為了驗證tRFs&tiRNA-Seq數據,作者檢測了91對PTC組織和*旁組織中tRFs&tiRNA的表達,其中,tiRNA-Gly在人類PTC組織中的表達水平比較高,并***高于*旁組織(圖1F-G)。WB顯示,tiRNA-Gly在PTC**中蛋白表達***高于*旁,但是tRNA-Gly的表達在*和*旁中無***差異(圖1H)。總之,tiRNA-Gly可能在PTC的進展中起致*作用。2、在小鼠模型中,tiRNA-Gly調節PTC細胞的增殖和遷移,并影響**生長
首先檢測了tiRNA-Gly在3株PTC細胞系中的表達,如圖2A所示,K1細胞系中tiRNA-Gly的表達***低于BCPAP和TPC-1細胞系。因此,對于功能獲得性實驗,合成帶有5’磷酸末端的tiRNA-Gly轉染至K1細胞系(圖2B)。結果發現,與對照組相比,tiRNA-Gly***促進K1細胞的增殖和遷移(圖2C-D)。對于功能缺失實驗,在BCPAP和TPC-1細胞系中轉染siRNA干擾tiRNA-Gly的表達,結果顯示細胞的增殖和遷移都***下降(圖2E-G)。體內實驗得出了類似的結果,干擾tiRNA-Gly表達導致**體積減小,Ki67表達下降。總之,體內體外實驗都表明tiRNA-Gly是PTC的惡性因子。 阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配天津課題動物模型構建
5、CDK4/6預處理增強CAR-T細胞的持久性和有效性
接下來測試CDK4/6i處理是否會誘導嵌合抗原受體(CAR)-T細胞的記憶表型,并克服CAR-T細胞***成功的兩大障礙:T細胞耗竭和缺乏持久性。通過臨床試驗,以LewisY(LeY)抗原為靶點,制造了人類CAR-T細胞(Fig.5A)并發現暴露于CDK4/6i產生CD4+和CD8+干細胞記憶(Tscm)CAR-T細胞(Fig.5B)。CAR-T細胞的3’RNA-seq揭示CDK4/6抑制后記憶表達***改變,GSEA分析證實了記憶相對效應信號的富集,并如預期E2F靶基因下調(Fig.5C)。為了檢測在體內的持久性,使用兩個**供體的PBMC生成的LeYCAR-T細胞用CDK4/6i預處理,并轉移到NSG小鼠中(Fig.5D)。與未經處理的對照組相比,觀察到在移植后的幾周內,血液中CD8+和CD4+預處理的CAR-T細胞的頻率和數量***增加(Fig.5E-F)。為了評估這些CAR-T細胞的功能性記憶能力,在CAR-T細胞轉移后30天用LeY+卵巢*細胞系OVCAR-3(Fig.5D)處理小鼠,觀察到與未處理的CAR組相比,預處理的CAR-T細胞在小鼠血液中的擴增***增加(Fig.5G)。 寧夏課題分子生物學實驗產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。
7.EVs介導的ELNAT1被HLECs內化以誘導淋巴管生成
共聚焦顯微鏡顯示HLECs中PKH67標記EVs孵育后的點狀熒光強度(Figure7A),表明HLECs內化了BCa分泌的EVs。此外,孵化UM-UC-3-EVELNAT1***上調HLECs中ELNAT1表達,而孵化T24-EVsi-ELNAT1,則T24細胞分泌的EVs中ELNAT1表達下調,則削弱了HLECs中EVs誘導ELNAT1過表達的能力(Figure7B,C)。
為了排除淋巴血管生成是由內源性ELNAT1***HLECs中誘導的可能性,構建了ELNAT1-KO HLECS ELNAT1(HLECsELNAT1-KO)模型(Figure 7 D, E)。與HLECsELNAT1-WT一致,我們觀察到,EVs介導的ELNAT1過表達增強了HLECsELNAT1-KO的管狀形成和遷移能力,而下調ELNAT1則抑制了BCa細胞分泌EVs誘導HLECsELNAT1-KO管狀形成和遷移的能力(Figure 7 F-H)。這表明BCa細胞分泌的EVs通過運輸EVs介導的ELNAT1促進淋巴管生成,而不是轉錄***內源性的ELNAT1。綜上所述,這些結果表明EVs介導的ELNAT1被HLECs內化誘導BCa淋巴管生成。
意味著先前接受過CAR-T細胞***的小鼠的**控制***增強(Fig.5H-I)。值得注意的是,第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+T細胞的數量呈***負相關(Fig.5J),表明CDK4/6i處理的CAR-T細胞的持久性增強是驅動**控制的關鍵因素。事實上,**接種后40天,接受預處理的CAR-T細胞的小鼠浸潤CD4+和CD8+CAR-T細胞的數量***增加(Fig.5K)。接下來通過將未處理或預處理的抗LeYCAR-T細胞轉移到OVCAR-3荷瘤小鼠體內,檢測了CDK4/6i預處理對CAR-T細胞急性療效的影響。用CDK4/6i預處理CAR-T細胞可***增強其抗**活性(Fig.5L-M)。與此一致,轉移后數周發現接受預處理細胞的小鼠血液中CD4+和CD8+細胞以及**中CD8+細胞數量***增高(Fig.5N-O)。總之,這些數據證明CDK4/6i體外***是增強CAR-T細胞表型和長期療效的穩健策略。可以上傳原始的fast文件。
肺*是**常被診斷的**之一,也是導致**死亡的主要原因,非小細胞肺*(NSCLC)約占肺*病例的85%。環狀RNA(circRNA)是一類共價閉合的單鏈RNA,與**的發展有關。***我們來看一篇發表在Nature Communications期刊的一篇文章,題名為:circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity。
circNDUFB2在NSCLC中被下調
通過circRNA芯片分析了三對NSCLC樣品中circRNA的表達譜,總共鑒定出109個circRNA失調,33個上調,76個下調。qRT-PCR驗證52個配對NSCLC樣品中**差異circRNA的表達。circNDUFB2是**顯著下調的circRNA。臨床分析發現circNDUFB2高表達與NSCLC患者的**大小、淋巴結轉移和分期呈負相關。結果表明,circNDUFB2在NSCLC中經常被下調,并且與NSCLC的惡性特征呈負相關。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產生,長度為249nt。circNDUFB2可由發散引物擴增,收斂引物不能擴增。核酸酶消化證實circNDUFB2具有閉環結構。放線菌素D處理表明,與NDUFB2mRNA相比,circNDUFB2是穩定的。核質分離PCR以及熒光原位雜交(FISH)顯示circNDUFB2主要定位于細胞質中。這些結果表明circNDUFB2是一個circRNA。 ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布。西藏課題細胞實驗
有肝轉移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的PDAC患者。天津課題動物模型構建
與HuR的RRM3結合,中斷HuR-β-actinmRNA相互作用,抑制β-actin表達,抑制OPC遷移
為闡明lnc-PMIF如何與HuR相互作用調節β-actin表達和OPC遷移,首先通過生物信息學分析預測了lnc-PMIF的二級結構,并合成生物素化的全長lnc-PMIF(WT)和截短的lnc-PMIF突變體,分別為突變體A1(無5’莖環的正義)、突變體A2(有中心莖環和3’莖環的正義)和突變體A3(*有3’莖環的正義1100-1455bp),轉染MC3T3-E1細胞,并進行標記RNA鏈霉親和素下拉試驗。蛋白免疫印跡分析顯示,HuR存在于轉染WTlnc-PMIF、截短lnc-PMIF突變體A1或截短lnc-PMIF突變體A2的細胞的下拉部分中,但在轉染截短lnc-PMIF突變體A3的細胞的下拉部分中不存在。這些數據表明,lnc-PMIF的中心莖環足以實現lnc-PMIF和HuR之間的相互作用。 天津課題動物模型構建
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗