HoxBlinc在造血中的轉基因表達導致小鼠的AML樣致死疾病
已有研究表明，小鼠造血干細胞(HSCs)中人源化NPM1c+敲入等位基因(NPM1c/+)的***會導致Hox基因過度表達、增強self-real和骨髓增生擴大，以及遲發性AML的發展。由于NPM1c+***HOXBLINC，而HOXBLINC對NPM1c+介導的轉錄程序和白血病發生至關重要，因此確定HOXBLINC的***是否足以導致異常造血和類似于NPM1c/+小鼠的髓系惡性**非常重要。HoxBlinc在長期(LT)和短期(ST)造血干細胞中表達高，在祖細胞(MPP,CMP和GMP)中表達降低，除了B220+B細胞，在成熟細胞系中進一步降低（圖2a）。HoxBlinc在造血中的表達模式提示該lncRNA可能在調控HSPC功能中發揮重要作用。為了研究HoxBlinc活化對體內正常造血和白血病發生的影響，構建了HoxBlinc轉基因(Tg)小鼠模型，在Vav1啟動子和增強子(HS321/45-vav載體)的控制下，將全長小鼠HoxBlinccDNA插入小鼠基因組，以確保轉基因在造血系統中的特異性表達(圖2b)。獲得2只HoxBlincTg小鼠。將該轉基因插入到Tg第1系18q染色體上Bin1基因的內含子中(圖2c)。BM細胞中HoxBlincRNA的表達水平分別是TgLine#1和#2內源性HoxBlinc表達水平的18倍和3倍(圖2d)。 FMT處理對脊髓損傷后小鼠腸道屏障通透性有影響。西藏標書地區科學基金
6.分析hubgene與臨床免疫指標的相關性根據cBioPortal數據庫、TIMER數據庫對上述6基因進行進一步分析，并且計算了與CD8+T細胞浸潤水平的相關性，發現METTL8，HSPB3和ERLIN2）浸潤水平之間的***相關。
7.鑒定預后標志物通過基于GENT2數據庫的Meta生存分析，分析了METTL8，HSPB3和ERLIN2。結果表明，METTTL8和HSPB3的有較大的預后價值。使用Kaplan–Meier檢測了METTL8，HSPB3和ERLIN2的預后價值，結果表明METTL8和ERLIN2與負面預后***相關。接下來，選擇METTL8作為預后的生物標志物，以進行進一步的分析。
8.預后標志物METTL8基因富集分析根據METTL8表達水平的中位數，將基于TCGA數據庫的LSCC表達圖譜分為高水平組和低水平組以進行GSEA分析。
9.預后標志物METTL8的功能驗證在細胞中進行METTL8的敲低，結果表明METTL8的敲低可能抑制細胞凋亡、增殖能力，影響細胞周期。
在小鼠異種移植成瘤實驗中，進行METTL8的干擾，結果表明METTL8的敲低抑制**生長，一直細胞增殖和周期。
綜上， METTL8在LSCC**的免疫浸潤中起關鍵作用。 上海標書創新服務轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。
7.質譜/蛋白質組學證據
質譜法是準確鑒定和表征蛋白質的重要方法。已經進行了數個大規模質譜實驗來研究人類蛋白質組，但是即使考慮蛋白質的翻譯后修飾，也只能可靠地將約50％的MS指紋圖譜與人類mRNA編碼的已知肽匹配成功。這表明，非典型mRNA編碼了很大一部分“隱藏蛋白質組”，其中也包括了可能來自circRNA的編碼產物。作者通過設計新的分析流程，從蛋白質譜數據中挖掘分析了可能由circRNA編碼的多肽，并展示了所有原始質譜圖，這些質譜圖可支持circRNA編碼的跨接口位點的肽段。circRNA特異性ORF
1.肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11表達上調和***
為了探討Caspase-11在肝脂肪變性中的作用，我們首先檢測了肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11的表達。如圖1A所示，與正常小鼠相比，MCD誘導的肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11mRNA明顯增加。相應的，在MCD誘導的肝脂肪變性小鼠的肝臟中，pro-caspase-11(圖1B和C)和cleaved-caspase-11(圖1B和D)的蛋白水平均***上調。這些結果提示Caspase-11與肝臟脂肪變性呈正相關。
2.Caspase-11缺乏減弱MCD誘導的小鼠肝脂肪變性
為了評估Caspase-11對肝脂肪變性的潛在影響，我們在Caspase-11缺陷小鼠中誘導肝脂肪變性并監測表型。正常野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟組織學表現正常。野生型小鼠經MCD***后，肝臟出現明顯的脂肪變性和腫脹。與MCD處理的野生型小鼠相比，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的脂肪變性和腫脹明顯減少(圖2A)。相應的，與MCD處理的野生型小鼠相比，MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟脂肪變性評分(圖2B)和膨脹評分(圖2C)***降低。
水蘇糖可減少卵巢囊泡數量黃體形成.
10.EVs介導的ELNAT1與BCa淋巴結轉移相關
確定EVs介導的ELNAT1在BCa淋巴結轉移中的臨床意義十分重要。首先，作者發現來自BCa患者的尿中EVs與配對BCa組織的ELNAT1表達呈正相關，這意味著EVs介導的ELNAT1是BCa中ELNAT1調控的重要參與者（Figure10A）。同時，BCa患者的尿中EV介導的ELNAT1過表達與BCa的淋巴結轉移呈正相關（Figure10B）。EV介導的ELNAT1表達較高的BCa患者總生存期（OS）和無病生存期（DFS）率較短（Figure10C-D）。ROC分析顯示尿液中EV介導的ELNAT1可有效區分BCa患者與健康志愿者（Figure10E）。與尿液細胞學和FISH檢查結果相比，尿液中EVs介導的ELNAT1診斷BCa-LN轉移的準確性很高（Figure10F）。BCa患者血清中EVs介導的ELNAT1表達水平高于健康對照組（Figure10G）。與無淋巴結轉移的BCa患者血清相比，伴有淋巴結轉移的BCa患者血清中EVs介導的ELNAT1表達上調（Figure10H）。
結論：EVs介導的ELNAT1促進了BCa的淋巴管生成和淋巴結轉移。充分闡明EVs介導的ELNAT1***hnRNPA1/UBC9/ SOX18軸誘導BCa淋巴結轉移的精確機制，不僅將增加我們對EVs介導的淋巴結轉移的認識，也將有助于開發一種***BCa的有效策略。 研究腸道微生物組和宿主循環代謝產物之間的關系。內蒙古標書中標率高
circNDUFB2未***改變IGF2BPs的mRNA水平。西藏標書地區科學基金
2020年12月，埃默里大學在Cell Rep（IF=8.087） 雜志上發表了文章“Endothelial Reprogramming by Disturbed Flow Revealed by Single-Cell RNA and Chromatin Accessibility Study”。此報道在PCL后，使用從小鼠頸動脈腔內獲得的富含內皮細胞的單細胞和細胞核進行了scRNA-seq和scATAC-seq檢測，以確定d-flow和s-flow對基因轉錄本和染色質可及性譜的基因組和表觀基因組調控的差異影響。對scRNA-seq和scATAC-seq數據的單獨分析以及對兩個數據集的綜合分析顯示，即使在s-flow下，頸動脈內的ECs也是異質性的。D-flow***改變了內皮轉錄組和表觀基因組譜，將它們重新編程為炎癥細胞、間充質細胞、干細胞/祖細胞樣細胞、造血細胞和免疫細胞樣表型。此外，我們還發現了一種依賴于d-flow和s-flow的TF結合位點和順式調節元件的富集。西藏標書地區科學基金
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