第三步：上傳附加文件（可以選擇性上傳）
附加文件中可以包括平臺、批次等信息。 例如，在平臺列中，“1”表示數據來自 Affymetrix U133 plus2 平臺，“2”表示來自安捷倫微陣列芯片的數據，“3”表示來自 Illumina Hiseq 2000 的數據等。
第四步：填寫電子郵箱（選填，建議填寫）
如果填寫郵箱，結果會以郵件形式發送至該郵箱。
第五步：提交
數據文件全部上傳后，點擊“Submit”進行提交，頁面會自動跳轉至結果頁。也可以根據頁面給出的job ID查詢結果。
總而言之，我們可以使用Rank-In對**的芯片和 RNA-seq中的混合數據進行綜合轉錄組學分析。 circNDUFB2與IGF2BPs相互作用促進泛素/蛋白酶體介導的IGF2BPs降解.焦亡標書國家自然科學基金
點擊該基因的名稱，將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻中的更多詳細信息。***，在“詳細信息”部分中總結了有關疾病，細胞類型和基因的詳細信息。SC2disease還提供了從基于單細胞的結果和基于GWAS的結果得出的疾病的易感基因。所有GWAS數據均從GWAS目錄獲得。以2型糖尿病為例，將通過單擊“可視化”顯示由scRNA-seq和GWAS檢測到的易感基因列表。此外，可通過單擊“可視化”以可視方式顯示結果。在所得圖中，x軸是從GWAS結果獲得的基因中SNP的**小P值。y軸是從scRNA-seq結果獲得的疾病的重疊敏感性基因的細胞類型。條的顏色顯示基因表達的log 2倍變化。WNT標書浙江檢測circNDUFB2是否作為miRNA海綿調節NSCLC的靶標.
**近有報道稱，ALS/FTD中TDP-43的聚集可以隔離核孔蛋白、轉運蛋白和其他因子，表明TDP-43的聚集強烈破壞核質轉運(NCT)和核孔復合體。此外，在AD、ALS和亨廷頓氏病(HD)中NCT也被破壞，提示在這些神經退行性疾病中有一個共同的功能失調途徑。然而，TDP-43在反復顱腦損傷致神經退行性變中的病理機制尚不清楚。此報道之前曾證明，重復的創傷導致果蠅大腦中的泛素、p62和TDP-43包涵體以及應激顆粒病理。在這里，我們對果蠅的大腦進行了蛋白質組學分析，以確定創傷損傷后改變的分子通路。
四、TEA-seq轉錄本、表位和可及性的三峰測量
A.隨著從單個核中同時捕獲RNA-seq和ATAC-seq的商業平臺的發布，我們推斷通透細胞可以用于同時捕獲三個主要的分子隔間:DNA可以用scATAC-seq捕獲，RNA可以用scRNA-seq捕獲，蛋白質表位豐度可以用聚腺苷化抗體條形碼捕獲，我們根據轉錄本、表位表位和可及性將其稱為TEA-seq。經過試驗和關鍵步驟的優化后，我們能夠在10倍基因組MultiomeATAC+基因表達平臺上獲得文庫，該平臺使用46個低聚標記抗體組合了數千個單細胞的所有三種測量結果.
B.D.在對裝入4孔的細胞進行初始數據處理后，我們鑒定出29264個通過上述scATAC-seqQC標準的細胞條形碼，有2,500,500個獨特的ATAC-seq片段(中值=8762個獨特的ATAC片段)，有>500個基因被scRNA-seq檢測到(中值=2399個RNAUMIs;中位數=檢測到129,249個基因)，500個ADTUMIs.
G.H.更敏感的蛋白質豐度測量允許檢測許多附加的相關標準物質，例如CCR2/CD192.
I.J.一種單核細胞上表達的趨化因子受體和CD38，一種表達于多種免疫細胞表面的糖蛋白. LAG抗體***富集ciRS-7但未富集circNDUFB2.
奧沙利鉑耐藥是結直腸*(CRC)患者***中的一個挑戰。調節性T細胞(Treg)以其免疫抑制作用而聞名，靶向Treg是提高化療敏感性的有效途徑。Treg是一種提高化學敏感性的有效方法。外泌體遞送的miRNA被用作預測化療敏感性的潛在生物標志物。然而，Treg和外泌體miRNAs之間的關系仍然很大程度上是未知的。本研究結果表明，**分泌的miR-208b通過靶向PDCD4促進Treg擴增，這可能與CRC中奧沙利鉑化療敏感性的降低有關本。這些發現突出了外泌體miR-208b作為奧沙利鉑***反應的預測生物標志物的潛在作用，并且它們是免疫***的新靶點。本研究于2021年4月發表于《Molecular Therapy》IF: 8.986期刊上。研究了所有三組循環代謝產物豐度與腸道微生物群之間的聯系.rip標書國家自然科學基金
評估了丙酸丁酸和異丁酸的含量是否與運動恢復或腸道完整性相關。焦亡標書國家自然科學基金
缺氧主要通過FOXO3A轉錄***LINC00926的表達，***PGK1的表達由于缺氧是**的一個關鍵現象，我們確定了LINC00926/PGK1軸是否在缺氧下糖酵解的調節中發揮作用。缺氧刺激了PGK1在mRNA和蛋白水平上的表達，并降低了LINC00926的表達(圖5A)。為了確定缺氧如何***乳腺*細胞中LINC00926的表達，我們研究了缺氧后對LINC00926啟動子的***。對不同的LINC00926啟動子缺失報告基因的分析顯示，啟動子區域在300-200bp之間包含一個缺氧***元件(圖5B)。該區域假定的FOXO3A結合位點的突變會導致***的喪失。在常氧或缺氧條件下，FOXO3A影響LINC00926和PGK1的表達，說明FOXO3A是LINC00926調控的特異性轉錄因子(圖5C和5D)。ChIP分析表明，在常氧條件下，FOXO3A被募集到LINC00926啟動子內包含FOXO3A結合位點的區域，但沒有被募集到LINC00926啟動子上游的區域，在缺氧條件下募集減少(圖5E)。FOXO3A提高了LINC00926水平，降低了PGK1水平，而且重要的是，在正常或缺氧條件下，下調LINC00926均嚴重損害了FOXO3A調節LINC00926和PGK1表達的能力(圖5F)。此外，敲除LINC00926還**削弱了缺氧對PGK1上調的影響。這些數據表明，缺氧主要通過FOXO3A轉錄***LINC00926的表達，***PGK1的表達。焦亡標書國家自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗