3)IGF-1信號在Pex誘導的HSC活化和肝纖維化中至關重要
為了進一步探索Pex調控HSC行為的機制,我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測序基因表達譜(圖3A)。在差異表達基因中,我們觀察到41個重疊的上調基因在Pan02exo組與Npex組和KPCexo組與Npex組之間存在部分交集(圖3B)。主要涉及的基因參與細胞外空間、細胞外區域和ECM(圖3C),表明Pex調節HSC的ECM分泌。此外,GO和KEGG通路分析顯示,IGF-1及其下游PI3K/AKT是受Pex影響的排名比較高的信號通路(圖3D,E)。westernblot分析支持了Pex***增加HSC中IGF-1R、IRS-1和AKT磷酸化的發現(圖3F)。當使用IGF-1R抑制劑時,Pex誘導的p-IGF-1R、p-IRS-1和p-AKT的上調被阻斷(圖3G)。基于這些結果,我們推測IGF-1信號可能是介導Pex依賴的HSC活化的關鍵因素。與預期的一樣,IGF-1R抑制劑抑制了Pex誘導的HSC的活化、增殖和遷移(圖4A-D)。此外,IGF-1R抑制劑逆轉了Pex誘導的HSC中ECM的產生(圖4E)。我們的體內實驗表明,IGF-1R抑制劑可以阻斷Pex誘導的肝纖維化(圖4F-I)。這些數據表明IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。 總體生存率低與m6A水平增高***相關。焦亡生物相關科研地區科學基金
5.沉默lnc-PMIF促進老年OPCs向骨形成表面遷移,促進老年小鼠骨形成
BMSCs中沉默lnc-PMIF,增殖無變化,OPCs成骨能力不改變,細胞遷移數量高,表明沉默lnc-PMIF可增強老年OPCs的遷移能力,而不干擾老年OPCs的體外增殖和成骨分化。接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠中骨形成表面Dil+細胞數***升高,提示沉默lnc-PMIF可促進老年OPCs在體內向骨形成表面遷移,大部分遷移的Dil+細胞中檢測到Runx2表達,表明si-PMIF處理的老年BMSCs遷移到骨形成表面發生正常的成骨分化,這將有助于小鼠的骨形成。接受si-PMIF處理的老年BMSCs小鼠骨表面TGF-β+細胞的平均積分光密度***更高,而TRAP+面積無***差異,表明si-PMIF處理的老化BMSCs可能影響細胞募集,而不是骨吸收。上述si-PMIF或si-NC處理的老年BMSCs對老年雄性小鼠進行脛骨內注射,4周后接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠骨量更高,脛骨干骺端微結構更好,BMD和BV/TV更高,MAR和BFR/BS更高。這些結果證明,老年BMSCs敲低lnc-PMIF可促進骨形成。 焦亡生物相關科研地區科學基金上海英拜生物有經驗豐富的科研團隊。
MIR210HG與子宮內膜*患者的低生存率相關為了識別子宮內膜*組中異常表達的lncRNA,我們分析了來自TCGA的數據。表達陣列分析顯示332個lncRNA的表達差異有統計學意義。7個lncRNA表達上調(圖1A和1B)。然后,我們分析了GEO數據集,發現在子宮內膜*GSE17025隊列中MIR210HG的表達也上調(圖1C)。qPCR顯示MIR210HG在子宮內膜*中的表達明顯高于正常子宮內膜組織(圖1D)。此外,我們分析了MIR210HG的表達與子宮內膜*患者臨床病理參數的關系,發現MIR210HG在從I、II期到III、IV期的進展過程中增加。MIR210HG的表達與淋巴結轉移***相關(圖1E)。原位雜交實驗結果顯示,MIR210HG在子宮內膜*中的表達水平高于正常子宮內膜組織(圖1F)。MIR210HG高表達的子宮內膜*患者生存率較低(圖1G)。
同樣,Transwell實驗(圖5h)也證明了**細胞的遷移能力。綜上所述,circMAPK1在沒有其編碼蛋白MAPK1-109aa的情況下,不能抑制GC細胞的惡性表型。隨后,為了進一步驗證MAPK1-109aa的功能,我們在SGC7901和MGC803細胞中恢復了MAPK1-109aa的表達,無論是否穩定敲除circMAPK1,Western blot驗證了這一點(圖6a)。將MAPK1-109aa質粒轉染到SGC7901和MGC803細胞株后,細胞的增殖能力(圖6b-g)和遷移能力(圖6h)得到了有效的抑制。在轉染了shcirMAPK1的細胞系中,恢復了MAPK1-109aa的表達也逆轉了穩定敲除circMAPK1所導致的惡性表型。綜上所述,上述結果表明circMAPK1對GC細胞惡性生物學行為的抑制作用依賴于其編碼蛋白MAPK1-109aa。英拜生物提供生物科學內的專業的技術咨詢,技術合作。
4)SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導m6A修飾
為了檢測m6A在RNA上的變化,我們在SsD處理的白血病細胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示,SsD***增加了m6A在轉錄組中的豐度。此外,HPLC-MS/MS定量證實了SsD處理的NB4和Kas-1細胞mRNA中細胞m6A的增加(圖4B)。接下來,我們檢測了FTO的兩個直接靶點MYC和RARA在SsD處理的細胞中的表達。SsD在mRNA和蛋白水平***下調了NB4和Kas-1細胞的MYC,而上調了RARA(圖4C-D)。有趣的是,SsD依賴的MYC和RARA的減少是由于FTO過表達細胞中mRNA和蛋白穩定性的降低(圖4E-4H)。綜上所述,這些結果證明了FTO及其下游靶點(如MYC,RARA)是FTO過表達白血病細胞中SsD的主要效應因子。 上海英拜生物設有專業的武漢技術中心。北京科研贈送提供技術路線
英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區浦江園區。焦亡生物相關科研地區科學基金
4)APP/PS1小鼠大腦皮質區受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高
我們研究了NOX4來源的氧化應激在APP/PS1小鼠受損星形膠質細胞中的作用。我們用免疫熒光染色法測定了APP/PS1小鼠和野生型(WT)小鼠大腦皮層GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE的蛋白水平(圖4A)。免疫熒光染色顯示,與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠皮質區GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度增加(圖4A、C)。APP/PS1小鼠皮質區受損的GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度升高。此外,與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠中4-HNE和GFAP亞細胞共定位呈陽性的受損星形膠質細胞數量***增加(圖4D)。與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠皮質區GFAP陽性星形膠質細胞(圖4B和E)和MDA與GFAP亞細胞共定位陽性的受損星形膠質細胞(圖4F)數量增加。4-HNE在APP/PS1小鼠NOX4陽性星形膠質細胞***定位(圖4G)。此外,APP/PS1小鼠NOX4和4-HNE陽性星形膠質細胞數量***增加(圖4H)。這些結果提示APP/PS1受損小鼠星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高。 焦亡生物相關科研地區科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗