核仁小RNA(snoRNAs)是一類存在于真核生物細胞核仁的小分子非編碼RNA,長度60-300nt,能與核仁核糖**白結臺形成snoRNPs復合物。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內含子區域,并且經過進一步的轉錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學過程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過程的調控以及氧化應激反應。由于snoRNA被認為主要存在于核仁**能單一,之后的很長-段時間,snoRNA的研究陷入低潮。然而,近幾年,隨著測序技術的發展,越來越多的數據表明snoRNA在**中被異常調控,還參與到遺傳性疾病、造血、代謝以及**的過程中。新-代測序技術的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡便等特點,為在基因組范圍內快速研究任-物種已知的snoRNA的表達情況和預測挖掘新的snoRNA調控分子提供了強有力的技術工具。本公司snoRNA測序基于llumina測序平臺,能夠準確檢測樣本snoRNA表達情況。結合Bisulfite的測序法是一種靈敏的能直接檢測分析基因組DNA甲基化模式的方法。。黑龍江實驗服務贈送提供技術路線
snoRNA測序核仁小RNA(snoRNAs)是一類存在于真核生物細胞核仁的小分子非編碼RNA,長度60-300nt,能與核仁核糖**白結合形成snoRNPs復合物。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內含子區域,并且經過進一步的轉錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學過程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過程的調控以及氧化應激反應。由于snoRNA被認為主要存在于核仁**能單一,之后的很長-段時間,snoRNA的研究陷入低潮。然而,近幾年,隨著測序技術的發展,越來越多的數據表明snoRNA在**中被異常調控,還參與到選傳性疾病、造血、代謝以及**的過程中。新-代測序技術的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡便等特點,為在基因組范圍內快速研究任一物種已知的snoRNA的表達情況和預測挖掘新的snoRNA調控分子提供了強有力的技術工具。本公司snoRNA測序基于llumina測序平臺,能夠準確檢測樣本snoRNA表達情況。陜西實驗服務國家自然科學基金結合您的實驗要求分析課題中所需要的技術方法和檢測指標,幫助您設計出經濟合理的實驗方案。
利用序列捕獲技術將全基因組外顯子區域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。是-種選擇基因組的編碼序列的高效策略,外顯子測序相對于基因組重測序成本較低,對研究已知基因的SNP.IndelI等具有較大的優勢。簡介:全外顯子組(Exome)是指基因組中全部外顯子區域的總和,人類的外顯子組約占基因組的1%~2%,包含了蛋白質合成,的重要信息,是基因行使功能**直接的體現。絕大部分疾病或性狀相關的變異位于外顯子區域,與全基因組重測序相比,全外顯子組測序*針對外顯子區域內部和邊界區域的DNA進行測序,覆蓋度更深,數據準確性更高,可更加經濟.高效地發現與疾病或表型相關的個體速傳變異及罕見突變。人全外顯子組測序技術已逐步應用到單基因致病基因和復雜疾病易感基因研究中。
轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組研究是基因功能及結構研究的基礎和出發點,通過新一代高通量測序,能夠***快速地獲得某一物種特定組織或***在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息,已曠泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。技術優勢:任意物種的全轉錄組分析:無需預先設計特異性探針,因此無需了解物種基因或基因組信息,能夠直接對任何物種進行*****的轉錄組分析。覆蓋度高:數字化信號,直接測定幾乎所有轉錄本片段的序列;。檢測閾值寬:跨越6個數量級的寬檢測閾值,從幾個到數十萬個拷貝精確計數;●分辨率高:可以檢測基因家族中相似基因及可變剪接造成的單堿基差異;。檢測范圍廣:從幾個到數十萬個拷貝精確計數,可同時鑒定及定量正常和稀有的轉錄本。SmallRNA參與細胞生長、發育、代謝、基因轉錄和翻譯等諸多生物學過程。
基因表達譜測序為對組織或細胞在特定狀態下產生的mRNA進行高通量測序分析,得到基因差異表達的情況。測序法進行基因表達分析具有定量準確,重復性、特異性、靈敏性高的特點。與全轉錄組測序研究相比,表達譜測序采用單端或雙端讀長的策略,測序通量較小,成本較低;與芯片法相比,測序法具有無需樣本序列信息即可實現任一物種已知和未知轉錄本差異研究的開放性特點,對低豐度轉錄本的檢測具有靈敏性和特異性高的優點。客戶可根據實驗目的,靈活選擇合適的測序深度,以達到對不同豐度轉錄本的檢測要求。-般10M~20Mreads數的測序量即可檢測到比芯片更多的差異基因。如果對低豐度表達基因的關注度高,建議至少測30M以上的reads.宏基因組測序分析微生物群體基因組成及功能,解讀微生物群體的多樣性與豐度,研究新的、具有特定功能的基因。焦亡生物相關實驗服務
高通量測序(轉錄組測序、smallRNA測序、miRNA測序、IncRNA測序、circRNA測序、tRF測序、甲基化測序)。黑龍江實驗服務贈送提供技術路線
三、數據分析.原始數據產“出統計已知smallRNA注釋:miRNA,siRNA,piRNA,rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA,repeatasscociatedsRNA等降解片段鑒定:mRNA,exon,intron等預測新的miRNAmiRNA同源性結構分析miRNA表達譜聚類分析miRNA差異表達分析miRNA靶基因預測靶基因功能注釋、Pathway和GeneOnlotogy富集分析與mRNA進行關聯分析(需要有mRNA數據)四、樣品要求樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。樣品量:細胞樣品請提供至少5x106個細胞,組織樣品請提供至少100mg的組織塊或切片,RNA樣品請提供10μg以上的總RNA。樣品質量:RNA無明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥8。樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80°C保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80°C保存。樣品保存期間避免反復凍融。樣品運輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好,干冰運輸。黑龍江實驗服務贈送提供技術路線
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗