了解流量調節內皮基因的表達在轉錄和體內外遺傳性染色質易訪問性水平,我們和其他人使用批量rna或dna從池獲得ECs暴露s-flow或維使用鼠標部分頸動脈結扎(PCL)模型或豬動脈。我們建立了PCL模型,并顯示在2周內,d-flow快速誘導,而s-flow阻止,高膽固醇小鼠***的發展。PCL模型包括結扎左側頸總動脈(LCA)的4個遠端分支中的3個以誘導d-血流,同時使用繼續暴露于s-血流的對側右側頸總動脈(RCA)作為內部控制。我們進一步開發了一種管腔沖洗方法,使我們能夠從PCL后的lca和rca中獲得內皮富集的rna和dna。然后用mRNA微陣列、microRNA微陣列和RNA測序(RNA-seq)分析這些聚合的整體RNA,以識別mRNA轉錄組和受ECs流量調節的microRNAs。英拜提供分子生物學以及免疫病理相關實驗。北京擬桿菌門科研
6)NOX4誘導的線粒體代謝損傷通過抑制人類星形膠質細胞的細胞抗氧化過程而誘導氧化應激
我們研究了NOX4誘導的線粒體代謝損傷是否可以通過抑制人體星形膠質細胞的細胞抗氧化過程來誘導氧化應激。與對照組相比,NOX4的升高***降低了谷胱甘肽(GSH)水平和谷胱甘肽/氧化谷胱甘肽(GSSG)的比值(圖6A和B)。NOX4的升高也增加了GSSG的水平(圖6C)。由于NOX4導致GSH減少以及GSH/GSSG比值降低,我們接下來研究NOX4是否可以影響人類星形膠質細胞中NRF2信號通路,這是細胞抗氧化反應的關鍵調控因子。與對照組相比,NOX4的升高抑制了NRF2在細胞質中的核易位(圖6D)。此外,NRF2靶基因HO-1和GCL的水平和活性在人星形膠質細胞中被NOX4過表達***抑制(圖6E和F)。這些結果表明,NOX4誘導的線粒體代謝損傷通過抑制人星形膠質細胞的細胞抗氧化過程而誘導氧化應激。 分子毒理通路發現者科研實驗外包英拜有一支高精尖的團隊。
總之,如Fig. 9,CRC來源的外泌體miR-934可通過下調PTEN表達和***PI3K/AKT信號通路誘導M2巨噬細胞極化。此外,外泌體miR-934極化的M2巨噬細胞可以通過CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR934正反饋環促進CRLM。因此,研究闡明了促進**細胞和TAMs相互作用的CRLM的新分子機制,這將有助于開發CRLM的有效預防和***策略。更重要的是,血清外泌體中miR-934高表達與CRLM相關,提示其可能是未來液體活檢和預測CRLM風險的一個有前景的生物標志物。此外,靶向外泌體miR-934介導的**細胞與TAMs之間的串擾可能為CRLM的***提供新策略。
為了了解白樺素和他汀類藥物的抗DIO作用,進一步分析了脂質吸收,體力活動和能量消耗。在洛伐他汀***的小鼠中,盡管呼吸商(RQ)增強,表明從體內利用葡萄糖和蛋白質進行能量生產已超過脂質氧化,但耗氧量和總能量消耗仍與WD喂養的小鼠相似(圖4F-4H)。另一方面,用洛伐他汀喂養的小鼠的糞便膽固醇和甘油三酸酯(TG)顯著增加(圖4C和4D),表明洛伐他汀降低脂質吸收或增加脂質排泄,從而拮抗DIO。這一觀察結果與以前的報告是一致的。另一方面,白樺素對脂質吸收/排泄沒有影響(圖4C和4D)。盡管每組小鼠的身體活動都相似(圖4E),但接受白樺素的小鼠的RQ升高(圖4F),其耗氧量和能量消耗也增加了(圖4G和4H),這可能有助于他們體重增加量的減少。同時,接受30 mg / kg /day白樺素的小鼠暴露于寒冷時顯示出更高的體溫(圖4I)。進一步的Q-PCR分析顯示,在經白樺素處理的小鼠中,棕色脂肪細胞組織(BAT)中的兩個關鍵生熱基因UCP-1和UCP-2升高(圖4J)。該觀察結果與關于UCP-1在n-SREBP-1c轉基因小鼠的BAT中顯著降低的報道是一致的。總之,這些數據表明,洛伐他汀可能通過減少脂質吸收/增加排泄來至少部分地預防DIO,而白樺素通過增加能量消耗來改善DIO。大黃酸處理改變腸道菌群組成。
與coaccessibilityscore較高的Cicero連接相比,coaccessibilityscore較低的Cicero連接在GeneHancerdoubleelite數據庫中的可能性較小(p<2.21016,卡的平方)。在近端曲小管內,大部分Cicero連接要么在啟動子區域內,要么在啟動子和另一個位置之間(圖3d),這種分布在其他細胞類型中也類似(補充圖11)。轉錄因子活性與轉錄因子表達有適度的相關性(Pearsonr2=0.36,p值=4.21012,圖3e)。推測motif活性與轉錄因子表達呈正相關的轉錄因子可能在DAR中扮演轉錄***因子的角色,而負相關的轉錄因子則扮演轉錄抑制因子的角色。令人驚訝的是,糖皮質***受體(NR3C1)的motif活性與表達呈正相關,而礦皮質***受體(NR3C2)則呈負相關(圖3f)。FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。乙酸科研服務兩年
鑒定的前列腺瘤細胞內源性雄***受體網絡。北京擬桿菌門科研
然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉錄譜(Fig. 4G)。使用pseudobulk RNA-seq分析和預轉移體外培養的基因比較,生成了持續細胞的基因標記,其標志是記憶相關基因(Sell,Foxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達和效應相關基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(Fig. 4H-I)。對先前的體外單細胞數據(Fig. 2H-J)的進一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續性特征的細胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig. 4J-K)。這些數據表明,抑制CDK4/6促進T細胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。北京擬桿菌門科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗