湖北科研技術指導

來源: 發布時間:2021-11-09

為了驗證tRFs&tiRNA-Seq數據,作者檢測了91對PTC組織和*旁組織中tRFs&tiRNA的表達,其中,tiRNA-Gly在人類PTC組織中的表達水平比較高,并***高于*旁組織(圖1F-G)。WB顯示,tiRNA-Gly在PTC**中蛋白表達***高于*旁,但是tRNA-Gly的表達在*和*旁中無***差異(圖1H)。總之,tiRNA-Gly可能在PTC的進展中起致*作用。

在小鼠模型中,tiRNA-Gly調節PTC細胞的增殖和遷移,并影響**生長

首先檢測了tiRNA-Gly在3株PTC細胞系中的表達,如圖2A所示,K1細胞系中tiRNA-Gly的表達***低于BC***和TPC-1細胞系。因此,對于功能獲得性實驗,合成帶有5’磷酸末端的tiRNA-Gly轉染至K1細胞系(圖2B)。結果發現,與對照組相比,tiRNA-Gly***促進K1細胞的增殖和遷移(圖2C-D)。對于功能缺失實驗,在BC***和TPC-1細胞系中轉染siRNA干擾tiRNA-Gly的表達,結果顯示細胞的增殖和遷移都***下降(圖2E-G)。體內實驗得出了類似的結果,干擾tiRNA-Gly表達導致**體積減小,Ki67表達下降。總之,體內體外實驗都表明tiRNA-Gly是PTC的惡性因子。 細菌可能是導致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。湖北科研技術指導

表達MCF-10A腺泡的Myc-INPP4BWT而不是Myc-INPP4BC842A(PI(3,4)P24-磷酸酶死亡)的腺泡(補充圖2k)顯示增殖細胞的百分比明顯高于病媒控制的腺泡(1.5倍)(圖2i,j)。在第7天,腺泡的大小沒有明顯變化(圖2k)。第14天,Myc-INPP4BWT而不是MycINPP4BC842A表達MCF-10A的細胞形成了更大的腺泡(1.8倍),每個腺泡的細胞數量比載體對照增加了1.4倍(圖2ln)。過表達INPP4B促進MCF-10A細胞增殖,但不影響細胞的尖基底極性和細胞凋亡。與此一致的是,過表達Myc-INPP4BWT而不是Myc-INPP4BC842A在血清剝奪后的單層培養中增強了MCF-10A細胞的增殖(1.7倍)(圖2o,p)。

總之,這一數據與INPP4B以PI(3,4)P2-磷酸酶依賴的方式促進pik3a突變體ER+乳腺*和pik3a野生型乳腺上皮細胞增殖的解釋相一致。 湖南科研動物模型構建2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法。

APCmRNA上的METTL3依賴性m6A上調抑制APC表達

為了確定METTL3依賴的m6A調控對APC表達的影響,構建了一個熒光素酶報告基因,熒光素酶分析顯示,METTL3缺失**增加了WTAPC的熒光素酶活性,而突變的APC提高了熒光素酶活性并使該活性抵抗METTL3缺失的調節。相反,METTL3過表達抑制了WT-APC的熒光素酶活性,但沒有突變的APC。這些結果表明METTL3介導的m6A水平的APCmRNA上調抑制了APC的表達。

與這一發現一致,METTL3缺失增加了APCmRNA和蛋白質表達(,并且這些增加被KYSE450細胞中rMETTL3的重組表達所消除。此外,METTL3的過表達降低了KYSE450細胞中APC的表達,四環素劑量依賴性增加的METTL3表達水平與APC水平呈負相關。相反,METTL3非活性突變體與WT對應物不同,未能調節APC表達。值得注意的是,ESCC細胞中的METTL14缺失消除了METTL3的過度表達降低了APC的表達。這些結果表明,在ESCC細胞中,METTL3與METTL14共同介導的APCmRNAm6A上調抑制了APCmRNA和蛋白的表達。

METTL3增強APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結合抑制APC表達YTHDF1-3介導mRNA降解,針對YTHDF1的抗體進行RIP分析,實時定量PCR分析顯示,在KYSE180中,與APCmRNA結合的YTHDF2的數量遠遠多于YTHDF1和YTHDF3的數量,并且由于METTL3缺失而減少。這些結果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,在很大程度上促進了YTHDF2與APCmRNA的結合。為了研究YTHDF2與APCmRNA結合在APC表達中的作用,我們去除了YTHDF2,這增加了KYSE450細胞中APC的mRNA(圖5d和補充圖5e)和蛋白質表達。YTHDF1–3的聯合缺失進一步增加了這些細胞中APC的mRNA和蛋白質表達。此外,還進行了熒光素酶報告子分析,結果表明,缺失YTHDF2增強了由含m6A的WTAPCCDS序列驅動的熒光素酶活性,而突變的APC增強了熒光素酶活性,并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調節。此外,METTL3過表達抑制由WTAPCCDS序列驅動的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復,其不影響突變的APC增強的熒光素酶活性。這些結果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,隨后的YTHDF結合抑制了APC的表達。巨噬細胞表型協調急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復再生。

1.FBW7促進胰腺*細胞脂質過氧化作者以分析在SW1990轉染pCMV-FBW7或空載體(GEO:accessionnumbersGSE76443)的高通量基因表達譜陣列研究FBW7在胰腺*中的作用。以谷胱甘肽代謝和脂肪酸代謝相關的氨基酸為重點,結果顯示,FBW7WT和FBW7T205A下調絲氨酸、蛋氨酸、甘氨酸和胱氨酸,而FBW7R465H對絲氨酸、蛋氨酸、甘氨酸和胱氨酸無影響。這些氨基酸可被催化生成谷胱甘肽。作者檢測了PANC-1和SW1990穩定細胞系異位表達空載體FBW7WT或FBW7T205A的GSH/GSSG比值,結果發現FBW7WT和FBW7T205A導致GSH/GSSG比值增加。接著采用BODIPY581/591C11探針檢測氧化性脂質,并通過流式細胞術和共聚焦顯微鏡進一步分析發現當脂質過氧化發生時,熒光由紅色變為綠色,顯示FBW7WT和FBW7T205A導致脂質過氧化水平升高。這些結果表明FBW7WT和FBW7T205A促進胰腺*細胞的ROS和脂質過氧化。大黃酸可以改變腸道菌群組成。基礎醫學科研創新服務

鑒定的前列腺瘤細胞內源性雄***受體網絡。湖北科研技術指導

轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。單細胞核測序,能夠獲得組織的細胞圖譜,解決細胞異質性的問題。單細胞或細胞核RNA測序(scRNA-seq或snRNAseq)促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類和小鼠腎臟的多個scRNAseq圖譜已經確定了轉錄如何有助于細胞類型的特異性。**近的方法已經將這種方法擴展到單細胞染色質可及性分析。單核染色質轉置可及性測序試驗(snATACseq)是ATAC-seq的擴展,該試劑盒利用Tn5轉置酶在數千個單個細胞中測量染色質可及性。湖北科研技術指導

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