巨噬細胞在 AP 恢復不同階段的不同作用
鑒于 AP 恢復過程中巨噬細胞的表型變化,接下來試圖通過用脂質體***巨噬細胞來檢查巨噬細胞在不同修復/再生階段的作用。首先,我們在急性炎癥反應后(從第 1 天到第 2 天)立即消耗了胰腺巨噬細胞,并在第 3 天檢查了胰腺。如圖所示,第 3 天之前巨噬細胞的消耗可以在很大程度上減少導管樣結構,這表明巨噬細胞在ADM的形成。AP 損傷后第 3天巨噬細胞的消耗顯著延遲了胰腺修復。Ki67 +細胞在第3天達到峰值,并隨著胰腺恢復逐漸下降。與組織學結果一致,發現CN處理組的Ki67 +細胞從第 5 天到第 7 天大幅下降,但在 CL 處理組中沒有,表明 CL 處理小鼠的修復過程受損。 IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。單細胞相關課題課題細胞實驗
二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎
CDH2是鈣粘蛋白家族的一員,被認為是決定干細胞命運的調節因子15。類似地,G蛋白偶聯受體12(GPR12)在原始亞型中上調,已知在干細胞維持和**干細胞的體細胞重編程中發揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達增加,據報道它是WNT信號通路的調節因子,只在造血干細胞祖細胞中表達。鋅指蛋白521(ZNF521)是一種轉錄因子,其在人類白血病細胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達。CD163是一種免疫調節劑,是巨噬細胞清清體受體家族的成員,已知在單核細胞系的AML細胞中表達。在committedcluster中其他基因的高表達包括免疫相關基因,如C1QA,CD14和MARCO。msl1基因,一種已知的白血病干細胞增殖抑制因子,也在committedcluster中高表達。我們通過qPCR驗證了關鍵基因的差異表達(圖2B)。使用基因**富集分析(GSEA),在committed亞型中,免疫反應通路如干擾素-γ介導的信號通路、GPCR信號通路和toll樣受體(TLR)信號通路上調(圖2C,D,SupplementaryFigs.16,18,與FLT3-ITD和DNMT3A突變的弱相關性一致。 蛋白組學課題技術指導生命科學領域內的精細研究。
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
研究了磷脂酰肌醇3,4,5磷酸(PIP3)在DNA損傷后的細胞定位。將MCF10A細胞按上述方法同步輻照,免疫熒光法分析PTEN的亞細胞分布。PTEN-WT和PTEN-398A蛋白在細胞核和質膜穩定定位(圖6A, B)。經過IR處理后,PTEN-WT在質膜上積累(圖6A, B)。相比之下,在這些條件下,沒有檢測到PTEN-398A蛋白的重新定位(圖6A, B)。B).我們通過細胞分離和膜相關PTEN的免疫印跡分析進一步證實了這些結果(圖6C, D)。這些結果表明,ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布,這與AKT通路***減少有關
**調節因子通常作為蛋白質復合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉錄調控,例如通過調節組蛋白修飾和染色質結構。哺乳動物BRG1-或brm相關的染色質重塑復合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細胞染色質可及性景觀。該復合物是細胞周期和增殖的關鍵調控因子,也是前列腺*的驅動因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復合物重新靶向于染色質,促進前列腺*的發生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復雜功能的關鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經建立。TF FOXA1可以結合到封閉的染色質區域,調節其染色質可及性,從而促進AR結合染色質引發PCa。高通量測序后續的機制實驗。
2021年,來自加拿大多倫多大學和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學等團隊合作在Nature communication雜志上發表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質性。基于rna-seq的基因表達譜分析,確定了兩種新亞型,稱為原始型和committed型。基于基因表達、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異,在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態和患者生存聯系起來。此外,表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。課題外包服務找英拜放心安心。甘肅課題推薦咨詢
TRF測序課題整體服務。單細胞相關課題課題細胞實驗
在體外,上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬
自噬已被證實在AKI中發揮重要作用。因此,自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中,自噬相關指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示,上調UCP1消除AKI中的脂質積累后,細胞自噬得到促進(圖7C)。基于這些發現,為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性,我們進行了功能恢復實驗。如圖7D-F所示,氯喹抑制自噬***逆轉了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣,TUNEL染色顯示,使用氯喹抑制自噬,可以明顯逆轉UCP1促進的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結果表明,脂質積累通過作用于AKI細胞自噬,在調節細胞功能方面發揮著重要作用。 單細胞相關課題課題細胞實驗
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗