西藏課題技術指導

來源: 發布時間:2021-10-16

與對照組相比,乳腺*來源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關表型,相反,M2標志物增加并伴隨著CD163陽性細胞數的增加(圖6G-I)。用從乳腺*細胞中分離出來的外泌體處理THP-1細胞導致了M2極化,抑制miR-138-5p的表達可挽救這種極化(圖4J-L)??傊?,這些結果表明外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達調節巨噬細胞極化。

5、KDM6B去甲基化酶活性增加了M1相關基因的表達

抑制KDM6B的組蛋白去甲基化酶活性可抑制其靶基因的轉錄。因此,使用雙熒光素酶實驗來分析M1靶基因的啟動子活性。KDM6B的過表達特異性地刺激了促炎因子IL-6、IL-1β和TNF-α編碼基因的啟動子活性(圖5A)。相反,沉默KDM6B活性則導致他們的啟動子活性抑制,而過表達KDM6B降低了H3K27me3的水平(圖5B)。ChIP檢測顯示,與對照相比,THP-1細胞中KDM6B的過表達或敲除***增加或減少了KDM6B啟動子在不同區域的占用(圖5C-D)。與此結果一致,啟動子區域H3K27me3的募**降低或增加當KDM6B過表達或沉默時(圖5E-F)??傊?,下調KDM6B可提高H3K27me3水平和促炎因子編碼基因的轉錄活性,導致抑制M1極化。 IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。西藏課題技術指導

二、偽時間軌跡,染色質可及性和基因表達分析揭示Flow-Dependent內皮細胞重新編程

我們的分析明確了3種主要的分化細胞類型:(1)ec,(2)免疫細胞(巨噬細胞,樹突狀細胞和T細胞),以及(3)SMCs和纖維細胞(圖3A)。此外,在每一細胞類型走向的軌跡路徑上,還有許多其他細胞出現,表明它們響應d-flow的過渡性去分化狀態。為了更好地理解軌跡結果,我們將分析分為四種實驗條件(圖3B)。在s-flow條件下(2D-R和2W-R),大部分細胞分化良好,少數細胞處于過渡狀態。相反,d-flow條件誘導許多ec進入過渡狀態,潛在地向smc和纖維轉化分化,表明EndMT。令人驚訝的是,我們還發現許多ec在急性d-flow條件下(2D-L)向免疫細胞轉移,在慢性d-flow條件下(2W-L)進一步增加。 cancer免疫課題動物模型構建高通量測序后續的機制實驗。

4)SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導m6A修飾

為了檢測m6A在RNA上的變化,我們在SsD處理的白血病細胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示,SsD***增加了m6A在轉錄組中的豐度。此外,HPLC-MS/MS定量證實了SsD處理的NB4和Kas-1細胞mRNA中細胞m6A的增加(圖4B)。接下來,我們檢測了FTO的兩個直接靶點MYC和RARA在SsD處理的細胞中的表達。SsD在mRNA和蛋白水平***下調了NB4和Kas-1細胞的MYC,而上調了RARA(圖4C-D)。有趣的是,SsD依賴的MYC和RARA的減少是由于FTO過表達細胞中mRNA和蛋白穩定性的降低(圖4E-4H)。綜上所述,這些結果證明了FTO及其下游靶點(如MYC,RARA)是FTO過表達白血病細胞中SsD的主要效應因子。

急性胰腺炎(AP)是**常見的炎癥性胃腸道疾病之一,在小鼠和人類模型中似乎通過外分泌腺泡細胞的再生而恢復。巨噬細胞是由組織損傷引發的炎癥和組織再生反應的重要驅動因素,包括***、自身免疫性疾病、機械或毒性損傷以及其他原因。在組織損傷時,骨髓(BM)衍生的巨噬細胞和/或組織駐留巨噬細胞被***并以促炎方式響應局部環境,然后迅速轉變為傷口修復表型。巨噬細胞的表型和作用已在急性和慢性胰腺炎中得到充分證明。然而,關于巨噬細胞如何調節損傷后的胰腺修復/再生,包括ADM和腺泡再分化,我們知之甚少。***講一篇關于巨噬細胞表型變化與AP炎癥相關的文章,該文章題名為:Macrophagephenotypicswitchorchestratestheinflammationandrepair/regenerationfollowingacutepancreatitisinjury,IF=5.737,一區雜志。有肝轉移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的PDAC患者。

越來越多的證據表明細胞外囊泡(EVs)通過促進實體**中**-內皮細胞之間的通訊來刺激血管生成。先前的研究表明miR-144是鼻咽*(NPC)細胞來源的EVs中的內含物之一,但EVs miR-144對**內皮細胞和血管生成的影響尚不清楚。2021年3月發表于“Molecular Therapy”(IF=11.454)的文章“miR-144 delivered by nasopharyngeal carcinoma-derived EVs stimulates angiogenesis through the FBXW7/HIF-1a/VEGF-A axis”對此展開了研究。本研究旨在探討**源性細胞外囊泡(EVs)在鼻咽*血管生成中的作用。我們初步采集鼻咽*活檢標本。提供整體課題外包實驗構思。江蘇課題實驗可參觀

阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配西藏課題技術指導

我們發現,在circMAPK1穩定下調的SGC7901和MGC803細胞中,與對照組相比,MAPK1-109aa與MEK1的結合明顯減少,而MAPK1與MEK1的結合增加(圖7f)。在MKN45和BGC823細胞中,IRES突變時MAPK1-109aa不翻譯。因此,MAPK1與MEK1的結合沒有明顯變化。然而,過表達circMAPK1后,MAPK1與MEK1的結合***減少,而MAPK1-109aa與MEK1的結合***增加(圖7g)。因此,以上結果表明MAPK1-109aa與MAPK1競爭結合MEK1。隨后的Western blot結果也證實,在過表達circMAPK1的細胞系中,MAPK1-109aa***升高,磷酸化的MAPK1/2降低,而在circMAPK1敲低的細胞中則相反(圖7h)。此外,MAPK1的下游效應因子,如p-ELK1、p-c-Fos、p-c-JUN和p-RSK,也被過表達的circMAPK1***抑制(圖7i)。這些結果表明,circMAPK1編碼的MAPK1-109aa通過抑制MAPK1信號通路發揮抑*作用。西藏課題技術指導

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