我們進一步的研究表明,circPDE4B調控RIC8A蛋白水平,而不是mRNA水平或穩定性(圖3G-I)。我們還阻斷了RIC8A蛋白的合成,并觀察到sh-陰性對照(NC)和sh-circPDE4B 的HCs之間的RIC8A蛋白半衰期有明顯差異(圖3J),說明circPDE4B降低了RIC8A蛋白的穩定性。經PS341處理后,RIC8A在circPDE4B過表達和下調細胞中均未發生變化(圖3K,L),表明circPDE4B通過蛋白酶體活性調節RIC8A。無論內源性還是外源性RIC8A, RIC8A的多泛素化在circPDE4B耗盡后均下降,在過表達circPDE4B后則上升(圖3O)。綜上所述,circPDE4B翻譯后影響蛋白酶體介導的RIC8A的降解和周轉。促進胰腺*的生長和轉移。湖北通用細胞因子科研
藥物篩選確定**類腸道中HIF-2α的合成易損性
作者構建Apc缺失型(Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/fl)和CRCHIF-2α過表達小鼠模型(Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL),從這2個小鼠模型中分離腸類藥物,并用化療藥物培養,生長被監測了5天。在Cdx2-ERT2Cre;在Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL小鼠中,他莫昔芬可誘導HIF-2α,并特異性地破壞結腸上皮細胞中的Apc。來自Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/fl**腸系膜的小鼠對doxorubicin,mitoxantrone,irinotecan,以及eribulin等藥物高度敏感,與來自Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF2αLSL/LSL的不同。RSL3、sorafenib索拉菲尼、erastin和DMF被認為是***的小分子,可以***降低Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF2αLSL/LSL**腸道類物質的生長。Erastin和RSL3是經典的ferroptosis***劑,分別抑制xCT(由Slc7a11基因編碼,是xC系統的一個組成部分)和GPX4。DMF一種細胞可滲透的線粒體衍生物,在一些**細胞系中具有細胞毒性這些結果表明,HIF-2α表達的**可以被氧化應激***劑選擇性靶向。 染色質科研中標率高評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調節因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達。
METTL3增強APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結合抑制APC表達
YTHDF1-3介導mRNA降解,針對YTHDF1的抗體進行RIP分析,實時定量PCR分析顯示,在KYSE180中,與APCmRNA結合的YTHDF2的數量遠遠多于YTHDF1和YTHDF3的數量,并且由于METTL3缺失而減少。這些結果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,在很大程度上促進了YTHDF2與APCmRNA的結合。
為了研究YTHDF2與APCmRNA結合在APC表達中的作用,我們去除了YTHDF2,這增加了KYSE450細胞中APC的mRNA(圖5d和補充圖5e)和蛋白質表達。YTHDF1–3的聯合缺失進一步增加了這些細胞中APC的mRNA和蛋白質表達。此外,還進行了熒光素酶報告子分析,結果表明,缺失YTHDF2增強了由含m6A的WTAPCCDS序列驅動的熒光素酶活性,而突變的APC增強了熒光素酶活性,并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調節。此外,METTL3過表達抑制由WTAPCCDS序列驅動的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復,其不影響突變的APC增強的熒光素酶活性。這些結果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,隨后的YTHDF結合抑制了APC的表達。
**調節因子通常作為蛋白質復合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉錄調控,例如通過調節組蛋白修飾和染色質結構。哺乳動物BRG1-或brm相關的染色質重塑復合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細胞染色質可及性景觀。該復合物是細胞周期和增殖的關鍵調控因子,也是前列腺*的驅動因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復合物重新靶向于染色質,促進前列腺*的發生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復雜功能的關鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經建立。TF FOXA1可以結合到封閉的染色質區域,調節其染色質可及性,從而促進AR結合染色質引發PCa。METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。
肝miRNA發現者miRNAPCR芯片用于研究肝組織豐富表達或特異性表達的84個miRNA。已注釋的miRNA的數量不斷擴大,重點關注那些特異表達某種細胞系或組織的miRNA變得尤為重要,并非所有的miRNA在每一個組織中都表達。因此,我們通過實驗在人類肝臟樣本池通過miRBaseV18分析已鑒定的miRNA的表達,并將結果與相關文獻進行比較。每一種miRNA可以調節一個或多個信使RNA轉錄,反之一個給定的信使RNA可以由-個或多個miRNA調節。因此,盡管他們很有特點,每個miRNA的復雜作用尚未完全定義。這個芯片比較大化發現與肝組織或肝細胞系生物學表型相關的miRNA。每張芯片含一個對照組使得分析數據時可以用相對定量00CT方法評估逆轉錄效率,基因組DNA污染和PCR效率。利用這張芯片,通過實時定量PCR,可以簡易且可靠地肝中miRNA的表達。大黃酸處理對正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應。抗體芯片科研實驗可參觀
這些數據表明大黃酸***可以改善DSS誘導的結腸炎。湖北通用細胞因子科研
為了確定CDK4 /6i誘導的記憶形成是否通過細胞周期的RB介導的G1期阻滯,用G1阻滯劑處理細胞,胸腺嘧啶,通過阻止DNA合成和進入S期,**于RB的誘導G1阻滯。結果顯示胸腺嘧啶處理的細胞表型復制了CDK4/6抑制,并在很大程度上挽救了Rb1 KO細胞中Tcm的形成(Fig. 3J) ,表明RB介導的G1阻滯本身有助于CDK4 /6i誘導的記憶分化。通過3'RNA-seq進一步分析Rb1 KO細胞,發現記憶相關基因下調和效應標記增加(圖3K-L),CDK4/6抑制后未能逆轉(圖3M-N)。這些結果表明CDK4/6i介導的轉錄重編程和記憶形成是通過RB依賴的G1細胞周期停滯和同時抑制CDK4/6信號轉導。湖北通用細胞因子科研
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗