在體外，上調(diào)UCP1減少AKI期間的脂質(zhì)積累可通過(guò)AMPK/ULK1途徑促進(jìn)自噬
自噬已被證實(shí)在AKI中發(fā)揮重要作用。因此，自噬已經(jīng)成為我們關(guān)注的重要途徑之一。在通過(guò)慢病毒轉(zhuǎn)染過(guò)表達(dá)UCP1或UCP1激動(dòng)劑CL316243的AKI細(xì)胞模型中，自噬相關(guān)指標(biāo)顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示，上調(diào)UCP1消除AKI中的脂質(zhì)積累后，細(xì)胞自噬得到促進(jìn)(圖7C)。基于這些發(fā)現(xiàn)，為了驗(yàn)證自噬在UCP1功能中的重要性，我們進(jìn)行了功能恢復(fù)實(shí)驗(yàn)。如圖7D-F所示，氯喹抑制自噬***逆轉(zhuǎn)了順鉑組UCP1引起的炎癥指標(biāo)下降。同樣，TUNEL染色顯示，使用氯喹抑制自噬，可以明顯逆轉(zhuǎn)UCP1促進(jìn)的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結(jié)果表明，脂質(zhì)積累通過(guò)作用于AKI細(xì)胞自噬，在調(diào)節(jié)細(xì)胞功能方面發(fā)揮著重要作用。 血清代謝產(chǎn)物的豐度也發(fā)生了***變化.上海TRF標(biāo)書
我們研究了FOXO3A是否通過(guò)LINC00926調(diào)節(jié)這些效應(yīng)。細(xì)胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過(guò)表達(dá)***了乳腺*細(xì)胞的生長(zhǎng)，而LINC00926敲低則促進(jìn)了細(xì)胞的生長(zhǎng)(圖6A和6B)。重要的是，下調(diào)LINC00926***減弱了FOXO3A調(diào)控細(xì)胞增殖的能力，表明FOXO3A主要通過(guò)表達(dá)LINC00926來(lái)降低乳腺*細(xì)胞的增殖。接下來(lái)，我們通過(guò)LINC00926檢測(cè)FOXO3A是否***細(xì)胞遷移、侵襲和糖酵解。如預(yù)期，F(xiàn)OXO3A減少了乳腺*細(xì)胞的遷移和侵襲(圖6C和6D)。敲除LINC00926**削弱了FOXO3A***細(xì)胞遷移和侵襲的能力。FOXO3A過(guò)表達(dá)***葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成，降低ECAR和增加OCR。然而，敲除LINC00926極大地減弱了FOXO3A調(diào)節(jié)細(xì)胞遷移、侵襲和糖酵解的能力(圖6C-6G)。綜上所述，F(xiàn)OXO3A***乳腺*細(xì)胞的遷移和侵襲，以及糖酵解主要依賴于LINC00926。上海TRF標(biāo)書環(huán)狀RNA（circRNA）是一類共價(jià)閉合的單鏈RNA.
褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡
為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡，在相應(yīng)的高峰表達(dá)（例如1天和3天）進(jìn)行了與鐵死亡相關(guān)蛋白的蛋白質(zhì)印跡分析。發(fā)現(xiàn)褪黑素給藥在TBI后1天抑制了TBI誘導(dǎo)的xCT，Cox2，Tfr1，F(xiàn)pn和Nox2蛋白表達(dá)的上調(diào)。同樣，褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth，F(xiàn)tl和4HNE蛋白的表達(dá)。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1（Lip-1）也獲得了相似的結(jié)果。此外，免疫組化染色顯示，與對(duì)照組相比在TBI后第7天，褪黑素和Lip-1的處理減少了神經(jīng)元中4HNE陽(yáng)性細(xì)胞的數(shù)量，表明褪黑素對(duì)TBI誘導(dǎo)的脂質(zhì)具有神經(jīng)保護(hù)作用過(guò)氧化。褪黑素和Lip-1均抑制TBI誘導(dǎo)的皮質(zhì)GSH水平降低。褪黑素和Lip-1抑制TBI誘導(dǎo)3天后損傷皮層中MDA含量的上調(diào)。這些數(shù)據(jù)表明，TBI導(dǎo)致了與鐵死亡相關(guān)蛋白表達(dá)的時(shí)間變化，以及同側(cè)皮層中某些受推定的鐵死亡生物標(biāo)志物的變化，但是用褪黑素有效地挽救了TBI誘導(dǎo)的鐵死亡。
瀏覽工具將PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)歸納為兩類：“目標(biāo)瀏覽”和“化合物瀏覽”。目標(biāo)瀏覽將在“PROTAC”、“彈頭”、“E3配體”和“Linker”類別選項(xiàng)卡下顯示目標(biāo)蛋白質(zhì)的名稱列表，點(diǎn)擊列表中選定的蛋白質(zhì)將跳轉(zhuǎn)到與該蛋白質(zhì)相對(duì)應(yīng)的所有化合物的列表。化合物瀏覽主要用于可視化“PROTAC”、“彈頭”、“E3配體”和“Linker”類標(biāo)簽下所有化合物的二維結(jié)構(gòu)。此外，在“PROTAC”、“彈頭”和“E3配體”類標(biāo)簽下還將展示生物活性。
可視化和過(guò)濾數(shù)據(jù)表中的結(jié)果查詢或?yàn)g覽結(jié)果顯示為數(shù)據(jù)表，包含2D結(jié)構(gòu)和其他信息，如化合物ID、目標(biāo)蛋白質(zhì)和生物活性(圖2)。 circNDUFB2通過(guò)增強(qiáng)泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩(wěn)定性。
環(huán)狀RNA（circRNA）是動(dòng)植物中一類豐富且保守的RNA。**近的研究表明，circRNA可以通過(guò)充當(dāng)非編碼RNA或編碼RNA發(fā)揮多種生物學(xué)作用。體外合成的circRNA可以不依賴于帽的方式進(jìn)行翻譯。但鑒定circRNA編碼的蛋白質(zhì)是困難的，主要是因?yàn)閏ircRNA序列及其宿主基因的同源線性mRNA具有較大的重疊。近期NucleicAcidsResearch雜志在線發(fā)表了題名為：TransCirc:aninteractivedatabasefortranslatablecircularRNAsbasedonmulti-omicsevidence的文章，該文章主要講述了circRNA翻譯預(yù)測(cè)和分析的數(shù)據(jù)庫(kù)——TransCirc。我們使用miR-127-3p抑制劑和模擬物在circSDHC缺失或過(guò)表達(dá)后進(jìn)行拯救實(shí)驗(yàn).廣州chip標(biāo)書
大量數(shù)據(jù)支持腸道微生物組在SCI中發(fā)揮重要作用。上海TRF標(biāo)書
4、外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化
隨后，作者研究了在不同培養(yǎng)條件下TPH-1的表達(dá)譜。首先，和**細(xì)胞共培養(yǎng)抑制了M1相關(guān)基因的表達(dá)，IL-6，TNF-α，和IL-1β，但是增加了M2相關(guān)基因的表達(dá)CD163，Arg-1，IL-10,TGF-β和VEGFA。過(guò)表達(dá)KDM6B部分抑制了上述表現(xiàn)改變（圖4A-B）。流式檢測(cè)顯示乳腺*細(xì)胞和TPH-1的共培養(yǎng)增加了CD163陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)比例，但是過(guò)表達(dá)KDM6N可以抑制這種效果（圖6C）。類似的，過(guò)表達(dá)KDM6B抑制了miR-138-5p誘導(dǎo)的M2極化（圖4D-F）。與對(duì)照組相比，乳腺*來(lái)源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關(guān)表型，相反，M2標(biāo)志物增加并伴隨著CD163陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)的增加（圖6G-I）。用從乳腺*細(xì)胞中分離出來(lái)的外泌體處理THP-1細(xì)胞導(dǎo)致了M2極化，抑制miR-138-5p的表達(dá)可挽救這種極化（圖4J-L）。總之，這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化。 上海TRF標(biāo)書
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