10)M1-Exos在bEnd.3細胞中通過miR-155/SOCS6/p65軸上調ROS水平,損害線粒體功能
我們進行了一系列功能喪失和功能獲得實驗來研究miR-155/SOCS6/p65軸在調節線粒體功能中的作用。如圖10A-E所示,SOCS6過表達消除了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導的ROS水平(圖10A和B)、線粒體超氧化物含量(圖10C和D)和線粒體電位(圖10E)的升高。此外,SOCS6過表達***緩解了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos處理后的線粒體腫脹,并降低了線粒體碎片細胞的比例(圖10F和G)。進一步的結果表明,SOCS6過表達可挽救miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos處理導致的OCR、基礎呼吸、ATP產生、呼吸能力和呼吸逆轉的下降(圖10H和I)。miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos處理后沉默SOCS6則出現相反的結果(圖10J-R)。
結論:在本研究中,我們發現SCI后浸潤的巨噬細胞可通過傳遞外泌體miR-155促進EndoMT,損害線粒體功能,從而加重BSCB完整性,隨后通過抑制SOCS6誘導的p65降解,***NF-κB通路。我們的工作可能會加強對巨噬細胞和血管內皮細胞之間相互干擾的理解,并揭示脊髓損傷后BSCB完整性的潛在調節機制。 代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一。江蘇靶基因芯片科研
PTEN是一種**抑制因子,調節多種細胞功能,包括***,PI3K/AKT信號通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此,推測PI3K/AKT信號通路可能參與CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化。WB結果顯示過表達PTEN可以部分減弱miR-934和HCT-8細胞源外泌體對p-AKT和p-PI3K表達的增強作用,而沉默PTEN則相反(Fig.5k)。更重要的是,當與HCT-8細胞來源的外泌體和PI3K抑制劑(LY294002)共培養時,PMA處理的THP-1細胞中p-AKT和M2標記物(CD206、arginase-1和CD163)的表達下調(Fig.5l,m)。綜上所述,CRC細胞來源的外泌體miR-934可以通過下調PTEN表達和***PI3K/AKT信號通路誘導M2巨噬細胞極化。植物學科研實驗外包增加乳酸桿菌水平導致尿酸水平下降。
qRT-PCR結果表明,暴露于miR-144模擬物處理的鼻咽*細胞的HUVECs中miR-144上調,而暴露于miR-144inhibitor處理的鼻咽*細胞的HUVECs中miR-144下調(圖3C)。Transwell實驗結果表明,miR-144過表達EVs足以增強HUVECs的遷移和侵襲,而miR-144抑制EVs則表現出相反的趨勢(圖3D和3E)。此外,我們還通過傷口愈合實驗檢測HUVECs的增殖和遷移能力(圖3F)。結果顯示,與NC模擬EV組相比,miR-144模擬EV組細胞的創面愈合率升高,說明C666-1-和SUNE1細胞來源的EVmiR-144均促進HUVECs的增殖和遷移。與NC抑制EV組相比,miR-144抑制EV組的細胞創面愈合率降低,提示C666-1-和SUNE1EV細胞EVmiR-144抑制后,HUVECs的增殖和遷移受到抑制。
中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組和北京基因組研究所(國家生物信息中心)鮑一明研究組、張維綺研究組合作建立了AgingAtlas數據庫(./aging/index)。數據庫相關文章于2020年10月29日以“AgingAtlas:amulti-omicsdatabaseforagingbiology”為題在線發表于NucleicAcidsResearch雜志(IF=)。
AgingAtlas目前的實現包括五個模塊:轉錄組學、單細胞轉錄組學、表觀基因組學、蛋白質組學和藥物基因組學。此外,AgingAtlasConsortium還手動管理了一系列與衰老相關的人類和小鼠基因(GAAA)。GAAA部分現在包含數百個人類和小鼠衰老相關基因,分為10個“基因集”和相應的KEGG通路。基因組具有成熟的老化特征,包括基因組不穩定性、端粒磨損、表觀遺傳改變、蛋白質穩態喪失、線粒體功能障礙、營養感知失調、細胞間通訊改變、細胞衰老和干細胞衰竭。AgingAtlasConsortium的老年學**將GAAA中的每個基因都歸因于這些基因集。因此,GAAA提供了AgingAtlas的基準部分,以幫助用戶更好地解釋這些與衰老相關的基因的生物學意義。 專注于生命科學內的前沿研究。
6)FOXO3A通過調控乳腺*細胞中LINC00926的表達抑制增殖、遷移和侵襲,抑制糖酵解
我們研究了FOXO3A是否通過LINC00926調節這些效應。細胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過表達抑制了乳腺*細胞的生長,而LINC00926敲低則促進了細胞的生長(圖6A和6B)。重要的是,下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控細胞增殖的能力,表明FOXO3A主要通過表達LINC00926來降低乳腺*細胞的增殖。接下來,我們通過LINC00926檢測FOXO3A是否抑制細胞遷移、侵襲和糖酵解。如預期,FOXO3A減少了乳腺*細胞的遷移和侵襲(圖6C和6D)。敲除LINC00926**削弱了FOXO3A抑制細胞遷移和侵襲的能力。FOXO3A過表達抑制葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成,降低ECAR和增加OCR。然而,敲除LINC00926極大地減弱了FOXO3A調節細胞遷移、侵襲和糖酵解的能力(圖6C-6G)。綜上所述,FOXO3A抑制乳腺*細胞的遷移和侵襲,以及糖酵解主要依賴于LINC00926。 大黃酸處理沒有改變乳酸菌尿酸的產生。代謝綜合癥MS鼠模型科研地區科學基金
這些數據表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強。江蘇靶基因芯片科研
一、腦損傷改變了果蠅的大腦蛋白質組,擾亂了NCT蛋白和Nup蛋白水平
為了研究創傷性腦損傷的機制,我們使用了一個具有良好特征的創傷性腦損傷果蠅模型,該模型顯示了強大的表型,如TDP-43同源物(Tbph)、p62、應激顆粒和泛素病理,以識別和研究創傷性腦損傷后大腦蛋白質組的變化(圖1A)。對暴露于重復TBI的三齡果蠅幼蟲大腦中的2000個蛋白質進行了無偏性蛋白質組學分析(w1118),發現361個蛋白質在創傷損傷后發生了***變化(p 0.05,學生t檢驗)。基于基因本體論(GO)的復雜網絡分析在BiNGO (Cytoscape 3)中對tbi相關腦蛋白質組與非tbi對照進行了關聯分析,確定了不同類別的改變蛋白,其中大多數上調(圖1B和C;圖1圖補充1A-E;補充文件1和3)。TBI后上調的比較高類別是微管細胞骨架、蛋白質折疊和蛋白酶體。此外,我們還鑒定了涉及**白復合體和剪接體的蛋白質。核孔復合體(NPC)和NCT通路的組成部分是tbi后上調的主要蛋白子集(圖1圖補充1F)。 江蘇靶基因芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗