4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用
由于lncRNA的分子功能與其亞細胞定位相關,通過FISH和亞細胞定位實驗發現ELNAT1在UM-UC-3和T24細胞的細胞質和細胞核均有表達(SupplementalFigure7A,B)。并且通過RNA-pulldown實驗,發現在分子量35~40kDa上有明顯的條帶(Figure4A)。對此,通過質譜(MS)和Westernblot分析顯示,hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白(Figure4B-D)。熒光染色和RNA免疫沉淀(RIP)證實了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細胞中的共定位,并且ELNAT1通過內源性hnRNPA1富集(Figure4E,F),進一步驗證了ELNAT1和hnRNPA1之間的相互作用。 英拜生物對實驗可行性分析。項目課題分子生物學實驗
急性髓系白血病(AML)的靶向***的實施一直具有挑戰性。FTO是一種m6A去甲基酶,作為一種致*基因,促進白血病*基因介導的細胞轉化和白血病發生。因此為大家介紹于2021年3月發表于影響因子為8.579的Theranostics上文章“Saikosaponin D exhibits anti-leukemic activity by targeting FTO/m6A signaling”。在這里,我們研究了Saikosaponin-d (SsD)在AML中***的抗增殖作用中的作用,并通過靶向SsD的FTO來評估m6A去甲基化活性。SsD在體外和體內均能***抑制AML細胞增殖,促進細胞凋亡和細胞周期阻滯。機制上,SsD直接靶向FTO,從而增加了m6A RNA的甲基化,降低了下游基因轉錄本的穩定性,導致相關通路的抑制。重要的是,SsD還克服了FTO/m6A介導的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性。總之,FTO依賴的m6A RNA甲基化介導了SsD的抗白血病作用,使SsD成為一種***白血病的藥物。cancer課題售后服務按照實驗設計路線和實驗結果進行文章的構思與潤色。
circPDE3B的致*作用部分依賴于LAMA1
為了研究LAMA1在ESCC侵襲表型中的作用,我們進行了qRT-PCR,結果表明LAMA1在ESCC細胞系和組織中過表達。TCGAESCC數據集也得到了類似的結果。同樣,對10對匹配的ESCC組織和相鄰的非*組織進行westernblotting,發現在ESCC組織中LAMA1表達***上調。通過免疫組化研究LAMA1在組織中的表達,發現ESCC組織比相鄰的非*組織具有更強的LAMA1染色。與LAMA1低表達的患者相比,LAMA1高表達的患者平均OS和DFS天數減少。這些結果均提示LAMA1可能在ESCC進展中發揮致*作用。接著,我們驗證了circPDE3B在ESCC中的致*活性是否依賴于LAMA1。CCK-8和集落形成實驗表明,抑制LAMA1表達可損害細胞增殖。然而,共轉染circPDE3B載體***逆轉了這種抑制作用。同樣,與circPDE3B載體共轉染后,LAMA1沉默誘導的受損細胞遷移和侵襲能力被消除。
CircRNF13通過SUMO2促進SLUT1的泛素化
接下來探究circRNF13是否是通過SUMO2來促進SLUT1的泛素化的。利用anti-Flag-GLUT1抗體進行共免疫沉淀(Co-IP)實驗,驗證GLUT1與SUMO2蛋白之間的相互作用。在SUMOylation期間,UBC9是***可以直接識別底物并催化SUMO蛋白c端羧基與底物蛋白結合進行修飾的連接酶。Co-IP實驗揭示了GLUT1和UBC9之間的相互作用。免疫熒光也顯示SUMO2和GLUT1蛋白有共定位。WB顯示過表達circRNF13促進GLUT1的SUMOylation,敲低circRNF13抑制GLUT1的SUMOylation。此外,泛素化實驗表明,過表達SUMO2可加速GLUT1的泛素化,而當共轉染si-circRNF13和SUMO2過表達載體時,si-circRNF13可減弱SUMO2誘導的GLUT1泛素化水平。這些結果提示,circRNF13通過與SUMO2結合調控GLUT1泛素化。總之,circRNF13促進GLUT1的泛素化,抑制GLUT1的表達,從而抑制NPC細胞的糖酵解過程。 高通量測序的后續成文服務。
為了驗證circMYH9 是否通過 p53 途徑調節SG的合成。qRT-PCR和WB 證明了circMYH9 對p53的負調節。Nutlin-3可*** p53。Nutlin-3處理過表達 circMYH9的 LoVo 細胞逆轉了p53和MDM2的下調,并抑制了SG生物合成途徑基因表達和細胞增殖。而circMYH9耗盡的HCT116細胞中的p53沉默則顯示出相反的效果。還在過度表達 circMYH9 的 LoVo 細胞中用 shRNA 敲低了 PHGDH。PHGDH 抑制顯示出與 Nutlin-3 處理類似的效果,但不影響 p53 表達。此外,與對照細胞相比,具有 circMYH9 敲除的體內異種移植物的 IHC 顯示出更高的 p53 表達和更低的 PHGDH 和 PSPH 表達。相比之下,circMYH9 過表達異種移植物的 IHC 顯示 p53 的表達較低,而 PHGDH 和 PSPH 的表達高于載體細胞的表達。這些結果證實了 circMYH9 在 p53 通路和從頭 SG 代謝的調節中的主要作用。醫學整體課題外包服務。內分泌課題服務兩年
Pex調節HSC的ECM分泌。項目課題分子生物學實驗
LCAT3招募FUBP1***MYC轉錄
芯片分析表明,FUBP1在肺*細胞中與c-MYC啟動子結合。FUBP1在LCAT3敲低后***降低。因此,LCAT3似乎是FUBP1與c-MYC啟動子結合所必需的。然后,然后,我們測試了LCAT3是否通過將FUBP1招募到c-MYC啟動子上的FUSE序列中來***c-MYC表達。使用c-MYC啟動子驅動的熒光素酶報告基因,在有或沒有FUSE序列的情況下,我們發現LCAT3或FUBP1基因敲低后,c-MYC啟動子活性受到抑制,這種抑制方式依賴于FUSE序列。因此,LCAT3將FUBP1招募到MYCFUSE序列中來***其轉錄。 項目課題分子生物學實驗
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗