通過circRNA芯片分析了三對NSCLC樣品中circRNA的表達譜，總共鑒定出109個circRNA失調，33個上調，76個下調。qRT-PCR驗證52個配對NSCLC樣品中**差異circRNA的表達。circNDUFB2是**顯著下調的circRNA。臨床分析發現circNDUFB2高表達與NSCLC患者的**大小、淋巴結轉移和分期呈負相關。結果表明，circNDUFB2在NSCLC中經常被下調，并且與NSCLC的惡性特征呈負相關。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產生，長度為249nt。circNDUFB2可由發散引物擴增，收斂引物不能擴增。核酸酶消化證實circNDUFB2具有閉環結構。放線菌素D處理表明，與NDUFB2mRNA相比，circNDUFB2是穩定的。核質分離PCR以及熒光原位雜交（FISH）顯示circNDUFB2主要定位于細胞質中。這些結果表明circNDUFB2是一個circRNA。完善的實驗平臺提供可視化的建模服務。細胞因子
2)在體內和體外，DRD2的表達抑制BrCa細胞的**發生
構建過表達DRD2的MDA-MB231和BT549細胞，通過RT-PCR(Figure2A)和WB(Figure2B)驗證。CCK8實驗證明，DRD2異位表達抑制**細胞生長(圖2C)。在單層集落形成實驗(圖2D)和軟瓊脂形成實驗(圖2E)中，DRD2也損害了存活能力。并進行細胞凋亡和細胞周期分布分析。DRD2的表達***促進了BrCa細胞凋亡(圖2F)，并阻斷了MDA-MB231和BT549在G2/M期的凋亡(圖2G)。此外，過表達DRD2促進了BrCa細胞對PTX的敏感性(圖2H)。在傷口愈合實驗中，異位表達的DRD2比對照組表現出更少的閉合人工傷口的能力(圖2I)。與此相一致的是，DRD2的過表達***降低了BrCa的遷移和侵襲(圖2J)。在體內進一步測定了DRD2的抑瘤作用。皮下**模型顯示過表達DRD2模型的**體積和重量均減小(圖2K)。 出生缺陷拷貝數TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。
一、異種HSCT前后監測腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統。
在1年的時間里，從29名兒童的10個時間點收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次，HSCT當天，HSCT后1個月每周，以及HSCT后12個月的3個隨訪時間點(圖1)。通過16SrRNA基因譜測定這些樣本中的微生物群落動態。共對709份患者樣本(212份糞便樣本、248份口腔拭子和249份鼻拭子來自10個時間點)進行了鑒定。發現移植前患者的微生物群落組成與健康對照不同；三個身體部位性在HSCT后微生物α多樣性下降；在一年中，微生物群落動態呈現出三個階段：第一階段(在檢查前和適應開始時的樣本)，第二階段(HSCT的***天到第1個月)，第三階段(月+3到月+12)(圖1C)；第一階段和第三階段的樣本在口腔和鼻腔重疊，表明微生物群落可能從較晚的時間點恢復到與造血干細胞移植前類似的狀態。
3）DRD2重新編碼MφM1表型，下調IL-6和IL-10
據報道，DRD2可調節M1的極化。結果顯示，在DRD2表達水平較高的BrCa組織中，M1Mφ的浸潤增加，M2Mφ的浸潤減少(圖3A)。為進一步研究DRD2對TAMs的調控作用，構建了BrCa與Mφ共培養體系。當Mφ與表達DRD2的BrCa細胞共培養時，qRT-PCR顯示M1表型標記增加，M2Mφ標記下調(圖3B-C)。qRT-PCR也證實了載體轉染的BrCa細胞將Mφ調節為M2型(圖3C)[12]。WB結果顯示，表達DRD2的BrCa細胞上調M1標記iNOS，下調M2標記CD206(圖3D)。IF染色顯示，與表達DRD2的**細胞共培養后，Mφ表現為M1表型(圖3E)。上述結果表明，BrCa中的DRD2具有將Mφ重新編碼為M1表型的能力。為了探索使Mφ向M1表型分化的關鍵調控因子，我們進行了細胞因子陣列分析。結果表明，TNF-α和兩種誘導M1極化的經典細胞因子IFNγ均未增加。而與Mφ共培養后，DRD2***下調IL-6和IL-10(圖3F)。分析熒光值，進一步證實IL-6和IL-10下調(圖3F)。因此，DRD2可以將Mφ重新編碼為M1表型，并在crosstalk過程中***下調IL-6和IL-10。 高通量分子實驗的后續標書申請指導服務。
VD通過Ca2+-CAMKK2途徑調控AMPK
AMPK通過上游激酶磷酸化***，主要包括STK11/LKB1和CAMKK2/CaMKKβ。為了確定AMPK激酶是否參與paricalcitol介導的AMPK***，我們使用STO-609(選擇性CAMKK抑制劑)、CAMKK2siRNA和HK-2STK11KO細胞。與STO-609或CAMKK2siRNA共同處理完全消除了paricalcitol刺激的PRKAA1和ULK1磷酸化。然而，paricalcitol能夠***HK-2STK11KO細胞中的PRKAA1和ULK1。這些結果表明paricalcitol通過CAMKK2***AMPK。由于CAMKK2主要受細胞內Ca2+濃度的調節。為了闡明Ca2+信號在paricalcitol介導作用中的參與，我們使用熒光Ca2+探針Fluo4AM評估了細胞內Ca2+濃度的變化對paricalcitol處理的響應。如圖7D所示，當HK2細胞暴露于高糖環境時，Ca2+濃度下降，paricalcitol可以緩解這種下降。 醫學整體課題外包服務。核受體與輔助調節因子
提供整體課題外包實驗構思。細胞因子
藥物篩選確定**類腸道中HIF-2α的合成易損性
作者構建Apc缺失型（Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/fl）和CRCHIF-2α過表達小鼠模型（Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL），從這2個小鼠模型中分離腸類藥物，并用化療藥物培養，生長被監測了5天。在Cdx2-ERT2Cre;在Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL小鼠中，他莫昔芬可誘導HIF-2α，并特異性地破壞結腸上皮細胞中的Apc。來自Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/fl**腸系膜的小鼠對doxorubicin,mitoxantrone,irinotecan,以及eribulin等藥物高度敏感，與來自Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF2αLSL/LSL的不同。RSL3、sorafenib索拉菲尼、erastin和DMF被認為是***的小分子，可以***降低Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF2αLSL/LSL**腸道類物質的生長。Erastin和RSL3是經典的ferroptosis***劑，分別抑制xCT(由Slc7a11基因編碼，是xC系統的一個組成部分)和GPX4。DMF一種細胞可滲透的線粒體衍生物，在一些**細胞系中具有細胞毒性這些結果表明，HIF-2α表達的**可以被氧化應激***劑選擇性靶向。 細胞因子
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗