1)Pex誘導肝纖維化微環(huán)境,促進PDAC肝轉移
從小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結構,大小約為50-150nm(圖1A,B)。進一步的westernblot分析證實了分離的外泌體的存在(圖1C)。為了確定Pex在PDAC肝轉移中的作用,我們首先進行了“教育”程序,并進一步通過脾內(nèi)注射建立了PDAC肝轉移模型(圖1D)。在“教育”過程后,STE和原子力顯微鏡(AFM)顯示,與Npex組相比,Pex組小鼠的肝臟剛度***增加(圖1E,F(xiàn))。此外,肝組織膠原密度增加(圖1G),肝ECM明顯重構(圖1H,I)。同樣,PDAC原位植入模型也顯示原位**可增加肝臟膠原沉積。肝轉移模型顯示,與Npex組相比,Pex組肝轉移更多,肝質量更高(圖1J)。這些數(shù)據(jù)表明,Pex可以通過重構肝臟ECM來誘導肝纖維化微環(huán)境,促進PDAC肝轉移。 英拜生物您隨身的科研小助手。成都腸道屏障科研
蛋白質生物標志物
MarkerDB中142個蛋白質生物標志物覆蓋了160多種疾病。MarkerDB中的所有蛋白質生物標記物數(shù)據(jù)都是從OncoMX、CBD和UPBD原始文獻中提取的,結構數(shù)據(jù)從蛋白質數(shù)據(jù)庫PDB收集。目前,MarkerDB中的所有蛋白質標記都有一個或多個疾病關聯(lián),以及MarkerDB ID、序列、結構、詳細的蛋白質描述、蛋白質名稱/同義詞、蛋白質理化數(shù)據(jù)、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍,生物流體、一個或多個文獻參考和其他在線數(shù)據(jù)庫的外部超鏈接。
代謝組學科研推薦咨詢結腸炎也會導致促炎細胞因子或趨化因子的增加。
LncExpDB提供101293個人類lncRNA基因(對應于331244個轉錄本)***且高質量的**。它包含了這些lncRNA在337個生物學條件下的豐富表達譜,這些條件屬于九個重要的生物學背景,涉及正常組織/細胞系、*細胞系、亞細胞定位、外泌體、細胞分化、植入前胚胎、***發(fā)育、晝夜節(jié)律和病毒***.此外,LncExpDB識別了25191個特征lncRNA基因,并表征了24508個lncRNA基因和17345個mRNA基因之間的28443865個共表達相互作用。
基于跨多個生物環(huán)境的綜合表達譜,LncExpDB具有增值管理和分析功能,可提供可靠轉錄的lncRNA基因。因此,我們發(fā)現(xiàn)92016個lncRNA基因(90.8%)得到可靠轉錄證據(jù)的支持(表達值閾值為1TPM),在九個生物學背景中分布不均。在可靠轉錄的基因中,大多數(shù)(82.6%)在至少兩種生物環(huán)境中表達,3318個lncRNAs(3.6%)在所有9種環(huán)境中表達。
2)M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細胞的EndoMT
我們評估了M1-BMDMs對bEnd.3細胞的影響。結果表明,M1-BMDMs條件培養(yǎng)基(M1-CM)***降低了bEnd.3細胞TEER值(圖2A),并增加通透性(圖2B)。此外,TJs蛋白熒光染色顯示,M1-CM處理***降低了bEnd.3細胞膜ZO-1和Occludin的表達(圖2C和D)。為了進一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內(nèi)皮細胞的TJs,我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預處理M1-BMDMs。我們發(fā)現(xiàn),加入GW4869部分逆轉了M1-CM誘導的TEER值的下降(圖2A),滲透率增加(圖2B);GW4869也逆轉了TJs蛋白熒光強度下降的趨勢(圖2C和D)。相應的,TJs蛋白表達水平也出現(xiàn)了類似的結果(圖2E)。有趣的是,通過對脊髓切片中的α-SMA和CD31進行共染色,我們發(fā)現(xiàn)損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細胞形態(tài),分枝減少,胞體拉長(圖2H)。此外,M1-CM暴露***降低了CD31的表達,并強烈增強了EndoMT標記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細胞中的表達(圖2I)。然而,GW4869可以部分扭轉這些影響。綜上所述,外泌體可能介導巨噬細胞和血管內(nèi)皮細胞之間的相互作用,并可能是巨噬細胞誘導血管內(nèi)皮細胞EndoMT的原因。 英拜跟客戶形成產(chǎn)學研合作模式。
NF-κB信號的組成性***在結直腸*(CRC)的發(fā)***展中起著關鍵作用。然而,NF-κB信號通路過度***的潛在機制在很大程度上尚不清楚。circPLCE1編碼的一種新蛋白circPLCE1-411被鑒定為NF-κB***的關鍵蛋白。機制上,circPLCE1-411通過直接結合HSP90α/RPS3復合物促進RPS3從復合物中分離,促進了關鍵NF-κB調節(jié)因子RPS3的泛素依賴性降解,從而減少了CRC細胞中NF-κB核轉位。在功能上,circPLCE1抑制CRC細胞中的**增殖和轉移,以及患者來源的異種移植瘤和原位異種移植瘤模型。臨床上,circPLCE1在CRC組織中下調,并與晚期臨床階段和低生存率相關。本文于2021年8月發(fā)表在Molecular Cancer(IF=27.401)期刊上。上海英拜生物的動物建模實驗。推薦科研分子生物學實驗
大黃酸可以改變腸道菌群組成。成都腸道屏障科研
作者構建了 (WT) SLC7A113’-UTR和突變型(Mut) 3’-UTR兩種質粒(圖6H)。結果表明,只有過表達YTHDC2WT降低SLC7A11 mRNA在H1299細胞中的穩(wěn)定性,敲除YTHDC2可以提高SLC7A11 mRNA在H1975細胞中的穩(wěn)定性。然而,與WT 3’-UTR相比,Mut報告基因的這些作用減弱(圖6I和J)。在檢測外源性F-Luc-SLC7A11融合mRNA的RNA穩(wěn)定性后,得到了類似的結果(圖6K-M)。總的來說,3’-UTR上的m6A位點對于YTHDC2使SLC7A11 mRNA不穩(wěn)定至關重要。
7.抑制YTHDC2對XC-系統(tǒng)靶向***敏感,并與LUAD進展相關
為了評估YTHDC2抑制在LUAD中的重要性,從cohort#1隨機抽取20例YTHDC2lowLUAD,其中50%屬于腺泡型(圖7A)。在cohort#2中,與相鄰組織相比,**中YTHDC2表達下調,62%(62/100)的腺泡組織被歸類為YTHDC2low(圖7B、C)。與無這種表達模式的腺泡性LUAD患者相比,YTHDC2low的患者總生存期要短得多(圖7D),進一步表明YTHDC2抑制可能對腺泡性LUAD的**進展尤為重要。另外,相對于*旁組織,**中腺泡LUAD組織中SLC7A11mRNA和蛋白水平表達量都比較高(圖7E、F)。 成都腸道屏障科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗