急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學上的異質性疾病，其特征是克隆擴增和突變的造血干細胞和祖細胞分化受損。在AML**常見的驅動突變中，NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩定的，在20%-30%的病例中發生。由于其生物學意義和預后影響，NPM1突變在世界衛生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個獨特的白血病實體，并在預后和***決策中發揮重要作用。NPM1突變通常與誘導和鞏固化療后患者生存的良好影響相關。在NPM1突變的AML中，FLT3-ITD突變經常與DNMT3A突變同時發生，這本身與接受標準誘導***的患者預后更差有關。大多數關于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的同時發生，而突變型NPM1患者基因表達水平的異質性及其生物學意義尚未得到***研究。英拜生物對實驗可行性分析。外泌體課題基礎實驗外包
三、INPP4B促進晚期核內體上PI(3,4)P2到PI(3)P的轉化
使用了幾種基于無偏性蛋白質組學的技術來表征INPP4B在pik3a突變ER+乳腺*中的下游信號功能。首先，利用液相色譜-串聯質譜(LC-MS/MS)進行全細胞蛋白質組學研究，確定GFP-INPP4B與gfp載體表達MCF-7細胞中蛋白水平的差異(2倍)。功能注釋分析顯示，inpp4b過表達細胞中上調的蛋白與內溶酶體系統密切相關，內溶酶體系統是介導細胞外受體和貨物內化和降解的囊泡運輸途徑(圖3a)。免疫沉淀質譜(IP-MS)對受EGF刺激的MCF-7細胞進行GFP-INPP4B蛋白復合物的分析，以***I類PI3K信號。從該分析中鑒定出的**富集的結合伙伴是RAB7A (Rab7)，這是一種定位于晚期核內體的小GTPase(圖3b)。GFP-INPP4B與內源性Rab7的共免疫共沉淀證實了INPP4B與Rab7的結合(圖3c)。通過免疫電鏡進一步分析INPP4B定位于晚期核內體，結果顯示GFPINPP4B定位于晚期核內體的限制膜和內膜(圖3d)，之前的研究已經確定了PI(3,4)P2和PI(3)P。在皂苷處理的MCF-7細胞中，觀察到內源性INPP4B與HARab7WT或HA-Rab7Q67L共同定位于cd63陽性的晚期核內體(圖3e)。 浙江課題課題設計我們使用抗體陣列評估了表達PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。
6、白樺素降低***的發展
用LDLR敲除小鼠探索了白樺素對***病變形成的作用。LDLR缺陷小鼠用WD飲食并分別添加了成分，對照（鹽），洛伐他汀（30mg/kg/day）或白樺素（30mg/kg/day）處理14周。不同組的小鼠顯示出相似的食物攝入量和體重（圖7A-7B）。在經白樺素處理的小鼠肝臟中，SREBP-1c和SREBP-2降低，脂質合成基因（包括HMGCS，HMGCR和FAS）下調（圖7C）。但是，洛伐他汀可上調HMGCR和FAS基因的表達（圖7C）。白樺素極顯著降低了血液中的TC，TG和LDL-c的含量，并增加了HDL-c。洛伐他汀具有類似的作用，只是它不降低TG（圖7D–7G）。與對照處理的小鼠相比，洛伐他汀或白樺素處理的小鼠的主動脈斑塊的數量和大小顯著降低（圖7H和7I）。特別是，主動脈弓（圖7J）和胸主動脈（圖7K）的病變區域明顯較小。以上數據表明，白樺素降低了WD喂養的LDLR敲除小鼠***病變的形成，并穩定了主動脈根部粥樣硬化斑塊。
總之，本文確定了SREBP的一種特定的小分子抑制劑，即betulin白樺素，可以降低脂質水平，增強胰島素敏感性并減少***斑塊的形成。 這些數據支持以下觀點：抑制SREBP途徑可能是***II型糖尿病和***的有用策略。 Betulin可以作為藥物控制代謝性疾病的主要化合物。
轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。單細胞核測序，能夠獲得組織的細胞圖譜，解決細胞異質性的問題。單細胞或細胞核RNA測序(scRNA-seq或snRNAseq)促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類和小鼠腎臟的多個scRNAseq圖譜已經確定了轉錄如何有助于細胞類型的特異性。**近的方法已經將這種方法擴展到單細胞染色質可及性分析。單核染色質轉置可及性測序試驗(snATACseq)是ATAC-seq的擴展，該試劑盒利用Tn5轉置酶在數千個單個細胞中測量染色質可及性。IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。
CircMYH9促進p53野生型小鼠的結直腸**發生
為了確定circMYH9在體內CRC發病機制中的因果作用，通過將p53fl/fl小鼠與Villin-Cre小鼠雜交，產生了結腸特異性、條件性p53KO小鼠。p53WT小鼠和p53KO小鼠用氧化偶氮甲烷(AOM)和葡聚糖硫酸鈉(DSS)處理59天以誘導結直腸**發生。在AOM注射前一周，使用AAV9作為載體在小鼠結腸中特異性過表達circMYH9。AAV-circMYH9的轉染效率通過qPCR驗證。與p53WT小鼠相比，p53KO小鼠的**數量、發病率和大小更多，與AAV-ctrl***的p53WT小鼠相比，p53WT小鼠中circMYH9的過度表達導致**數量、發病率和大小增加。帶有針對circMYH9的探針FISH證實circMYH9仍然在p53wt+AAV小鼠的**組織中表達。IHC檢查顯示，與ctrl-AAV小鼠相比，具有circMYH9過表達的**顯示出p53的表達受到抑制，而PHGDH和PSPH的表達增加。總之，這些結果表明circMYH9可以通過抑制p53和促進小鼠SG代謝來驅動化學誘導的致*作用。 ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布。TOLL課題實驗檢測服務
產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。外泌體課題基礎實驗外包
此外，circPDE4B不影響MID1水平(圖4E)。RPD和序列IP分析都顯示circPDE4B促進了RIC8A和MID1的結合(圖4F，G)。與這一發現相一致的是，體外結合試驗表明，circPDE4B增加了重組RIC8A和MID1蛋白之間的關聯(圖4H)。通過co-IP，MID1與RIC8A在N端調控域結合(圖4I)。此外，我們檢測了RIC8A的功能位點。在HCs中免疫沉淀RIC8A并進行MS分析，證實了RIC8A中氨基酸殘基的泛素化(圖4J)。在RIC8A、K143和K187中鑒定出10個泛素化位點，并且在人類和小鼠之間并不保守(圖4J)。因此，我們將保守的RIC8A位點從賴氨酸(K)突變為精氨酸(R)，以排除泛素化。IP結果表明，與WT相比，K415的取代**降低了RIC8A的泛素化位點(圖4K)。有趣的是，K415在哺乳動物中高度保守(圖4L，M)。此外，在K415突變后，circPDE4B過表達或抑制不再調節RIC8A的泛素化水平(圖4N)。這些結果表明circPDE4B可以作為促進RIC8A和MID1之間聯系的支架。外泌體課題基礎實驗外包
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
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