此外，MYC在BC組織中高表達(dá)，并與 FUBP1的表達(dá)呈正相關(guān)。為了確認(rèn)ACTN4在BC中的生物學(xué)功能，構(gòu)建了ACTN4過(guò)表達(dá)和干擾質(zhì)粒，為了探究 circACTN4 的作用與 ACTN4 無(wú)關(guān)，進(jìn)行了共轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)，結(jié)果表明 ACTN4 敲低不影響促進(jìn)作用circACTN4 對(duì) MYC 轉(zhuǎn)錄的過(guò)度表達(dá)，ACTN4 的上調(diào)并沒(méi)有逆轉(zhuǎn) qRT-PCR 和蛋白質(zhì)印跡對(duì) circACTN4 敲低對(duì) MYC 表達(dá)的抑制作用。WB結(jié)果表明circACTN4可以促進(jìn)MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2的表達(dá)。這些數(shù)據(jù)表明 circACTN4 可以與 FUBP1 結(jié)合并促進(jìn) MYC 的表達(dá)。提供生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的課題思路設(shè)計(jì)。深圳課題整包服務(wù)
6、外泌體miR-138-5p促進(jìn)乳腺*肺轉(zhuǎn)移
極化的巨噬細(xì)胞在決定**細(xì)胞的表型中起著重要的作用。因此，探究M2巨噬細(xì)胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺*小鼠異**模型的**轉(zhuǎn)移。使用氯膦酸鈉***小鼠巨噬細(xì)胞，然后轉(zhuǎn)移使用過(guò)表達(dá)miR-138-5p的T47D或T47D細(xì)胞來(lái)源的外泌體處理的Raw264.7細(xì)胞。小鼠模型通過(guò)尾靜脈注射4T1-熒光素酶細(xì)胞構(gòu)建（圖6A）。結(jié)果顯示，外泌體miR-138-5p處理組***促進(jìn)小鼠體內(nèi)乳腺*細(xì)胞的**體積和肺轉(zhuǎn)移，同時(shí)增加了CD206和Arg-1陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)（圖6B-E）。這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p誘導(dǎo)的M2巨噬細(xì)胞促進(jìn)乳腺*的肺轉(zhuǎn)移。 大連課題分子生物學(xué)課題外包服務(wù)找英拜放心安心。
核仁小RNA(snoRNAs)是一類(lèi)***存在于真核生物細(xì)胞核仁的小分子非編碼RNA，長(zhǎng)度60-300nt，能與核仁核糖**白結(jié)合形成snoRNPs復(fù)合物[1]。在脊椎動(dòng)物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過(guò)進(jìn)一步的轉(zhuǎn)錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA[2]。具有保守的結(jié)構(gòu)元件，按結(jié)構(gòu)可以分為三類(lèi)：boxC/DsnoRNA、boxH/ACAsnoRNA和MRPRNA（研究較少）。在核糖體RNA的加工過(guò)程中，前兩類(lèi)snoRNAs分別發(fā)揮兩種修飾作用：核糖體RNA的2-O–甲基化和假尿嘧啶化[3]。絕大多數(shù)snoRNA的宿主基因編碼的蛋白或者轉(zhuǎn)錄本為核糖體的生物合成與功能所必須，且作為5′末端寡嘧啶家族參與生長(zhǎng)依賴(lài)的翻譯調(diào)控。snoRNAs參與的生物學(xué)過(guò)程主要有rRNA的加工處理，RNA剪接和翻譯過(guò)程的調(diào)控以及氧化應(yīng)激反應(yīng)[4]。由于snoRNA被認(rèn)為主要存在于核仁**能單一，之后的很長(zhǎng)一段時(shí)間，snoRNA的研究陷入低潮。然而，近幾年，隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，越來(lái)越多的數(shù)據(jù)表明snoRNA在**中被異常調(diào)控，還參與到遺傳性疾病、造血、代謝以及**的過(guò)程中。
在TYRO3-OE 4T1**細(xì)胞中，阻斷鐵死亡的基因上調(diào)（Slc40a1、Slc7a11、Slc3a2、Gpx4、Fth1和Blvrb），而增強(qiáng)鐵死亡的基因下調(diào)（Slc5a1、Tfrc）。在接受抗PD-1***的黑色素瘤患者中，阻止脂質(zhì)過(guò)氧化和鐵死亡的分子SLC3A2與TYRO3***共表達(dá)。抗PD-1***后，Tyro3-OE CD45-**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS水平低于4T1-P CD45-**細(xì)胞，而加入抗PD-1***增加4T1-P**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS，但不增加Tyro3-OE**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS，表明Tyro3抑制抗PD-1誘導(dǎo)的**細(xì)胞鐵死亡。在體外用鐵死亡誘導(dǎo)劑erastin和鐵死亡抑制劑ferrostatin 1(Fer-1)處理4T1-P和Tyro3-OE 4T1細(xì)胞。與親代細(xì)胞相比，Tyro3過(guò)表達(dá)抑制了鐵死亡誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡。當(dāng)Fer-1阻斷鐵死亡時(shí)，Tyro3過(guò)表達(dá)抑制誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)的脂質(zhì)ROS。Tyro3缺失增加了誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡和脂質(zhì)過(guò)氧化，F(xiàn)er-1消除了這些作用。這些結(jié)果表明TYRO3對(duì)于保護(hù)**細(xì)胞免受鐵死亡至關(guān)重要。按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤(rùn)色。
TCGA泛*中的m6A概況
為了表征m6A模式和篩選潛在靶點(diǎn)，在TCGA中的9804個(gè)泛*樣本中開(kāi)發(fā)了一個(gè)四步計(jì)算框架。經(jīng)過(guò)質(zhì)量控制后，共有23個(gè)m6A調(diào)節(jié)因子、56個(gè)m6A交互蛋白編碼基因、10個(gè)lncRNAs和17個(gè)miRNAs被納入本研究。106個(gè)基因有密切的共表達(dá)關(guān)系（Pearsonr>0.3）。在共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中，大多數(shù)m6A調(diào)節(jié)因子和一些蛋白質(zhì)編碼基因是與其他基因相互作用的樞紐基因。在不同**類(lèi)型*旁組織的差異表達(dá)比較中，許多基因在**組織中的表達(dá)水平較高，而一些蛋白質(zhì)編碼基因則表現(xiàn)出相反的關(guān)系。這些基因包括ASB2、P2RX6、AXL、ID2和SOCS2；miR-143、miR-29a、miR-125b-1和miR-145等4種miRNA在**組織中表達(dá)較低。所有l(wèi)ncRNAs在**組織中均有較高的表達(dá)。利用**和正常組織的前兩個(gè)主成分（PC），我們發(fā)現(xiàn)m6A模式具有良好的鑒別診斷價(jià)值。曲線下面積（AUC）在大多數(shù)**中超過(guò)90%。 TIMEOR是***個(gè)基于 Web 的自適應(yīng)時(shí)間序列多組學(xué)管道方法。細(xì)胞功能課題產(chǎn)學(xué)研合作
使用motif和CHIP-seq預(yù)測(cè)影響基因簇表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。深圳課題整包服務(wù)
1）SsD在AML中表現(xiàn)出抗增殖活性
為了闡明SsD在白血病中的藥理作用，我們?cè)?0個(gè)人白血病細(xì)胞系中探討了一系列SsD濃度的影響。我們發(fā)現(xiàn)SsD在大多數(shù)白血病細(xì)胞系中以劑量依賴(lài)的方式抑制細(xì)胞活力(圖1A)。為了進(jìn)一步研究SsD對(duì)白血病的抑制作用，我們?cè)?種白血病細(xì)胞系NB4、kas1、MV4-11和U937(SsD敏感性排名前4位的細(xì)胞)進(jìn)行了集落實(shí)驗(yàn)。與細(xì)胞活力結(jié)果相似，SsD***抑制了所測(cè)細(xì)胞系的集落數(shù)量和大小(圖1B-E)。有趣的是，SsD對(duì)細(xì)胞增殖和活力的抑制可能是由于細(xì)胞周期阻滯在G1期和NB4細(xì)胞凋亡增加(圖1F-G)。 深圳課題整包服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶(hù)可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專(zhuān)題，外泌體研究專(zhuān)題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng)：提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě)，標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)