單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術可以在單細胞水平下研究復雜的多細胞生物的轉錄組譜。這為科學家提供了一種研究表達模式中細胞異質性的新工具,尤其是疾病細胞的異質性。更重要的是,scRNA-seq的快速發展帶來了在疾病微環境中探索細胞亞群的見識,這有助于研究疾病的發***展,耐藥性和免疫逃逸。scRNA-seq技術已被廣泛應用于病例對照研究中差異表達基因的識別以及細胞亞群之間差異的識別。
***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research期刊(IF=11.502),題名為SC2disease: a manually curated database of single-cell transcriptome for human diseases的文章。SC2disease是一個人工收集的數據庫,能為研究者提供各種疾病的各種細胞類型準確的基因表達譜資源。該網站通過回顧2020年3月之前使用scRNA-seq研究人類樣本疾病的文獻,并開發了SC2disease數據庫,通過疾病、組織和細胞類型整理數據。SC2disease包含946481條數據,對應341種細胞類型、29種組織和25種疾病。SC2disease數據庫中的每個條目都包含不同細胞類型、組織和疾病相關健康狀況之間差異表達基因的比較。 我們構建了生物素標記的circSDHC探針.空間轉錄組學標書中標率高
導語:免疫檢查點阻斷療法已證明對多種**類型具有良好的臨床效果。程序性細胞死亡蛋白1(PD-1)是免疫檢查點,然而,由于耐藥性以及用于患者分層的生物標志物不足,*少數患者從單藥***中獲益,在很大程度上限制了臨床效應。這里,小編帶大家領略下小分子化合物的在耐***面的獨特魅力。參考文獻:TYRO3inducesanti–PD-1/PD-L1therapyresistancebylimitinginnateimmunityandtumoralferroptosis(IF=11.864)
1.TYRO3高表達與抗PD-1/PD-L1***患者的預后不良相關建立**小鼠體內耐藥模型,將4T1乳腺*細胞接種到BALB/c小鼠的乳腺脂肪墊中,用抗PD-1(抗mPD-1)抗體***,發現親代4T1(4T1-P)**對抗mPD-1***有反應,**生長減少。相反,耐藥的4T1(4T1-R)**對抗mPD-1無反應。使用市售的RTK抗體陣列系統與4T1-P或4T1-R細胞的裂解物雜交,發現4T1-R細胞中TYRO3、EPHB2、FLT3和TRKA表達或磷酸化水平高于4T1-P細胞,TYRO3的增加比較高。在接受抗PD-1抗體***的黑色素瘤患者的生存數據中,較高的TYRO3表達水平與較短的總生存期相關,表明TYRO3表達與抗PD-1耐藥相關。TYRO3較高的表達與多種**類型的較差預后相關。 北京標書地區科學基金FMT處理可能導致SCI后胃腸道消化活力變快。
巨噬細胞在AP恢復不同階段的不同作用
鑒于AP恢復過程中巨噬細胞的表型變化,接下來試圖通過用脂質體***巨噬細胞來檢查巨噬細胞在不同修復/再生階段的作用。首先,我們在急性炎癥反應后(從第1天到第2天)立即消耗了胰腺巨噬細胞,并在第3天檢查了胰腺。如圖所示,第3天之前巨噬細胞的消耗可以在很大程度上減少導管樣結構,這表明巨噬細胞在ADM的形成。AP損傷后第3天巨噬細胞的消耗顯著延遲了胰腺修復。Ki67+細胞在第3天達到峰值,并隨著胰腺恢復逐漸下降。與組織學結果一致,發現CN處理組的Ki67+細胞從第5天到第7天大幅下降,但在CL處理組中沒有,表明CL處理小鼠的修復過程受損。
褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡
為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡,在相應的高峰表達(例如1天和3天)進行了與鐵死亡相關蛋白的蛋白質印跡分析。發現褪黑素給藥在TBI后1天抑制了TBI誘導的xCT,Cox2,Tfr1,Fpn和Nox2蛋白表達的上調。同樣,褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth,Ftl和4HNE蛋白的表達。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1(Lip-1)也獲得了相似的結果。此外,免疫組化染色顯示,與對照組相比在TBI后第7天,褪黑素和Lip-1的處理減少了神經元中4HNE陽性細胞的數量,表明褪黑素對TBI誘導的脂質具有神經保護作用過氧化。褪黑素和Lip-1均抑制TBI誘導的皮質GSH水平降低。褪黑素和Lip-1抑制TBI誘導3天后損傷皮層中MDA含量的上調。這些數據表明,TBI導致了與鐵死亡相關蛋白表達的時間變化,以及同側皮層中某些受推定的鐵死亡生物標志物的變化,但是用褪黑素有效地挽救了TBI誘導的鐵死亡。 評估了丙酸丁酸和異丁酸的含量是否與運動恢復或腸道完整性相關。
六、改進分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs
研究者基于細胞表面標記設計了一種針對HSCs / MPP的新的熒光***細胞分選策略(簡稱CD-REF),使用CD-REF分選板對股骨BM細胞進行分選,結果顯示標記為HSCs / MPP和HSCs / MPPs-Cycle簇的CD-REF細胞約占88%。為了評估CD-REF細胞譜系輸出的分化潛力和穩健性,研究人員在小鼠MS5飼養層或更具生理相關性的人類胎兒間充質干細胞(fMSCs)上對三個胎兒的單個細胞進行了分選,結果顯示MS5和fMSCs上分別存在著四系、三系、雙系、單系和未分化的譜系集落。接下來,又對單個CD-REF和免疫表型HSCs進行了分類,結果顯示CD-REF在胎兒肝臟和骨髓中富集了多譜系輸出的細胞群,且CD-REF細胞具有與表型HSCs相當的多潛能性和譜系輸出能力,這與前述分化軌跡探究一致,再次驗證CD-REF**了高富集的HSC/MPPs群體。 與未接受FMT***的受傷小鼠相比接受FMT***的小鼠表現出相對更大的運動恢復。焦亡生物相關標書
FMT處理可以改善SCI小鼠的體重增加和代謝狀況。空間轉錄組學標書中標率高
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
研究了磷脂酰肌醇3,4,5磷酸(PIP3)在DNA損傷后的細胞定位。將MCF10A細胞按上述方法同步輻照,免疫熒光法分析PTEN的亞細胞分布。PTEN-WT和PTEN-398A蛋白在細胞核和質膜穩定定位(圖6A, B)。經過IR處理后,PTEN-WT在質膜上積累(圖6A, B)。相比之下,在這些條件下,沒有檢測到PTEN-398A蛋白的重新定位(圖6A, B)。B).我們通過細胞分離和膜相關PTEN的免疫印跡分析進一步證實了這些結果(圖6C, D)。這些結果表明,ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布,這與AKT通路***減少有關 空間轉錄組學標書中標率高
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
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3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗