A.29名兒童在進(jìn)行異體造血干細(xì)胞移植前、移植時(shí)、移植后即刻以及后期隨訪時(shí)均進(jìn)行了監(jiān)測(cè)。監(jiān)測(cè)患者的基線特征、臨床結(jié)果、免疫細(xì)胞計(jì)數(shù)以及炎癥和***標(biāo)志物。表S1(附加文件1)詳細(xì)描述了患者特征。宿主免疫系統(tǒng)參數(shù)與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動(dòng)力學(xué)相關(guān)，這些微生物群在指定的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行了評(píng)估。
B.每個(gè)身體部位HSCT前、移植時(shí)和移植后的細(xì)菌α多樣性以log10變換后的y軸顯示。星號(hào)表示時(shí)間點(diǎn)間的中值逆Simpson指數(shù)存在***差異。C.相對(duì)于HSCT的時(shí)間點(diǎn)LDA分析。對(duì)于糞便樣本，HSCT后立即采集的樣本LDA評(píng)分為陽(yáng)性。對(duì)于口腔和鼻腔樣本，在HSCT前和后期隨訪時(shí)間點(diǎn)樣本的LDA評(píng)分均為陽(yáng)性 深耕科研行業(yè)提高科研的高效。福建課題國(guó)家自然科學(xué)基金
自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進(jìn)行運(yùn)輸、溶解。研究表明，自噬異常會(huì)影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會(huì)增強(qiáng)*細(xì)胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會(huì)造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發(fā)**。本研究旨在探索人類**中是否有某些突變通過(guò)影響LIR基序來(lái)改變自噬選擇性，進(jìn)而影響疾病進(jìn)程。
1.構(gòu)建LIR預(yù)測(cè)模型pLAM
收集人、釀酒酵母、其他物種LIR，并獲取相應(yīng)蛋白,確定了LIR的序列信息。
驗(yàn)證算法的可靠性，然后用于泛*LIR基序預(yù)測(cè)，并對(duì)預(yù)測(cè)到的LIR基序?qū)?yīng)的基因進(jìn)行GO、Pathway富集分析。
2.LIR基序突變預(yù)測(cè)
收集TCGA、ICGC和COSMIC數(shù)據(jù)庫(kù)突變數(shù)據(jù)并進(jìn)行整合，獲得2,963,952個(gè)獨(dú)特的SNV。提取其中LIR基序的突變信息。分析發(fā)現(xiàn)STBD1蛋白，參與糖原代謝，在之前尚未報(bào)道過(guò)與**自噬有關(guān)。 廣西課題省自然科學(xué)基金IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。
接下來(lái)，我們合成了野生型HuR蛋白(WT)和HuR蛋白的截短突變體（即分別為單獨(dú)HuR的RNA識(shí)別基序(RRM)1的突變體B1、單獨(dú)HuRRRM2的突變體B2和單獨(dú)HuRRRM3的突變體B3）（圖4C）。同時(shí)，我們?cè)O(shè)計(jì)并合成了生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針，分別特異性靶向lnc-PMIF的中心-莖環(huán)和生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針，特異性靶向之前報(bào)道的與HuR蛋白相互作用的β-actinmRNA的序列。RNA電泳遷移率變動(dòng)分析(EMSA)發(fā)現(xiàn)只有當(dāng)生物素標(biāo)記的lnc-PMIF探針與WTHuR或截短突變體B3共孵育時(shí)，才能檢測(cè)到lnc-PMIF-HuR復(fù)合物，這表明HuR的RRM3可介導(dǎo)HuR和lnc-PMIF之間的相互作用。lnc-PMIF與β-actinmRNA競(jìng)爭(zhēng)與HuR相互作用。過(guò)表達(dá)HuR-RRM3后細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)下降***上調(diào)，遷移活性增強(qiáng)。所有這些表明lnc-PMIF可與HuR的RRM3結(jié)合，中斷HuR-β-actin的相互作用，抑制β-actin的表達(dá)，抑制OPC的遷移。
6、MAO-A阻斷**免疫***-人類TAM和臨床數(shù)據(jù)相關(guān)性研究
為了探索MAO-A阻斷***的翻譯潛力，首先研究了MAO-A對(duì)人巨噬細(xì)胞極化的調(diào)控。分析體外培養(yǎng)的免疫刺激M1樣和免疫抑制M2樣人單核細(xì)胞源性巨噬細(xì)胞的基因表達(dá)特征。有趣的是，在所有檢測(cè)的免疫檢查點(diǎn)、免疫刺激和免疫抑制基因中，MAOA是M2樣單核來(lái)源巨噬細(xì)胞（MDMs）中表達(dá)水平比較高的基因（圖6a），提示MAO-A可能在促進(jìn)人巨噬細(xì)胞免疫抑制極化中發(fā)揮作用。MDM培養(yǎng)的時(shí)間過(guò)程分析證實(shí)了巨噬細(xì)胞分化過(guò)程中MAO-A基因和蛋白表達(dá)上調(diào)，并在IL-4/IL-13誘導(dǎo)的免疫抑制極化后進(jìn)一步上調(diào)（圖6b-d）。用苯乙肼阻斷MAO-A可***抑制IL-4/IL-13誘導(dǎo)的MDMs免疫抑制極化（圖6e-g）。綜上所述，這些體外數(shù)據(jù)表明MAO-A在人巨噬細(xì)胞中高表達(dá)，特別是在其免疫抑制極化期間，并且MAO-A阻斷具有重新編程人巨噬細(xì)胞極化的潛力。 表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點(diǎn)的***有關(guān)。
4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用
據(jù)報(bào)道，外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來(lái)轉(zhuǎn)運(yùn)。通過(guò)RNApull-down分析和質(zhì)譜分析，鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運(yùn)的RNA結(jié)合蛋白，并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(dá)（Fig.4a,b）。hnRNPA2B1是一種RNA結(jié)合蛋白，通過(guò)與特定基序GGAG/CCCU結(jié)合，參與miRNAs的運(yùn)輸和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。特別是，由于miR-934序列中有兩個(gè)GGAG基序，我們推測(cè)hnRNPA2B1可能通過(guò)與GGAG序列結(jié)合，介導(dǎo)miR-934包裝成外泌體的過(guò)程。此外，miRNApull-down分析顯示，在細(xì)胞質(zhì)和外泌體中，miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結(jié)合關(guān)系，然而，突變miR-934的結(jié)合序列(GGAG)可削弱這種結(jié)合（Fig.4c）。RNA免疫沉淀分析進(jìn)一步證明，無(wú)論是在CRC細(xì)胞及其外泌體裂解物中，miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集（Fig.4d）。此外，敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細(xì)胞轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞的過(guò)程（Fig.4e）。因此，這些結(jié)果證實(shí)hnRNPA2B1可以通過(guò)與miR-934的GGAG序列結(jié)合，介導(dǎo)miR-934包裝到CRC細(xì)胞外泌體中，并將外泌體miR-934轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞中。 英拜提供生物醫(yī)學(xué)課題外包服務(wù)。云南課題中標(biāo)率高
也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。福建課題國(guó)家自然科學(xué)基金
4、白樺素能改善小鼠血液、肝臟和脂肪組織中的脂質(zhì)參數(shù)
測(cè)量了血液和其他組織中的脂質(zhì)水平，如圖5所示。洛伐他汀和白樺素處理的小鼠的血清總膽固醇（TC）和甘油三酸酯（TG）的水平顯著低于對(duì)照***的小鼠（圖5A和5B）。值得注意的是，與洛伐他汀相似，白樺素降低了LDL膽固醇（LDL-c）的含量并增加了HDL膽固醇（HDL-c）（圖5C和5D）。有趣的是，盡管白樺素和洛伐他汀均降低了肝臟的TC水平，但只有白樺素顯著降低了肝臟的TG含量（圖5E和5F）。 福建課題國(guó)家自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)