5）缺氧主要通過FOXO3A轉錄抑制LINC00926的表達，***PGK1的表達
由于缺氧是**的一個關鍵現象，我們確定了LINC00926/PGK1軸是否在缺氧下糖酵解的調節中發揮作用。缺氧刺激了PGK1在mRNA和蛋白水平上的表達，并降低了LINC00926的表達(圖5A)。為了確定缺氧如何抑制乳腺*細胞中LINC00926的表達，我們研究了缺氧后對LINC00926啟動子的抑制。對不同的LINC00926啟動子缺失報告基因的分析顯示，啟動子區域在300-200bp之間包含一個缺氧抑制元件(圖5B)。該區域假定的FOXO3A結合位點的突變會導致抑制的喪失。在常氧或缺氧條件下，FOXO3A影響LINC00926和PGK1的表達，說明FOXO3A是LINC00926調控的特異性轉錄因子(圖5C和5D)。ChIP分析表明，在常氧條件下，FOXO3A被募集到LINC00926啟動子內包含FOXO3A結合位點的區域，但沒有被募集到LINC00926啟動子上游的區域，在缺氧條件下募集減少(圖5E)。FOXO3A提高了LINC00926水平，降低了PGK1水平，而且重要的是，在正常或缺氧條件下，下調LINC00926均嚴重損害了FOXO3A調節LINC00926和PGK1表達的能力(圖5F)。此外，敲除LINC00926還**削弱了缺氧對PGK1上調的影響。這些數據表明，缺氧主要通過FOXO3A轉錄抑制LINC00926的表達，***PGK1的表達。 circNDUFB2敲低可降低細胞培養上清液中這些細胞因子的水平。推廣標書地區科學基金
轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。單細胞核測序，能夠獲得組織的細胞圖譜，解決細胞異質性的問題。單細胞或細胞核RNA測序(scRNA-seq或snRNAseq)促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類和小鼠腎臟的多個scRNAseq圖譜已經確定了轉錄如何有助于細胞類型的特異性。**近的方法已經將這種方法擴展到單細胞染色質可及性分析。單核染色質轉置可及性測序試驗(snATACseq)是ATAC-seq的擴展，該試劑盒利用Tn5轉置酶在數千個單個細胞中測量染色質可及性。推廣標書省自然科學基金為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對PCOS大鼠的有益作用.
***是心肌梗死、缺血性中風和外周動脈疾病(PAD)的主要潛在原因，是世界范圍內的主要死亡原因。***是一種慢性炎癥性疾病，優先發生在暴露于紊亂血流(d-flow)的動脈區域，而暴露于穩定血流(s-flow)的動脈區域則受到保護。血流被內皮細胞(ECs)中的機械傳感器識別，進而***信號通路，導致基因表達、內皮功能和***通路的調控。D-flow誘導ec中重要的原***通路，包括內皮炎癥和功能障礙、滲透性功能障礙、血栓形成和內皮-間充質轉化(EndMT)。相反，s-flow保護ec免受這些原***途徑的影響。
2021年，來自加拿大多倫多大學和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學等團隊合作在Naturecommunication雜志上發表了文章“BiologicalandtherapeuticimplicationsofauniquesubtypeofNPM1mutatedAML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質性。基于rna-seq的基因表達譜分析，確定了兩種新亞型，稱為原始型和committed型。基于基因表達、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異，在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態和患者生存聯系起來。此外，表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學上的異質性疾病，其特征是克隆擴增和突變的造血干細胞和祖細胞分化受損。在AML**常見的驅動突變中，NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩定的，在20%-30%的病例中發生。由于其生物學意義和預后影響，NPM1突變在世界衛生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個獨特的白血病實體，并在預后和***決策中發揮重要作用。E2F1是一種有效的轉錄調控因子.
結果1）LINC00926被篩選為PGK1負調控的lncRNA，與乳腺*臨床結果相關
為了探索負調控PGK1的lncRNAs，我們根據圖1A所示的篩選策略對乳腺*的三個數據庫進行了分析。我們鑒定了3個lncRNA，LINC00926，LINC01089和LINC00324與PGK1呈負相關，且表現出良好的臨床結果(圖1B-1D)。為了研究鑒定出的lncRNAs是否下調了PGK1的表達，我們分別用這三個lncRNAs分別轉染了乳腺*細胞。我們的結果表明，在mRNA水平不變的情況下，只有LINC00926導致MCF-7和MDA-MB-231細胞中PGK1蛋白水平***下降(圖1E)，表明LINC00926下調了乳腺*細胞中PGK1的表達。此外，與非**組相比，13/14(92.9%)例乳腺*患者的LINC00926表達降低，12/14(85.7%)例乳腺*患者的PGK1表達上調。在乳腺*樣本中，LINC00926的表達與PGK1的表達呈負相關(圖1F)。 WB結果顯示結腸中炎癥分子的相對表達似乎低于脊髓中的。項目標書中標率高
circSDHC是一個很有前景的RCC患者潛在的預后生物標志物和***靶點。推廣標書地區科學基金
我們鑒定出了幾個可能與LINC00926相互作用的蛋白，包括兩個E3連接酶，STUB1和E6AP(圖4F)。免疫印跡進一步證實，只有STUB1與LINC00926相互作用，而E6AP則沒有(圖4G)。此外，RIP分析也表明，PGK1和STUB1免疫沉淀中，LINC00926***富集(圖4H)。此外，LINC00926增強了STUB1介導的PGK1泛素化(圖4I)。敲低STUB1**減弱了LINC00926對PGK1泛素化的影響(圖4J)。這些數據表明，STUB1在LINC00926調控PGK1泛素化過程中起著關鍵作用。與LINC00926對STUB1介導的PGK1泛素化的影響一致，LINC00926增加了STUB1和PGK1之間的相互作用(圖4K)。而敲低STUB1**減弱了LINC00926對PGK1降解的影響(圖4L)。推廣標書地區科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
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7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗