使用測量細胞一致性的活細胞成像作為細胞生長和擴散的代理,來測試SMARCA4消耗的影響是否轉化為VCaP細胞生長的改變。如圖5所示,在沒有雄***的情況下,SMARCA4刪除并不影響細胞的生長,而在有雄***的情況下,它降低了細胞的相對融合,盡管程度低于去除AR。SMARCA4刪除同樣會降低LNCaP細胞的相對融合。
四、SIM2沉默改變了arb亞群的染色質可及性
SIM2沉默降低了2434個arb染色質可及性,三分之二受siSIM2影響的arb在雄***暴露前可及(圖6a c中可獲得),而其余在雄***暴露后可及(圖6a c中重新獲得)。根據ChIP-SICAP數據,siim2受影響的位點中**富集的motif是ARE,盡管其在這些位點的富集程度低于未受siim2影響的位點(NC位點,圖6d)。AR、FOXA1、ERG和HOXB13在sisim2影響的位點的標簽密度與NC位點相比均呈上升趨勢(圖6e),表明SIM2是一種與AR協同的TF。 soRNA測序的 整套服務。lncRNA課題檢測服務
創傷性腦損傷(TBI)是重要的健康問題,每年有超過5000萬新發TBI病例。在TBI的病理生理過程中,會發生各種形式的細胞死亡,包括細胞凋亡,壞死,程序性壞死,自噬,焦亡和鐵死亡。目前尚未充分挖掘TBI中鐵死亡的發病機理。***我們講一篇蘇州大學團隊在JOURNALOFPINEALRESEARCH(IF=)期刊發表的題名為DeletionofferritinHinneuronscounteractstheprotectiveeffectofmelatoninagainsttraumaticbraininjury-inducedferroptosis的文獻。該文獻主要講述褪黑素通過FTH調節TBI中鐵死亡。褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡,在相應的高峰表達(例如1天和3天)進行了與鐵死亡相關蛋白的蛋白質印跡分析。發現褪黑素給藥在TBI后1天***了TBI誘導的xCT,Cox2,Tfr1,Fpn和Nox2蛋白表達的上調。同樣,褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth,Ftl和4HNE蛋白的表達。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1(Lip-1)也獲得了相似的結果。此外,免疫組化染色顯示,與對照組相比在TBI后第7天,褪黑素和Lip-1的處理減少了神經元中4HNE陽性細胞的數量,表明褪黑素對TBI誘導的脂質具有神經保護作用過氧化。褪黑素和Lip-1均***TBI誘導的皮質GSH水平降低。 帕金森小鼠模型課題產學研合作高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉移的很有前途的生物標志物。
這可能部分解釋了第3天巨噬細胞的增加。此外,流式細胞術數據顯示M2樣巨噬細胞(CD206+IL4RA+)的百分比在第1天(急性炎癥期)下降并從第3天開始增加(ADM階段),而這些M2樣巨噬細胞的數量在第3天達到峰值,然后迅速減少。此外,流式細胞術數據與免疫熒光分析一致,其中F4/80+CD206+細胞在第3天**豐富。
接下來,我們想知道這些CCR2+單核細胞/巨噬細胞是否可以在胰腺損傷后重新編程為M2樣巨噬細胞。在植入和誘導AP8周后,我們發現第3天的增殖巨噬細胞(Ki67+)主要來自CCR2WT小鼠。與來自CCR2KO小鼠的巨噬細胞相比,來自CCR2WT小鼠的巨噬細胞表現出更高的CD206和IL4RA表達水平。綜上所述,結果表明,ADM階段的M2樣巨噬細胞主要來源于CCR2+單核細胞/巨噬細胞,這些細胞在AP早期募集。
2)circPDE4B調節軟骨細胞活力和ECM代謝
為了評估circPDE4B在ECM代謝中的作用,我們分別用三種circPDE4BsiRNA轉染HCs(圖2A)。我們使用CCK-8方法評估了circPDE4B對軟骨細胞活力的影響。結果顯示,敲低circPDE4B的表達降低了軟骨細胞的活力(圖2B)。此外,shRNA腺病毒抑制circPDE4B***提高了MMP3、MMP13和ADAMTS4的表達,而SOX9、COL2A1(或COL2蛋白)和aggrecan在HCs/MCs中的表達下調(圖2C和圖2D)。免疫熒光進一步證實,circPDE4B敲除影響了HCs/MCs的MMP3、MMP13、COL2和aggrecan水平(圖2E、F)。同時,HCs的阿爾新藍染色顯示,circPDE4B抑制導致軟骨細胞功能障礙,蛋白多糖藍染較少(圖2G)。然后通過CCK-8實驗(圖2H)發現,過表達circPDE4B增加了軟骨細胞的活力。在過表達circPDE4B-HCs中,MMP3、MMP13和ADAMTS4的mRNA和蛋白水平下調,SOX9、COL2A1(或COL2蛋白)和aggrecan的mRNA和蛋白水平上調(圖2I-L)。此外,HCs的阿爾新藍染色表明,與單獨IL-1β***相比,circPDE4B過表達和IL-1β共處理減少了軟骨破壞(圖2M)。這些數據表明,circPDE4B/circPde4b在HCs中可以促進細胞活力,抑制分解代謝作用。 提供生物醫學領域內的課題思路設計。
1、循環miR-208b是CRC中FOLFOX化療敏感性的一種很有前途的生物標志物如圖1所示,作者設計了一項多期研究,以確定新的血清miRNAs作為預測和監測奧沙利鉑聯合亞葉酸和5-FU(FOLFOX)化療反應的替代標志物。
作者檢測了69個化療敏感和47個化療不敏感患者的血漿中miR-208b表達,結果顯示與未響應組相比,miR-208b的表達水平在響應組***下調(圖2A-B)。同時檢測了血清*胚抗原(CEA)水平,血清miR-208b的曲線下面積(AUC)與血清CEA的AUC相比,優于血清CEA水平。在化療響應組,在化療前miR-208b的表達高于化療后,而在未響應組,化療前低于化療后水平(圖2C)。生存分析顯示,無進展生存期化療響應組***高于未響應組,miR-208b低表達組***高于高表達組(圖2D)。這些結果表明miR-208b可作為預測CRC中FOLFOX化療敏感性的非侵襲性標志物。 提供分子生物以及到后續動物建模的一整套服務。課題整包課題
英拜生物對整體實驗實施的全局把控。lncRNA課題檢測服務
以上數據提示,miR-934異常高表達與結直腸***進展及肝轉移***相關。生存分析顯示,與miR-934表達較低的患者相比,miR-934表達較高的患者總生存期(OS)和無病生存期(DFS)較低(Fig.1f,g)。因此,在CRLM患者中,miR-934高表達與CRLM進展和預后不良呈正相關。
2、miR-934存在于CRC細胞衍生的外泌體中
miR-934在HCT-8和LoVo的CM中的表達***高于其它細胞(Fig.2a)。隨后,研究發現HCT-8和LoVo的CM中miR-934的表達***高于細胞核和細胞質(Fig.2b,c)。并且,miR-934在CM中的表達不隨RNaseA的處理而改變,而隨RNaseA+TritonX-100的處理***下降(Fig.2d),這表明細胞外的miR-934被膜包裹,而不是直接分泌。因此,推測miR-934可能是被外泌體傳輸。電鏡和納米顆粒追蹤分析表明,miR-934表達水平較高的CRC細胞分泌的外泌體比miR-934表達水平較低的CRC細胞分泌的外泌體更多(Fig.2e,f)。各組外泌體標志物CD9,ALIX,TSG101均被WB檢測到(Fig.2g)。 lncRNA課題檢測服務
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗