵轉錄因子,ATF4在H1299細胞中上調SLC7A11(圖4H、I)。過表達YTHDC2仍然拮抗ATF4的作用(圖4H-J)。因此,YTHDC2損害依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取。結合臨床分析,YTHDC2表達下調,而SLC7A11表達上調(圖4K、L),并且它們在**中呈負相關(圖4M)。
5.YTHDC2以m6A依賴的方式使SLC7A11mRNA不穩定
作者為研究YTHDC2是否在轉錄被阻斷后調控SLC7A11mRNA的穩定性,通過泛轉錄抑制劑ActD處理H1299和H1975細胞,發現YTH結構域對于YTHDC2縮短H1299細胞中SLC7A11mRNA的半衰期至關重要(圖5A)。在H1975細胞中,CRISPR/Cas9技術使YTHDC2功能喪失,然后YTHDC2重構,進一步證實YTHDC2加速了SLC7A11mRNA的衰變(圖5B)。EXOSC10是一種外切酶,負責3’-5’外切酶活性。EXOSC10的缺失,減弱了YTHDC2縮短SLC7A11mRNA半衰期的作用(圖5C、D)。在藥理學水平上,用兩種泛-RNase抑制劑DEPC和RNasin***H1299細胞,也阻斷了YTHDC2的功能(圖5D)。 lncRNA課題分子生物學完善的實驗平臺提供可視化的建模服務。
1.肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11表達上調和***
為了探討Caspase-11在肝脂肪變性中的作用,我們首先檢測了肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11的表達。如圖1A所示,與正常小鼠相比,MCD誘導的肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11mRNA明顯增加。相應的,在MCD誘導的肝脂肪變性小鼠的肝臟中,pro-caspase-11(圖1B和C)和cleaved-caspase-11(圖1B和D)的蛋白水平均***上調。這些結果提示Caspase-11與肝臟脂肪變性呈正相關。
2.Caspase-11缺乏減弱MCD誘導的小鼠肝脂肪變性
為了評估Caspase-11對肝脂肪變性的潛在影響,我們在Caspase-11缺陷小鼠中誘導肝脂肪變性并監測表型。正常野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟組織學表現正常。野生型小鼠經MCD***后,肝臟出現明顯的脂肪變性和腫脹。與MCD處理的野生型小鼠相比,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的脂肪變性和腫脹明顯減少(圖2A)。相應的,與MCD處理的野生型小鼠相比,MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟脂肪變性評分(圖2B)和膨脹評分(圖2C)***降低。
滲透活性劑保護細胞防止ferroptosis
氣孔形成是不同類型調控細胞死亡的共同特征。質膜孔的打開導致水分子的流入,這是由于無法通過膜孔的高濃度細胞內大分子造成的滲透失衡的結果(圖3A)。這種效果可以通過添加不能夠通過孔進入細胞的適當大小的滲透保護劑peg來阻止,從而平衡細胞內滲透壓、水流入和隨后的細胞坍塌(圖3B)。加入1.8nm的peg并不能阻止胞質Ca2+的增加、細胞圓化或細胞死亡(圖3C-F)。相比之下,在peg(2.3nm和2.7nm)的存在下,胞質Ca2+水平的增加和細胞死亡均以尺寸依賴的方式延遲(圖3D,F)。PEG(2.7nm)對ferroptosis的保護作用在洗滌后恢復,這表明膜損傷隨時間的推移是穩定的(圖3G)。我們還發現,PEG(2.7nm)并不能阻止RSL3處理的NIH-3T3細胞的脂質過氧化(圖3H,I)。對于使用的所有PEG大小,NIH-3T3細胞處理較長時間(24h)后細胞死亡恢復(圖3J)。PEG對ferroptosis動力學的抑制作用也隨著RSL3濃度的增加而降低(圖3K,L)。**終作者以在較低濃度RSL3下能夠起到保護作用的PEG尺寸作為參考,得出質膜穿孔部分的半徑約為2.5nm(圖3L)。 課題CRO服務找上海英拜。
2、CFL1的高表達與HCC的不良預后相關單變量分析顯示,**大小、**數量、TNM分期、靜脈浸潤、HBV***和CFL1水平與HCC患者的總體生存率***相關(表2)。多變量分析顯示,***大小、**數量、靜脈浸潤和CFL1水平是HCC總體生存率的**預后指標(表2)。并且,可以看出CFL1的高表達與HCC的不良預后相關。
3、CFL1促進HCC的增殖,遷移和侵襲如圖2所示,在高表達CFL1的HCCLM3和MHCC97h細胞中,敲除CFL1(圖2A)。隨后實驗發現敲除CFL1后HCCLM3和MHCC97h細胞的增殖,遷移和侵襲能力被抑制,表明CFL1促進HCC的增殖,遷移和侵襲。 zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數量。褪黑素課題產學研合作
Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。標志物課題第三方實驗室
2.Tempol能中度改善DHEA誘導的PCOS大鼠的糖耐量
由于多囊卵巢綜合征與代謝紊亂密切相關,評估了不同組的胰島素敏感性和葡萄糖穩態。DHEA+PBS組大鼠的空腹血糖水平雖然沒有明顯差異,但其空腹血清胰島素水平和HOMA-IR值均高于油+PBS組。Tempol***降低了空腹胰島素水平,而對PCOS大鼠的空腹血糖水平和HOMA-IR值無***影響(圖2A-C)。OGTTs顯示PCOS大鼠葡萄糖***延遲和曲線下面積增加,這表明DHEA處理降低了葡萄糖排泄能力。經tempol***后,糖耐量受損情況得到改善(圖2D)。ITTs證明,三組大鼠對胰島素的反應相同(圖2E)。 標志物課題第三方實驗室
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