三、SNP檢測及在基因組的分布在全基因組一致性序列的基礎(chǔ)上,從中提取全基因組中所有的潛在多態(tài)性位點,再根據(jù)質(zhì)量值、深度、重復(fù)性等因素做進(jìn)一步的過濾篩選,**終得到高可信度的SNP數(shù)據(jù)集。根據(jù)已有的基因集對檢測到得變異進(jìn)行注釋。四、InDel檢測及在基因組的分布使用測序個體的短序列與參考基因組進(jìn)行Paired-End比對,將比對結(jié)果進(jìn)行聚類分析,并結(jié)合Paired-End關(guān)系檢測可信的shortInDel。在檢測過程中,gap的長度為1~3個堿基。對于每個InDel的檢測，至少需要3個雙末端序列的支持。五、結(jié)構(gòu)變異檢測及在基因組中的分布利用測序個體序列與參考基因組序列進(jìn)行比對,檢測全基因組水平的結(jié)構(gòu)變異,目前能夠檢測到得結(jié)構(gòu)變異類型主要有缺失、插入、復(fù)制、倒位、易位等，并根據(jù)已有的基因集對檢測到得變異進(jìn)行注釋。通過測序儀電泳讀取檢測結(jié)果。中國臺灣測序服務(wù)兩年
核仁小RNA(snoRNAs)是一泛存在于真核生物細(xì)胞核仁的小分子非編碼RNA.長度60-300nt,能與核仁核糖**白結(jié)臺形成snoRNPs復(fù)合物。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過進(jìn)一步的轉(zhuǎn)錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學(xué)過程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過程的調(diào)控以及氧化應(yīng)激反應(yīng)。由于snoRNA被認(rèn)為主要存在于核仁**能單一,之后的很長-段時間,snoRNA的研究陷入低潮。然而，近幾年,隨著測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的數(shù)據(jù)表明snoRNA在**中被異常調(diào)控,還參與到遺傳性疾病、造血、代謝以及**的過程中。新一代測序技術(shù)的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡便等特點，為在基因組范圍內(nèi)快速研究任一物種已知的snoRNA的表達(dá)情況和預(yù)測挖掘新的snoRNA調(diào)控分子提供了強有力的技術(shù)工具。本公司snoRNA測序基于llumina測序平臺,能夠準(zhǔn)確檢測樣本snoRNA表達(dá)情況。中國臺灣測序服務(wù)兩年本公司在多年miRNA表達(dá)譜芯片服務(wù)的基礎(chǔ)上,推出基于lluminaGAllx的smallRNA測序服務(wù).
三、高分辨率熔解曲線(HRM)法高分辨率熔解曲線分析技術(shù)(HighResolutionMlting),簡稱HRM,是近年來興起的一種檢測基因突變、進(jìn)行基因分型而及甲基化檢測的新方法?；驹硎腔诤怂岱肿佑捎谄伍L短、GC含量、GC分布及單個堿基差異等物理性質(zhì)不同而造成DNA分子在加熱變性時都會有不同的熔解曲線的形狀和位置,并配合運用高濃度的飽和熒光染料,可以迅速的檢測出核酸片段中GC含量和單堿基的突變。近年來,公司引進(jìn)了RocheLightCycler@480II和ABIVIIA7全自動熒光定量PCR系統(tǒng)，為客戶提供專業(yè)化個性化的甲基化HRM檢測服務(wù)。
隨著測序成本降低和已知基因組序列物種增多,全基因組重測序已經(jīng)成為動植物育種、群體進(jìn)化、藥物研發(fā)、疾病研究和臨床診斷中**為迅速而有效的方法之一。全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個體進(jìn)行基因組測序,并在個體或群體水平進(jìn)行差異性分析的測序方法。相比芯片檢測或者外顯子測序,華大科技采用短序列(Short-Reads)、雙末端(Paired-End)和不同長度的插入片段(Insert-Size)的測序策略,可以***的挖掘基因序列差異和結(jié)構(gòu)變異。在全基因組水平上掃描并檢測與生物體重要性狀相關(guān)的突變位點,具有重大的科研價值和產(chǎn)業(yè)價值。本公司snoRNA測序基于llumina測序平臺,能夠準(zhǔn)確檢測樣本snoRNA表達(dá)情況。
分析內(nèi)容1.數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計:對測序結(jié)果進(jìn)行圖像識別、去污染、去接頭,統(tǒng)計結(jié)果包括read長度、read數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)產(chǎn)量;,Promoter和CpG島(CGI)覆蓋度分析;moter和CGI區(qū)甲基化分析;5.差異性甲基化區(qū)域(DMR)分析。技術(shù)優(yōu)勢精確度高:在其覆蓋范圍內(nèi)可達(dá)到單堿基分辨率;重復(fù)性好:多樣本的覆蓋區(qū)域重復(fù)性可達(dá)到85%-95%,適用于多樣本間的差異分析;檢測范圍廣:覆蓋全基因組范圍內(nèi)超過5百萬個CpG位點;性價比高:測序區(qū)域更有針對性,數(shù)據(jù)利用率更高。研究結(jié)果充分證明了RRBS技術(shù)的可靠性。RRBS可作為一種更高效經(jīng)濟的研究方法,可應(yīng)用于檢測全基因組啟動子和CpG島區(qū)域DNA甲基化狀態(tài)。 利用高通量測序技術(shù),--次性獲得單堿基分辨率的數(shù)百萬條小RNA序列信息。湖北測序詢問報價
通過高通量測序技術(shù)尋找反向剪接的reads,即back-splicingreads。中國臺灣測序服務(wù)兩年
二、有參考基因組序列的轉(zhuǎn)錄組1.標(biāo)準(zhǔn)信息分析1)對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行去除接頭、污染序列及低質(zhì)量reads的處理;2)測序評估;3)基因表達(dá)注釋;4)基因差異表達(dá)分析;5)對基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化(*針對真核生物);6)鑒定基因的可變剪接(*針對真核生物);7)預(yù)測新轉(zhuǎn)錄本;8)SNP分析。2.定制化信息分析可結(jié)合客戶的需求,協(xié)商確定定制化信息分析內(nèi)容。三、鏈特異性轉(zhuǎn)錄組(需提供參考基因序列、參考基因組序列)鏈特異性技術(shù),也稱strand-specificRNAsequencingmethod,是一種能夠區(qū)分正義鏈或反義鏈信息的方法,其對于轉(zhuǎn)錄組的功能分析具有十分重要的意義。1.標(biāo)準(zhǔn)信息分析1)正負(fù)鏈信息;2)反義鏈表達(dá);3)其他(分析內(nèi)容同常規(guī)轉(zhuǎn)錄組)。2.定制化信息分析可結(jié)合客戶的需求,協(xié)商確定定制化信息分析內(nèi)容。四、均一化文庫分析內(nèi)容同常規(guī)轉(zhuǎn)錄組。五非編碼RNA測分析(需提供參考基因序列、參考基因組序列及基因注釋結(jié)果)定制化信息分析:可結(jié)合客戶的需求,協(xié)商確定定制化信啟分析內(nèi)容。中國臺灣測序服務(wù)兩年
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗