重慶樹突和抗原呈遞細胞芯片科研

來源: 發布時間:2021-11-11

CircRNF13通過SUMO2抑制NPC的增殖和轉移

***,作者進行了拯救實驗,如圖8A-D所示,抑制circRNF13會促進NPC的生物學功能,包括增殖,遷移和侵襲,但是過表達SUMO2會***挽救circRNF13敲除帶給NPC細胞的表型改變。免疫組化顯示,SUMO2在circRNF13過表達裸鼠**切片中低表達,而GLUT1則***高表達。以上證實circRNF13通過SUMO2抑制NPC的增殖和轉移。

總之,這些結果強調了circRNF13在鼻咽*增殖和轉移中的重要意義。CircRNF13作為抑*因子直接與SUMO2的3 -UTR結合,延長了SUMO2 mRNA的半衰期。上調SUMO2通過GLUT1的泛素化來促進GLUT1降解,這些通過抑制糖酵解調控AMPK-mTOR通路,**終導致鼻咽*的增殖和轉移。 尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。重慶樹突和抗原呈遞細胞芯片科研

確定關鍵驅動突變在原始和committed亞型中的分布(圖1C,補充討論中的亞型和突變部分和補充表6 17)。盡管亞型中富含某些突變(原始組的FLT3-ITD和承諾組的DNMT3A),驅動突變的遺傳改變對原始和committed亞型的預測較差(補充圖3 16和補充討論),基因突變和亞型之間的Matthews相關系數(MCC)較低(FLT3-ITD的MCC = 0.32, DNMT3A的MCC = 0.16;在precision-recall曲線(AUPRC = 0.62)值下,突變與亞型之間的多變量分析得到一個薄弱區域(Supplementary Fig. 7)。線粒體科研服務兩年嘌呤在細胞中執行許多重要的功能。

2)M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細胞的EndoMT

我們評估了M1-BMDMs對bEnd.3細胞的影響。結果表明,M1-BMDMs條件培養基(M1-CM)***降低了bEnd.3細胞TEER值(圖2A),并增加通透性(圖2B)。此外,TJs蛋白熒光染色顯示,M1-CM處理***降低了bEnd.3細胞膜ZO-1和Occludin的表達(圖2C和D)。為了進一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內皮細胞的TJs,我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預處理M1-BMDMs。我們發現,加入GW4869部分逆轉了M1-CM誘導的TEER值的下降(圖2A),滲透率增加(圖2B);GW4869也逆轉了TJs蛋白熒光強度下降的趨勢(圖2C和D)。相應的,TJs蛋白表達水平也出現了類似的結果(圖2E)。有趣的是,通過對脊髓切片中的α-SMA和CD31進行共染色,我們發現損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細胞形態,分枝減少,胞體拉長(圖2H)。此外,M1-CM暴露***降低了CD31的表達,并強烈增強了EndoMT標記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細胞中的表達(圖2I)。然而,GW4869可以部分扭轉這些影響。綜上所述,外泌體可能介導巨噬細胞和血管內皮細胞之間的相互作用,并可能是巨噬細胞誘導血管內皮細胞EndoMT的原因。

為了確定s-flow和d-flow在體內單細胞分辨率下對ECs基因轉錄表達和染色質可及性譜的全基因組影響,我們使用小鼠PCL模型進行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結扎,以暴露于血流的對側RCA作為對照,在LCA中誘導d-血流。部分結扎后2天(2D)和2周(2W), rca (2D- r和2W- r)和lca (2D- l和2W- l)用膠原酶酶解獲得單個細胞和單個核,分別用于scRNA-seq和scATAC-seq。

在標準化之后,一個基于無監督圖的聚類將細胞劃分成組,通過統前列形近似和投影(UMAP)圖可視化(圖1A)。我們的UMAP分析確定了16個獨特的細胞簇以流和時間依賴的方式分布(圖1A和1B)。每個細胞簇都是用確定的標記基因進行鑒定(1C).發現8個EC簇(E1E8)、血管平滑肌細胞(SMCs)、成纖維細胞(Fibro)、4個單核/巨噬細胞(macrophages14)、樹突狀細胞(DCs)和T細胞。通過Pecam1、Icam2、Cdh5和Tie1的表達來鑒定EC簇。smc特異性標記為Cnn1、Myl9和Speg。同樣,Medag、Dpep1和Lum作為纖維的標記物;巨噬細胞C1qa,C1qb,C1qc,C5ar1;DCs的Ccr7和Mmp25;T細胞的Itk(圖1C)。


這些數據表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強。

5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯體,通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾

為了探索ELNAT1誘導BCa淋巴轉移的分子機制,我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞(Figure5A),由于SUMOylation已經被證明可以調節特異性RNA的識別,并參與RNA分選進入EVs的過程,因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關靶基因。在受ELNAT1調控的925個基因中,作者發現UBC9是SUMOylation相關基因變化*****的(Figure5B-D)。接著通過RNA純化(ChIRP)檢驗ELNAT1與UBC9中P1(153~143bp)啟動子區域存在生理相互作用(Figure5E,F)。CD光譜證實ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個***的正峰,在210nm處有一個負峰。在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發現(Figure5G,H)。FRET技術分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比,熒光強度發生了巨大的變化:從520nm到570–580nm,熒光強度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TTS1集團,這與FENDRR/PITX2陽性對照組類似(Figure5I,J)。 文章使用FMT(糞微生態移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對結腸炎有療效。廣州智力障礙拷貝數科研

上海英拜生物設有專業的武漢技術中心。重慶樹突和抗原呈遞細胞芯片科研

USP35敲除增加了脂質活性氧的產生和丙二醛的產生(圖2D)。過量的活性氧導致多不飽和脂肪酸氧化損傷并分裂成各種產物,包括HETEs。我們觀察到,USP35沉默促進了H460和H1299細胞中5-HETE、11-HETE和15-HETE的釋放,而不影響12-HETE的釋放(圖2F)。GSH/GPX4為基礎的ROS***機制在防止鐵缺乏期間的脂質過氧化中起著不可或缺的作用。研究表明在USP35缺乏的細胞中GSH水平降低并伴隨著對GPX4活性的抑制(圖2G,H)。此外,shUSP35***細胞中的鐵和Fe2+水平***高于對照組。相比之下,補充GSH或鐵螯合劑***減少了shUSP35***細胞的細胞死亡和集落形成(圖2K,L)。因此,我們得出結論,鐵死亡有助于USP35敲除誘導的肺*細胞死亡。


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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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