一、Pten398A加速MMTVneu驅動的乳腺**發生
為了研究ATM磷酸化PTEN的體內功能,我們在小鼠中設計了一個敲入等位基因,其中398位絲氨酸取代了丙氨酸(Pten398A)。Pten398A/+和Pten398A/398A小鼠存活,發育明顯正常。為了研究atm依賴的PTEN磷酸化在乳腺*中的可能作用,我們在小鼠乳腺**病毒(MMTV)啟動子/增強子轉錄控制下表達滅活neu (Erbb2)融合基因的小鼠背景下培養了Pten398A等位基因。在這個成熟的模型中,MMTVneu基因在正常乳腺上皮中低水平表達,導致乳腺**的發展,據報道中位發生率為205天。Pten+/+;MMTVneu小鼠發生了預期潛伏期的乳腺**,顯示了233天的中位生存期(圖1A)。相比之下,Pten398A/398A;MMTVneu小鼠**發展加快,中位生存期縮短至199天(圖1A)。對Pten+/+;MMTVneu和Pten398A/398A;MMTVneu小鼠的石蠟包埋**標本進行免疫組化檢測γH2AX。 乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發揮關鍵作用。黃褐斑鼠模型科研服務兩年
腸道菌群與結直腸* (CRC) 之間的關聯已被***研究。然而,用于多個人群的早期診斷標記仍然難以捉摸。本研究對1056例糞便樣本進行了綜合分析,以確定與CRC相關的微生物作為早期檢測CRC的標志物。
對來自4項研究的16srRNA測序進行分析,評估隨著CRC進展(無疾病-腺瘤-結直腸*)腸道微生物的變化,并鑒定出針對腺瘤的為微生物標志物。
2.構建腺瘤微生物模型
除了使用差異ASV作為關鍵指標,模型構建中還包括α多樣性指數(Shannon指數,Simpson指數和ObservedASV)以及三個患者臨床指標(年齡,性別和體重指數(BMI))。**終構建了包括八個差異性ASV(作為生物標記物)以及年齡,性別和BMI為**的模型,可區分對照對象與腺瘤患者(準確度:0.73,敏感性:0.82,特異性:0.62,精度:0.73,F1得分:0.77)。其中,用ASV區分腺瘤和**的RF模型達到了0.89的AUC(精度:0.80,靈敏度:0.66,特異性:0.90,精度:0.83和F1得分:0.72)。 上海陽性染色科研m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。
為了確定s-flow和d-flow在體內單細胞分辨率下對ECs基因轉錄表達和染色質可及性譜的全基因組影響,我們使用小鼠PCL模型進行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結扎,以暴露于血流的對側RCA作為對照,在LCA中誘導d-血流。部分結扎后2天(2D)和2周(2W), rca (2D- r和2W- r)和lca (2D- l和2W- l)用膠原酶酶解獲得單個細胞和單個核,分別用于scRNA-seq和scATAC-seq。
在標準化之后,一個基于無監督圖的聚類將細胞劃分成組,通過統前列形近似和投影(UMAP)圖可視化(圖1A)。我們的UMAP分析確定了16個獨特的細胞簇以流和時間依賴的方式分布(圖1A和1B)。每個細胞簇都是用確定的標記基因進行鑒定(1C).發現8個EC簇(E1E8)、血管平滑肌細胞(SMCs)、成纖維細胞(Fibro)、4個單核/巨噬細胞(macrophages14)、樹突狀細胞(DCs)和T細胞。通過Pecam1、Icam2、Cdh5和Tie1的表達來鑒定EC簇。smc特異性標記為Cnn1、Myl9和Speg。同樣,Medag、Dpep1和Lum作為纖維的標記物;巨噬細胞C1qa,C1qb,C1qc,C5ar1;DCs的Ccr7和Mmp25;T細胞的Itk(圖1C)。
2)M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細胞的EndoMT
我們評估了M1-BMDMs對bEnd.3細胞的影響。結果表明,M1-BMDMs條件培養基(M1-CM)***降低了bEnd.3細胞TEER值(圖2A),并增加通透性(圖2B)。此外,TJs蛋白熒光染色顯示,M1-CM處理***降低了bEnd.3細胞膜ZO-1和Occludin的表達(圖2C和D)。為了進一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內皮細胞的TJs,我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預處理M1-BMDMs。我們發現,加入GW4869部分逆轉了M1-CM誘導的TEER值的下降(圖2A),滲透率增加(圖2B);GW4869也逆轉了TJs蛋白熒光強度下降的趨勢(圖2C和D)。相應的,TJs蛋白表達水平也出現了類似的結果(圖2E)。有趣的是,通過對脊髓切片中的α-SMA和CD31進行共染色,我們發現損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細胞形態,分枝減少,胞體拉長(圖2H)。此外,M1-CM暴露***降低了CD31的表達,并強烈增強了EndoMT標記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細胞中的表達(圖2I)。然而,GW4869可以部分扭轉這些影響。綜上所述,外泌體可能介導巨噬細胞和血管內皮細胞之間的相互作用,并可能是巨噬細胞誘導血管內皮細胞EndoMT的原因。 英拜有一支高精尖的團隊。
胰腺*在美國**死亡原因中排第四名。手術切除是胰腺****的***機會,但由于診斷較晚,大多數患者失去了手術切除的機會,并且,胰腺*對大多數化療藥物的反應很差。FBW7 (F-box and WD repeat domain-containing 7)是Skp1-Cul1-F-box (SCF)泛素連接酶復合物的底物識別成分,以多種*蛋白為降解目標,也是人類**中**常見的突變基因之一,參與調節脂質過氧化。鐵死亡是一種依賴鐵的非凋亡細胞死亡形式,其特征是脂質過氧化,在*****方面表現出巨大的潛力。目前有作者研究了FBW7對胰腺*患者鐵死亡的影響,該研究發表在《Redox Biology》,IF:9.986。上海英拜生物提供可視化實驗過程參觀。神經科研地區科學基金
英拜提供春節回家探親車費補貼。黃褐斑鼠模型科研服務兩年
環狀RNA因參與多種生物的生物進程、涉及多種疾病近年來被***關注,雖然阿爾茨海默病(AD)中CircRNA的差異表達譜已經建立,但在基因表達和疾病相關認知中,與AD直接相關的關鍵CircRNA的特征和功能尚不清楚。本文中,作者篩選并鑒定出AD相關的新CircRNA,CircCwc27,并探索其分子機制。本文于2021年9月發表在《FEBS Journal》上,IF=10.7。
CircCwc27在阿爾茲海默癥(AD)患者中上調表達異常的CircRNA可能直接導致疾病的發生,篩選AD早期相關的CircRNA,作者對6個月的APP/PS1轉基因小鼠和WT對照小鼠的海馬進行了深度CircRNA測序,發現131個表達異常的CircRNA,其中上調,下調*****的15個CircRNA在熱圖中顯示,與野生型小鼠相比,其中有4個***上調和4個***下調的CircRNA在APP/PS1轉基因小鼠的海馬體中表達。接下來對這8種CircRNA在AD患者的血漿和顳葉皮層中的水平進行檢測,并比較了其在海馬體中的相對豐度。結果顯示,在AD患者的顳葉皮層和血漿中可以檢測到CircCwc27表達量較高,與在APP/PS1轉基因小鼠中觀察到的一致,而且CircCwc27在海馬體區表達上升*****。但線性Cwc27在皮層和海馬體中的表達均未發生變化。因此,將CircCwc27在AD中的功能特性作為研究的重點。 黃褐斑鼠模型科研服務兩年
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗