**近的研究表明INPP4B可能在與化療耐藥性相關的急性髓系白血病(AML)中起致*作用,以及在黑素瘤和結腸*中起致*作用。而且可能與環境有關。例如,在乳腺*中,SGK3被擴增,它的激酶活性依賴于致*的PI3K和INPP4B。**近,INPP4B被確定為與ER+乳腺*和**分級相關的前列基因。
2021年5月,在Naturecommunications雜志上發表了文章“INPP4BpromotesPI3Kα-dependentlateendosomeformationandWnt/β-cateninsignalinginbreastcancer”。此報道探討了INPP4B在ER+乳腺*中的作用,揭示了一組pik3c突變ER+乳腺*表現出INPP4B表達增加。盡管同時抑制AKT信號,但過表達INPP4B可以促進pik3a突變ER+乳腺*細胞系的增殖和**生長。為了研究這一明顯的悖論,使用了蛋白質組學、轉錄組學和先進的細胞成像的綜合方法來闡明INPP4B促進pik3a突變ER+乳腺*發生的分子機制。結果顯示INPP4B刺激晚期核內體上pi3kα依賴的信號樞紐,指導Wnt/β-catenin的***。這些研究揭示了促進細胞增殖和**生長的兩種致*信號通路之間的串擾機制。 提供整體課題外包實驗構思。克羅恩課題設計實驗
3、MAO-A促進巨噬細胞免疫抑制極化
為了研究MAO-A對巨噬細胞極化的調控,體外培養MaoaWT和KOBMDMs,并通過添加***刺激(IL4和IL-13)使這些巨噬細胞向免疫抑制表型極化(圖3a)。觀察到,在M-CSF誘導的巨噬細胞分化過程中,MaoamRNA的表達在Maoa野生型BMDMs中有明顯的誘導作用,Maoa在成熟的BMDMs中表達趨于穩定,并維持IL-4/IL-13誘導的免疫抑制極化(圖3b-c)。MaoaKOBMDMs中MAO-A表達未檢測到,證實了其MAO-A缺失基因型(圖3b,d)。與野生型巨噬細胞相比,在IL-4/IL-13刺激下,MaoaKO巨噬細胞表現出更低的免疫抑制表型,這在其免疫抑制標記物的表達減少中得到了證明(圖3e-g)。在巨噬細胞/T細胞共培養試驗中(圖3h),IL-4/IL-13極化的MaoaKO巨噬細胞在抗CD3/CD28刺激下,與免疫抑制表型的減弱一致,其對野生型CD8+T細胞的抑制作用減弱(圖3i-k)。 免疫組化課題實驗檢測服務了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。
***,分析了MAOA基因表達水平與幾種**病人臨床預后的關系,結果顯示瘤內MAOA基因與卵巢*,淋巴*和乳腺*患者的臨床總生存率呈現負相關關系(圖6o-q)。此外,黑色素瘤患者**內高水平的MAOA表達很大程度上抵消了PD-1***提供的生存好處,提示MAO-A阻斷***與PD-1/PD-L1阻斷***聯合可能通過調節TAM極化,從而改變免疫抑制TME,提高抗**免疫能力,提供協同***好處(圖6r)。綜上所述,人類TAM和臨床相關性研究證實了MAO-A作為人類TAM中一個有前途的藥物靶點,并支持了MAO-A通過靶向TAM重編程阻斷**免疫***的翻譯潛力。
此外,GFP-INPP4B的表達在基礎和wnt刺激條件下降低了GSK3β蛋白水平,與GSK3β的增強破壞一致(圖6d)。通過HrsshRNA消耗抑制晚期核內體形成后,降低的GSK3β蛋白水平得以恢復(圖6f,g)。GFP-INPP4B而不是gfp載體細胞表現出明顯的GSK3β蛋白酶保護,這與GSK3β向晚期核內體轉運的增強相一致(圖6h)。免疫熒光證實了這一點,在GFP-INPP4B中觀察到RFP-GSK3與LysoTracker共定位,這是一種積累在晚期核內體/溶酶體中的染料,而不是gfp載體細胞(圖6i)。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。
PGE2 增強 IL4Rα 信號以增強巨噬細胞的 M2 ***
巨噬細胞能夠響應可變的局部微環境信號從一種功能表型切換到另一種功能表型。除了經典的信號級聯(例如,IL4/IL4Rα),巨噬細胞還可以整合由細胞外刺激觸發的代謝線索,以***它們的 M2表型。在這里,我們想知道 PGE2 是否也參與了 AP 損傷后胰腺巨噬細胞的 M2 極化。為此,我們首先檢查了 AP 損傷后 PGE2 的動態表達。COX1 和 COX2 是產生前列腺素的兩種關鍵酶。在這里我們發現Ptgs2 (COX2)的表達在第 3 天達到峰值,而Ptgs1 (COX1)的表達在第 1 天下降并在第 3 天回到基礎水平。一致地,免疫熒光分析顯示 PGE2 在第 3 天升高,并在第 5 天迅速恢復到基礎水平。值得注意的是,PGE2在第 3 天主要與導管樣細胞(CK19 +細胞)共表達,以及部分與巨噬細胞(F4/80 +細胞)共表達。此外,根據我們的 RNA-seq 數據和流式細胞術分析,我們發現巨噬細胞中 COX2 的表達也在第 3 天達到峰值。更有趣的是,與 IL4Rα -巨噬細胞和單核細胞相比,IL4Rα +巨噬細胞表達了更高水平的 COX2。 解決了對確定因果調節機制網絡的方法的關鍵需求。lncRNA課題
公共比較毒理基因組學數據庫。克羅恩課題設計實驗
四、Multimodal分析突出了肥大的上行肢體的細胞異質性
為了確定我們是否能夠檢測出具有可變claudin表達模式的細胞亞群,在snRNA-seq數據集的umap圖上劃分三個亞種群(TAL1,TAL2和ATL)。ATL,上升細肢。顯示了TAL各亞群體中富集基因的基因表達模式。一組細胞(SLC12A1+UMOD+)表達粗升肢標記(CLDN16、KCNJ10和PTH1R):TAL1,另一組細胞表達另一組TAL特異性標記,如CLDN10:TAL2(圖4b)。第三組細胞根據之前發表的標記的表達被確定為髓袢升支粗段(ATL)。我們使用免疫組化方法驗證PTH1R和KCNJ10在UMOD+SLC12A1+細胞亞群中表達(圖4c)。在snATAC-seq數據集的umap圖上進行TAL的亞聚類,劃分三個亞種群(TAL1、TAL2和ATL)(圖4d)。點圖顯示每個TAL亞種群中富集的基因的活性模式(圖4e)。斑點的直徑對應于檢測到的基因活性的細胞比例,斑點的密度對應于相對于所有細胞類型的平均基因活性。Umap顯示CLDN10、CLDN16、S100A2或UMOD(左)的基因活性。TAL1和TAL2之間的chromVAR差異***轉錄因子基序(圖4f)。使用SeuratFindMarkers功能來識別區分厚升肢細胞群的DAR,并使用SeuratFindMotifs功能對這些DAR進行轉錄因子motif富集(圖4g)。 克羅恩課題設計實驗
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
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