越來越多的證據表明**相關巨噬細胞（TAMs）和外泌體在轉移前niche（生態位）形成中發揮重要作用。TAMs是轉移前生態位形成和結直腸*肝轉移(CRLM)的基礎。然而，**來源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機制仍然很大程度上未知。本研究發現**來源外泌體miR-934可以誘導巨噬細胞M2極化，進而促進CRC的肝轉移。該文于2020年11月發表在《Journal of Hematology and Oncology》IF：11.059期刊上。
1、miR-934表達升高與CRLM進展及預后不良呈正相關
為了揭示參與CRLM的miRNA，作者基于TCGA數據庫比較了CRC的1期**和4期**的miRNA表達譜，發現miR-934是在4期**中高表達差異表達*****的miRNA（Fig.1a,b）。此外，作者將110個CRC組織按有無肝轉移分為兩組，發現肝轉移組與未轉移組相比，組織和血清miR-934表達上調（Fig.1c,d）。接下來，為了研究miR-934在CRLM進展中的作用，使用ISH比較了miR-934在包含308個CRC樣本的組織芯片(TMA)中的表達，與正常粘膜組織相比，CRC組織中miR-934的表達明顯上調;miR-934表達增加與T分期、M分期、晚期AJCC分期和**復發呈正相關，尤其是在肝轉移的病例中（Fig.1e）。
醫學整體課題外包服務。蛋白組學課題
一、人胎肝和骨髓造血室的單細胞轉錄組
為獲取胚胎發育期間造血細胞的全部譜系，研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對表型確定的血液群體進行單細胞分類，并對15個胚胎的單個細胞進行scRNA-seq檢測（圖1）?；诓町惐磉_分析和標準化表達***性排名前20的標記基因，標注了23個不同的群體，發現在肝臟或股骨中檢測不到任何T細胞或先天淋巴細胞（ILCs），單細胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在大量的轉錄異質性，其中一些表型祖細胞群體（如HSCs，MPPs，CMPs，GMPs，MEPs和CLPs）由10多個不同的轉錄表型定義群體組成，這進一步證明人類臍帶血的祖細胞室具有高度的異質性。此外，該研究分析表明當前使用的細胞表面標記物不能很好地預測人類胚胎造血祖細胞的轉錄狀態。 浙江課題一站式caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。
大約 1% 的人類基因組能夠折疊成 G 四鏈體 (G quadruplexes，G4s)——在富含 G 的基序上形成的非經典鏈特異性 DNA 結構。G4 的熱穩定性不同，這可能會影響它們的功能。然而，G4s 也可能阻礙復制、轉錄和翻譯，并可能增加基因組的不穩定性和突變率。因此，根據其基因組位置、熱穩定性和功能性，G4 基因座可能會在不同的選擇壓力下進化，而這一點從未被研究過。
一、基因組中G4基因座的密度不均勻
與全基因組平均值相比，CpG島、上游區域和轉錄鏈的G4密度的倍數差異特別**別為12.3、4.98和4.11。相比之下，內含子的非轉錄和轉錄鏈、非轉錄外顯子鏈和3'UTR的非轉錄鏈具有G4密度接近全基因組平均值；校正G含量總體趨勢不變，復制起點和增強子具有特別高的G4密度：分別比全基因組平均值高6.88倍和3.03倍。
6.水蘇糖減輕DHEA誘導的多囊卵巢綜合征大鼠卵巢功能障礙
為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對PCOS大鼠的有益作用，DHEA處理的大鼠給予200mg/kg水蘇糖12天。水蘇糖給藥對體重沒有明顯影響(圖8A)，但改善了PCOS大鼠的動情周期紊亂(圖8B)。H&E染色表明，水蘇糖可減少卵巢囊泡數量，增加黃體形成(圖8C-E)。水蘇糖還可***降低PCOS大鼠血清睪酮水平的升高(圖8F)。上述結果提示水蘇糖確實改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙，改善了卵巢組織病理損傷。
綜上所述，Tempol通過降低腸道氧化應激、恢復腸道失調、調節腸道微生物和宿主代謝產物之間的相互作用來保護DHEA誘導的多囊卵巢綜合征(PCOS)(圖9)。這些結果表明Tempol是一種潛在的***多囊卵巢綜合征的策略。 英拜生物對實驗可行性分析。
為了評估表達PTEN-398A且DNA損傷未解決的細胞在輻照(圖2B, C和補充圖4B, C)后的持續存在是否是誘導凋亡反應失敗的結果，我們在IR之前先用泛caspase抑制劑z-VAD-FMK (zVAD)對細胞進行預處理。與DMSO處理相比，zVAD增加了PTEN-WT細胞中未解決的DNA損傷灶的數量，其水平與DMSO處理的PTEN-398A細胞相當(補充圖5F)。然而，需要注意的是，zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數量。
對表達PTEN-WT或PTEN-398A的MCF10A細胞進行了cDNA微陣列分析，并用順鉑誘導基因毒性應激。差異表達基因列表采用基因**富集分析[39]進行分析。有趣的是，表達PTEN- 398A的細胞中上調的基因與G1/S檢查點的***有關，如G1/S期特異性轉錄、E2F靶標、Rb1通路控制的細胞周期調控基因等 阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配。實驗設計課題實驗外包
提供整體課題外包實驗構思。蛋白組學課題
為了確定EVs介導的ELNAT1在體內促進LN轉移，首先構建一個小鼠腘窩的淋巴結轉移模型。小鼠隨機分為2組（n=12），每3天接受由載體（UM-UC-EVVector）或ELNAT1（UM-UC-3-EVELNAT1）轉染的UM-UC-3細胞分泌的EVs瘤內注射，當原發**大小達到200mm3時采集**和腘窩的LNs（Figure3D）。結果發現，通過體內成像系統（IVIS）發現，與UM-UC-EVVector相比，UM-UC-3-EVELNAT1促進了UM-UC-3細胞向腘窩LNs的轉移，LNs體積更大（Figure3E-I）。
由于淋巴管生成是淋巴結轉移的關鍵步驟，因此進一步評估了EVs介導的ELNAT1在體內對淋巴管生成的影響。結果顯示，UM-UC-3-EVELNAT1組***增加了小鼠足底**瘤內和瘤旁區域的淋巴管內皮透明質酸受體1陽性（LYVE-1positive）（Figure3J,K）。以上結果表明，EVs介導的ELNAT1促進BCa體內淋巴管生成和淋巴結轉移。 蛋白組學課題
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