2021年6月，***一篇發(fā)表在Curr Biol（IF=9.601）的文章（The RAS GTPase RIT1 compromises mitotic fidelity through spindle assembly checkpoint suppression.）從共生功能體視點的角度對29名接受同種異體造血干細胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了RIT1直接與SAC**組件MAD2和p31conmet相互作用；CDK1在有絲分裂過程中磷酸化RIT1并抑制其與SAC的相互作用；RIT1是細胞有絲分裂及時進展所必需的；RIT1致病水平促進染色體分離錯誤。Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。NF-kB課題實驗外包
系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)患者大多數(shù)存在I型IFN刺激基因(ISGs)的高表達。線粒體異常也有報道，但I型IFN暴露對這些變化的貢獻尚不清楚。此外，I型IFN通過上調(diào)脂肪酸氧化(FAO)和氧化磷酸化(OXPHOS)促進漿細胞樣樹突狀細胞（pDCs）的線粒體功能。本文數(shù)據(jù)表明，I型IFN暴露通過代謝重編程促進CD8 + T細胞死亡，有助于SLE發(fā)病。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:12.121。
1、ISGs高表達患者OXPHOS基因下調(diào)為了確定是否T細胞的轉(zhuǎn)錄組特征可以幫助鑒定SLE患者的疾病活動，作者對來源于***和未***女性的CD8+T和CD4+T細胞的mRNA進行測序。對DEGs進行聚類熱圖分析，發(fā)現(xiàn)SLE患者根據(jù)ISG表達水平被分為***的兩類：SLE-1和SLE-2（Fig.1a,b）。在兩種T細胞中，SLE-2類群的患者具有更強烈的I型IFN特征。在CD4+T細胞中，這種特征伴隨著參與JAK-STAT信號和T細胞共刺激的基因，而在CD8+T細胞中，ISG基因的高表達與基因參與細胞周期，響應(yīng)DNA損傷和凋亡有關(guān)（Fig.1a,b）。比較SLE-1和SLE-2組的轉(zhuǎn)錄表達譜，結(jié)果顯示，除ISGs外，mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達差異比較大（Fig.1c,d）。 流式課題分子生物學深耕科研行業(yè)提高科研的高效。
NPM1突變通常與誘導(dǎo)和鞏固化療后患者生存的良好影響相關(guān)。在NPM1突變的AML中，F(xiàn)LT3- ITD突變經(jīng)常與DNMT3A突變同時發(fā)生，這本身與接受標準誘導(dǎo)***的患者預(yù)后更差有關(guān)。大多數(shù)關(guān)于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的同時發(fā)生，而突變型NPM1患者基因表達水平的異質(zhì)性及其生物學意義尚未得到***研究。
一、NPM1突變的AML聚集成兩個不同的組
為了在391個npm1突變的AML樣本中定義一致的分子亞型，我們使用CoINcIDE12框架應(yīng)用元聚類方法。我們的元聚類分析顯示在我們的數(shù)據(jù)概要中有兩個穩(wěn)健的亞型(圖1A和補充圖1和2)。接下來，我們使用PERT算法13來闡明每個聚類中AML樣本的細胞組成。我們發(fā)現(xiàn)有一簇干細胞***富集，因此被標記為原始。與此相反，另一簇與髓系和造血分化相關(guān)的基因表達豐富，因此我們將其標記為committed亞型(圖1B)。
3.Tempol可改善PCOS大鼠全身和腸道的氧化應(yīng)激
DHEA+PBS組大鼠血清MDA水平明顯高于油+PBS組，血清T-AOC水平明顯低于oil+PBS組。給藥Tempol可***降低PCOS大鼠血清MDA水平，提高血清T-AOC水平(圖3A-B)。研究發(fā)現(xiàn)，DHEA聯(lián)合或不聯(lián)合tempol對血清3’-NT和AGEs水平均無影響(圖3C-D)。作者測定卵巢中氧化應(yīng)激生物標志物的水平，PCOS大鼠卵巢MDA、3-NT、AGEs水平高于對照組，但差異無統(tǒng)計學意義(圖3E-G)，PCOS大鼠卵巢T-AOC水平未見明顯下降(圖3H)；然而，這些大鼠的SOD活性降低(圖3I)。WB分析顯示，PCOS大鼠卵巢中SOD1表達下降，而SOD2表達未發(fā)生變化(圖3J)。Tempol對PCOS大鼠這些氧化應(yīng)激標志物的水平?jīng)]有明顯影響，甚至進一步降低了卵巢SOD活性(圖3E-I)，這表明Tempol對卵巢氧化應(yīng)激沒有直接影響。 根據(jù)自身需要檢索相關(guān)基因或者化學品。
2、CDK4/6i介導(dǎo)的CD8+T細胞記憶獲得是細胞固有的
為了確定在CDK4/6i處理的**中觀察到的T細胞記憶是否由于CDK4/6在這些細胞內(nèi)的直接抑制，在體外將活化的小鼠CD8+T細胞暴露于CDK4/6i中，并監(jiān)測Tcm獲取和分裂數(shù)。***CDK4/6i暴露0、24、72h后，Tcm細胞平均分裂數(shù)減少，同時細胞比例增加，且呈劑量依賴性，*在24h內(nèi)發(fā)生(Fig.2A)。這表明CDK4/6i不是簡單地抑制分化，而是直接促進記憶形成，表明細胞周期機制與分化之間存在方向性關(guān)系。通過3'RNA-seq進一步分析發(fā)現(xiàn)，在CDK4/6i處理后，記憶相關(guān)轉(zhuǎn)錄本增加，GSEA分析證實了記憶相關(guān)特征的富集，以及細胞周期相關(guān)特征的減少，包括E2F靶點(Fig.2B-E)。矛盾的是，CDK4/6抑制也誘導(dǎo)了效應(yīng)相關(guān)轉(zhuǎn)錄本，包括Gzma、Gzmc和Pdcd1(Fig.2B-C)，這與之前CDK4/6i促進T細胞活化的報道一致。 小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu)。cancer課題
促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。NF-kB課題實驗外包
為探究Tug1/PGC1α軸如何調(diào)節(jié)鳥氨酸和瓜氨酸的代謝，評估了尿素循環(huán)中的幾個關(guān)鍵酶，包括精氨酸琥珀酸合成酶(ASS1)，精氨酸琥珀酸裂解酶(ASL)，精氨酸酶1和精氨酸酶2 (ARG1和ARG2)，以及一氧化氮合成酶(NOS1, NOS2和NOS3)。在Tug1-KD細胞中，ARG2高表達，ASS1、ASL、ARG1和NOS2低表達，而Pgc1-OE逆轉(zhuǎn)了Tug1-KD對這些酶表達的影響。作者著重關(guān)注線粒體ARG2酶，認為增強ARG2表達/活性可能將Tug1/PGC1α軸的一些線粒體效應(yīng)與鳥氨酸和線粒體代謝物的增加聯(lián)系起來。與對照組相比，Tug1-KD組精氨酸酶活性增加，但是Tug1-KD/Pgc1-OE足細胞中回落。在互補實驗中，所得結(jié)果與此相反，Tug1過表達導(dǎo)致精氨酸酶活性下降，但是足細胞特異性Pgc1α敲除小鼠廢除了這種效應(yīng)。在三苯氧胺誘導(dǎo)的db/db/TugPodTg/Pgc1αPod-f/f小鼠足細胞中使用siRNA干擾Arg2基因的表達，結(jié)果顯示ATP和生物能與siRNA-NC對照組無差別，但是線粒體生物發(fā)生，ROS產(chǎn)生和動力學都***改變。這提示ARG2部分介導(dǎo)Tug1/PGC1α軸的線粒體效應(yīng)。NF-kB課題實驗外包
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