如圖5所示,E8中的d-flow改變了白細胞流量和炎癥標志物(Il1β、Il6、Ccl2和Ccl3);ECM調節(jié)(Adamts4, Lamb1, Timp3,和Timp4);血管調節(jié)(Nos3, Ptgs2,和Edn1);和脂質代謝(Tm6sf2、Lsr和Mgll),并與E2的s-flow進行比較(圖5A-5D)。這些結果表明,d-flow***了致***的內皮反應,同時通過改變轉錄和染色質可及性水平上的基因表達來抑制抗***通路。
三、體內血流依賴TF結合基序的鑒定
使用Signac和ChromVar軟件包通過我們的scATAC-seq數(shù)據(jù)集來識別流敏感的TF結合基序(圖6)。在每個內皮聚類(E1- E8)中識別出前20個TF結合基序,并繪制成熱圖(圖6A)。圖6B和6C顯示了TF結合基序和它們被發(fā)現(xiàn)的各自的細胞簇。 思路是您的操作我們來做。信號通路科研分子生物學實驗
HoxBlinc在造血中的轉基因表達導致小鼠的AML樣致死疾病
已有研究表明,小鼠造血干細胞(HSCs)中人源化NPM1c+敲入等位基因(NPM1c/+)的***會導致Hox基因過度表達、增強self-real和骨髓增生擴大,以及遲發(fā)性AML的發(fā)展。由于NPM1c+***HOXBLINC,而HOXBLINC對NPM1c+介導的轉錄程序和白血病發(fā)生至關重要,因此確定HOXBLINC的***是否足以導致異常造血和類似于NPM1c/+小鼠的髓系惡性**非常重要。HoxBlinc在長期(LT)和短期(ST)造血干細胞中表達高,在祖細胞(MPP,CMP和GMP)中表達降低,除了B220+B細胞,在成熟細胞系中進一步降低(圖2a)。HoxBlinc在造血中的表達模式提示該lncRNA可能在調控HSPC功能中發(fā)揮重要作用。為了研究HoxBlinc活化對體內正常造血和白血病發(fā)生的影響,構建了HoxBlinc轉基因(Tg)小鼠模型,在Vav1啟動子和增強子(HS321/45-vav載體)的控制下,將全長小鼠HoxBlinccDNA插入小鼠基因組,以確保轉基因在造血系統(tǒng)中的特異性表達(圖2b)。獲得2只HoxBlincTg小鼠。將該轉基因插入到Tg第1系18q染色體上Bin1基因的內含子中(圖2c)。BM細胞中HoxBlincRNA的表達水平分別是TgLine#1和#2內源性HoxBlinc表達水平的18倍和3倍(圖2d)。 脂肪生產芯片科研實驗外包英拜提供一年三節(jié)的購物卡津貼。
我們檢測到LPS處理的野生型小鼠原代肝細胞中Gsdmd-N明顯增加。相比之下,LPS處理不影響Caspase-11缺陷小鼠原代肝細胞的Gsdmd-N水平,且Gsdmd-N水平***低于野生型小鼠原代肝細胞。此外,LPS誘導野生型原代肝細胞中IL-1β(圖6E)、ALT(圖6F)和AST(圖6G)的表達。相反,在Caspase11缺陷的原發(fā)性肝細胞中,LPS誘導的IL-1β(圖6E)、ALT(圖6F)和AST(圖6G)的產生***減少。綜上所述,Caspase-11的缺失抑制了LPS誘導的Caspase-11和GSDMD的體外***。
npm1突變的AML原始病例中,免疫表型集群3和8的豐度明顯較高,這些集群3和8表型原始,由表達低水平的骨髓單核細胞分化標志物的CD34+ CD38lo(3)或CD34 CD38lo(8)細胞組成(圖4C, D,補充圖21)。非***白血病集群為CD34,但表達少量的骨髓單核細胞標記物。相比之下,npm1突變的急性髓細胞白血病committed 病例顯示出5個免疫表型集群(1,7,16,22和24)的豐度高于原始病例(圖4B, D)。這些免疫表型集群包括CD34?/lo CD38+ CD11c+細胞也表達CD33、CD14、CD16和HLA-DR的各種組合,顯示出異常的骨髓單核細胞分化(圖4C,補充圖21A)。在原始病例中,***原始免疫表型聚集的總豐度較低(平均值(9.4±11.4%),***分化免疫表型聚集(平均53±37%)。英拜提供生命科學內的一體化服務。
四、INPP4B促進pi3kα依賴的晚期核內體形成
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
對MCF-7細胞內溶酶體室的檢查顯示,GFP-INPP4B不影響eea1陽性的早期內溶體,但***增加了cd63陽性的晚期內溶體(2.5倍)和lamp1陽性的溶酶體(1.7倍)(圖4a,b)。
提示INPP4B促進晚期內吞體/溶酶體的形成。使用bsa-gold標記MCF-7細胞內溶酶體室,在電鏡下進行超微結構分析。GFP-INPP4B增加了類似晚期核內體的bsa陽性空泡結構的數(shù)量(圖4c)。利用染料淬滅的BSA(BSA-dq)檢測了運往溶酶體的貨物運輸,BSA-dq通過液相內吞進入內吞體,溶酶體水解酶隨后促進去淬和***熒光信號。GFP-INPP4B***增加了bsa-dq陽性結構的數(shù)量(2倍)(圖4d,e),表明INPP4B增強了內吞貨物通過晚期內吞體到溶酶體的運輸。相比之下,使用泛I類PI3K抑制劑BKM120、PI3Kα特異性抑制劑BYL719(補充圖5f)或使用兩種不同的siRNAs耗盡PIK3CA抑制GFP-INPP4B細胞中晚期核內體形成的增加(圖4f,g和補充圖5i,j)。 上海英拜生物的動物建模實驗。乙酸科研服務兩年
大黃酸能緩解D。SS誘導的小鼠慢性結腸炎。信號通路科研分子生物學實驗
6、MAO-A阻斷**免疫***-人類TAM和臨床數(shù)據(jù)相關性研究
為了探索MAO-A阻斷***的翻譯潛力,首先研究了MAO-A對人巨噬細胞極化的調控。分析體外培養(yǎng)的免疫刺激M1樣和免疫抑制M2樣人單核細胞源性巨噬細胞的基因表達特征。有趣的是,在所有檢測的免疫檢查點、免疫刺激和免疫抑制基因中,MAOA是M2樣單核來源巨噬細胞(MDMs)中表達水平比較高的基因(圖6a),提示MAO-A可能在促進人巨噬細胞免疫抑制極化中發(fā)揮作用。MDM培養(yǎng)的時間過程分析證實了巨噬細胞分化過程中MAO-A基因和蛋白表達上調,并在IL-4/IL-13誘導的免疫抑制極化后進一步上調(圖6b-d)。用苯乙肼阻斷MAO-A可***抑制IL-4/IL-13誘導的MDMs免疫抑制極化(圖6e-g)。綜上所述,這些體外數(shù)據(jù)表明MAO-A在人巨噬細胞中高表達,特別是在其免疫抑制極化期間,并且MAO-A阻斷具有重新編程人巨噬細胞極化的潛力。 信號通路科研分子生物學實驗
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗