上皮間充質轉化科研國家自然科學基金

來源: 發布時間:2021-11-12

6、IFNα暴露增加CD8+T細胞的NAD+的消耗

為了了解慢性I型IFN與CD8+T細胞下游線粒體和代謝變化之間的機制聯系,首先在SLE患者CD8+T細胞的轉錄組學數據中探索了哪些通路與I型IFN信號相關。結果顯示煙酸/煙酰胺代謝途徑顯示出比較高的相關性(圖6a),并且在IFN-highSLE患者的CD8+T細胞中,NAD消耗酶,如ADP-核糖聚合酶(PARP9、PARP10和PARP12)和CD3828***上調(圖6b)。觀察到延長IFNα和TCR刺激后CD8+T細胞中NAD+/NADH比值***降低(圖6d),該實驗條件模擬了在IFN-high的SLE患者CD8+T細胞中觀察到的線粒體和代謝異常,表明在活化的CD8+T細胞中,I型IFN信號引起的NAD消耗酶表達上調可導致NAD+耗竭和隨后的線粒體功能障礙。 嘌呤在細胞中執行許多重要的功能。上皮間充質轉化科研國家自然科學基金

轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。單細胞核測序,能夠獲得組織的細胞圖譜,解決細胞異質性的問題。單細胞或細胞核RNA測序(scRNA-seq或snRNAseq)促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類和小鼠腎臟的多個scRNAseq圖譜已經確定了轉錄如何有助于細胞類型的特異性。**近的方法已經將這種方法擴展到單細胞染色質可及性分析。單核染色質轉置可及性測序試驗(snATACseq)是ATAC-seq的擴展,該試劑盒利用Tn5轉置酶在數千個單個細胞中測量染色質可及性。上海腸道菌科研英拜生物是國內承接各類高通量測序科研項目以及一站式的測序文章發表服務的公司之一。

為了評估這些CAR-T細胞的功能性記憶能力,在CAR-T細胞轉移后30天用LeY + 卵巢*細胞系OVCAR-3(Fig. 5D)處理小鼠,觀察到與未處理的CAR組相比,預處理的CAR-T細胞在小鼠血液中的擴增***增加(Fig. 5G)。意味著先前接受過CAR-T細胞***的小鼠的**控制***增強(Fig. 5H-I)。值得注意的是,第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+ T細胞的數量呈***負相關(Fig. 5J),表明CDK4/6i處理的CAR-T細胞的持久性增強是驅動**控制的關鍵因素。事實上,**接種后40天,接受預處理的CAR-T細胞的小鼠浸潤CD4+和CD8+ CAR-T細胞的數量***增加(Fig. 5K)。接下來通過將未處理或預處理的抗LeY CAR-T細胞轉移到OVCAR-3荷瘤小鼠體內,檢測了CDK4/6i預處理對CAR-T細胞急性療效的影響。用CDK4/6i預處理CAR-T細胞可***增強其抗**活性(Fig.5L-M)。與此一致,轉移后數周發現接受預處理細胞的小鼠血液中CD4 + 和CD8 + 細胞以及**中CD8 + 細胞數量***增高(Fig.5N-O)。總之,這些數據證明CDK4/6i體外***是增強CAR-T細胞表型和長期療效的穩健策略。

同源異形盒(HOX)基因甲基化PCR芯片研究文獻中已經報道的態參與多細胞生物的發展的22個基因的啟動子甲基化狀態。HOX基因編碼一組包含同源結構域的轉錄因子,**初被描述為發育過程控制節段性模式。HOX基因的異常表達一直在各種類型的**中觀察到。雖然這些HOX基因已經被根據它們在多細胞生物發育中扮演的角色進行分類,它們在細胞系統中的真實功能仍待被發掘。利用這些芯片分析細胞或新鮮組織基因組DNA樣本有助于關聯CpG島甲基化狀態與生物表型。結果還可以提供洞察分化和發育或**形成背后的分子機制和生物學通路。利用這個芯片,通過簡單的限制性內切酶消化和實時定量PCR,就可以研究分析22個不同同源異型盒基因的啟動子甲基化狀態。METTL14的上調可以通過m6A修飾降低PERP水平。

為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調控網絡,我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學數據庫來預測與HMGA2結合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導的HMGA2構建物共轉染HEK293T細胞,共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉染后,23個miRNA轉染細胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中,轉染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時,熒光素酶活性***降低,其中轉染miR-337-3p和miR-137時,熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學數據庫TargetScan預測miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結合的位點。雙熒光素酶基因報告基因檢測結果顯示,miR-337-3p和miR-137在其預測的結合位點上結合HMGA2(圖3H)。qPCR結果顯示,miR-337-3p和miR-137負調控HMGA2的表達(圖3I)。采用Pearson’s秩相關法分析MIR210HG與HMGA2表達的相關性,發現HMGA2的表達與MIR210HG呈正相關(圖3 J和K)。這些結果表明MIR210HG可能參與了新的MIR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2調控網絡。我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。生長因子科研分子生物學實驗

大黃酸可以改變腸道菌群組成。上皮間充質轉化科研國家自然科學基金

6)SsD抑制患者原代細胞

我們從吉林大學***醫院**組織/生物標本庫獲取AML患者外周血,進一步評估SsD對白血病進展的影響。SsD***抑制了白血病細胞增殖(圖6A)、集落形成能力(圖6B)、誘導細胞周期阻滯(圖6C)。在機制上,這是由FTO介導的m6ARNA甲基化及其在SsD處理的原代細胞中的靶點調控的(圖6D-G)。當我們使用“人-鼠”異種移植白血病模型來評估SsD在體內對白血病進展的影響時(圖6H),與上述類似,使用SsD******抑制AML進展,包括降低WBC,減少BM中的白血病母細胞,減少脾腫大,抑制肺轉移,延長AML原代細胞異種移植小鼠的存活時間(圖6I-N)。因此,這些體內研究結果表明SsD具有***FTO介導的AML的潛力。 上皮間充質轉化科研國家自然科學基金

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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