五、SIM2對ar介導的基因表達有***影響
利用RNAseq研究SIM2沉默后SIM2對基因表達的影響。沉默SIM2使dht調控的基因數量增加了一倍多,2394個基因受到雄***調控,而只有180個基因受到雄***調控(圖8a, b)。此外,沉默SIM2導致6867個deg,其中2937個deg受到雄***調控(圖8c, d, Supplementary Fig. S19f)。SIM2沉默也減輕了雄***對AR表達的抑制(補充圖S20)。根據RT-qPCR的評估,ARNT沉默實質上再現了SIM2對選定AR靶基因和DEGs的影響(補充圖S21a, b)。對雄***調節基因集的meta分析顯示,通過SIM2沉默,幾種途徑***富集。A_up/ siSIM2_up基因組和A_up/siSIM2_dn基因組中富集的**上面的通路分別是膜運輸和細胞對外界刺激的反應(圖8e)。 英拜生物對實驗可行性分析。代謝課題國家自然科學基金
盡管每組小鼠的身體活動都相似(圖4E),但接受白樺素的小鼠的RQ升高(圖4F),其耗氧量和能量消耗也增加了(圖4G和4H),這可能有助于他們體重增加量的減少。同時,接受30 mg / kg /day白樺素的小鼠暴露于寒冷時顯示出更高的體溫(圖4I)。進一步的Q-PCR分析顯示,在經白樺素處理的小鼠中,棕色脂肪細胞組織(BAT)中的兩個關鍵生熱基因UCP-1和UCP-2升高(圖4J)。該觀察結果與關于UCP-1在n-SREBP-1c轉基因小鼠的BAT中顯著降低的報道是一致的。總之,這些數據表明,洛伐他汀可能通過減少脂質吸收/增加排泄來至少部分地預防DIO,而白樺素通過增加能量消耗來改善DIO。cancer課題免費設計致力于醫學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫學課題的研究。
6)M1-Exos通過傳遞miR-155上調ROS水平,損害bEnd.3細胞線粒體功能
我們研究了外泌體miR-155與bEnd.3細胞中線粒體功能的關系。我們發現,與miR-NCOE-Exos相比,miR-155OE-Exos處理上調了ROS水平(圖6A和B),線粒體超氧化物水平(圖6C和D)和線粒體電位(圖6E);然而,miR-155KD-Exos處理則顯示了相反的結果(圖6A-E)。此外,miR-155OE-Exos可使線粒體腫脹更大,形態更短,線粒體碎片細胞比例更高,而miR-155KD-Exos可減輕線粒體腫脹(圖6F和G)。miR-155OE-Exos處理后的OCR、基礎呼吸、ATP產生、呼吸能力和呼吸逆轉均明顯下降,而miR-155KD-Exos處理減輕了氧化呼吸功能障礙(圖6H和I)。這些結果表明,上調外泌體miR-155可導致過度ROS的產生和線粒體功能障礙。
胰管腺*(PDAC)有明顯的肝轉移傾向。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。2021年4月發表于Gut(IF=19.819)的文章“Exosome-delivered CD44v6/C1QBP complex drives pancreatic cancer liver metastasis by promoting fibrotic liver microenvironment”對此進行了探究。本研究旨在探討PDAC來源的外泌體(Pex)調控肝臟微環境、促進轉移的潛在機制。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物對于肝纖維化微環境和PDAC肝轉移的形成是必不可少的。高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉移的很有前途的生物標志物。外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物。
表觀基因組學(ChIP-Seq)模塊
ChIP-seq模塊目前包含大量染色質免疫沉淀測序(ChIP-seq)數據,反映了特定的衰老相關基因座是如何受組蛋白修飾和轉錄因子調節的。這些數據有助于闡明調控因素如何在全基因組范圍內影響衰老過程中的基因表達。ChIP-seq數據來自已發表的與衰老相關的文章,并使用相同的分析方法處理原始數據以保持一致性。直觀地顯示了衰老過程中特定基因組位點不同轉錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。
蛋白質組學(蛋白質-蛋白質相互作用)模塊
衰老過程中蛋白質穩態受損是典型的,蛋白質相互作用隨著年齡的增長而發生顯著變化。蛋白質-蛋白質相互作用模塊(PPI)旨在允許查詢感興趣的蛋白質及其與衰老相關的相互作用蛋白。結果以兩種方式呈現:交互式表格和網絡圖。前者提供了更詳細的信息,包括相互作用蛋白的數量、細胞/組織類型和支持相互作用的出版物;后者允許蛋白質相互作用網絡的可視化,并提供使用在線工具對選定數據執行基因本體或 KEGG 通路分析的選項。因此,PPI 將成為分析細胞衰老過程中關鍵蛋白質相互作用的有用模塊,從而可以在蛋白質水平上更好地了解人類衰老。 課題外包服務找英拜放心安心。泌尿課題
產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。代謝課題國家自然科學基金
為了進一步探討m6A修飾在FZD7 mRNA中的作用,我們構建了三種FZD7突變體,其中一種突變體為***個m6A峰(FZD7- peak1 Mut),另一種突變體為第二個m6A峰(FZD7- Peak2 Mut),以及雙突變體(FZD7- peak1 &2 Mut;圖5)。與野生型相比FZD7 (FZD7-WT)突變在第二m6A峰和雙m6A峰值突變(FZD7-Peak2傻瓜和FZD7-Peak1&2Mut)野生型YTHDF1沒有反應過度(7和8)圖5 h,面板,建議第二m6A峰FZD7 YTHDF1的主要網站的監管。同樣,m6a結合能力的喪失完全消除了YTHDF1促進FZD7 mRNA翻譯的作用(圖5H,圖9 12)。這些結果表明YTHDF1介導的FZD7的翻譯控制依賴于m6A修飾。代謝課題國家自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗