點擊該基因的名稱,將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻中的更多詳細信息。***,在“詳細信息”部分中總結了有關疾病,細胞類型和基因的詳細信息。SC2disease還提供了從基于單細胞的結果和基于GWAS的結果得出的疾病的易感基因。所有GWAS數據均從GWAS目錄獲得。以2型糖尿病為例,將通過單擊“可視化”顯示由scRNA-seq和GWAS檢測到的易感基因列表。此外,可通過單擊“可視化”以可視方式顯示結果。在所得圖中,x軸是從GWAS結果獲得的基因中SNP的**小P值。y軸是從scRNA-seq結果獲得的疾病的重疊敏感性基因的細胞類型。條的顏色顯示基因表達的log 2倍變化。結腸炎也會導致促炎細胞因子或趨化因子的增加。造血微環境損傷模型科研國家自然科學基金
***的shrna介導的Hrs耗散(補充圖6a, b)導致gfp載體細胞中cd63陽性晚期核內體減少,并將GFPINPP4B細胞中晚期核內體形成增加的水平逆轉為gfp載體控制水平(圖5a, b)。在非錨定細胞生長試驗中,耗用Hrs shRNA對gfp載體軟瓊脂集落的大小沒有影響,但減少了GFP-INPP4B細胞集落的大小,這與Hrs依賴的細胞增殖一致(圖5c, d)。將MCF-7細胞注射到雌性BALB/c裸小鼠腹股溝第四乳腺脂肪墊中,在體內檢測**生長的hrs依賴性。與GFPvector相比,GFP-INPP4B在體內**體積和體外**重量***增加(3倍)(圖5e g)。雖然敲除Hrs沒有影響gfp載體**的大小和重量,但GFP-INPP4B**的增強生長被減少Hrs抑制(圖5e g),表明INPP4B促進pik3a突變ER+乳腺*細胞的增殖和**生長以hrsdependence的方式。細胞死亡通路發現者科研實驗外包英拜生物擁有一支高精尖的技術豐富的技術團隊。
6、MiR-199a-5p改善MRL/lpr小鼠疾病
接下來,在體內評估了miR-199a-5p對MRL/lpr小鼠的影響。17周齡MRL/lpr小鼠每4天注射20nmolmiR-199a-5pagomir或對照(agomirnc),共4周(圖6A)。末次注射后48h處死小鼠,分離脾臟CD4+T細胞。與對照組相比,miR-199a-5pagomir處理組顯示miR-199a-5p水平升高(圖6B),Sirt1表達降低(圖6C),衰老標志物p21和p16的表達***上調(圖6D)。這些數據表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p增加MRL/lpr脾CD4+T細胞衰老。
接下來,研究系統給予miR-199a-5p agomir是否能挽救MRL/lpr小鼠的狼瘡表型。與agomir nc組相比,miR-199a-5p agomir處理組脾臟和淋巴結明顯縮小(圖7A-B),血清中anti-dsDNA抗體、IgG水平下降(圖7D-E)。血清ANA水平有下降趨勢(圖7C)。miR-199a-5p agomir處理組的腎損傷,表現為尿蛋白下降(圖7F),腎小球增大和細胞增生減少(圖7G),外周***袢中IgG沉積減少(圖7h)。綜上所述,這些數據表明hUC-MSCs移植通過miR -199a-5p介導的Sirt1信號下調從而增加脾CD4+ T細胞的衰老,改善MRL/lpr小鼠的疾病表型。
2)SsD響應相關基因和通路的鑒定
為了進一步確定可能與白血病細胞中SsD敏感性相關的潛在靶點,我們對SsD處理過的NB4細胞進行了RNA測序。我們共發現3732個上調基因和3442個下調基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機制,我們進行了富集分析并研究了差異基因相關的通路。我們篩選了上調和下調基因富集的**個通路(圖2B)。此外,我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號通路(圖2C)。我們的數據顯示,SsD處理導致MYC靶點、E2F靶點和G2M檢查點信號級聯受到抑制。有趣的是,這些發現與FTO抑制劑和內源性FTO的下調抑制的信號通路相一致。因此,SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制細胞周期和增殖(圖2D-E)。此外,絕大多數通過FTO敲低而上調的信號通路對SsD富集,同樣,絕大多數被SsD抑制的信號通路也被FTO敲低而抑制(圖2F)。更重要的是,SsD介導的m6A相關基因的變化具有***的一致性(圖2G)。綜上所述,SsD可能參與了FTO介導的m6ARNA甲基化途徑。 思路是您的操作我們來做。
DREIMT整合了來自LINCS L1000 數據集的 4,694 個藥物概況和來自多種資源的 2,687 個免疫基因表達特征,以生成藥物——免疫特征關聯數據庫。除此以外,DREIMT 還可以根據用戶提供的免疫特征對藥物關聯進行優先排序。
該模塊可以查詢特定的基因,也可以上傳數據進行分析。如果使用基因列表進行查詢,則需要輸入15-200個與DREIMdb藥物譜基因匹配的基因名。結果圖、表可以進行下載。tau>90且FDR<0.05的基因為比較好候選基因。
該模塊是通過測試用戶提供的基因表達特征和DREIMTdb特征之間是否存在顯著的基因重疊來探索**相似的藥物關聯。
在該模塊可以根據細胞類型、藥物作用、藥物名稱等信息查詢該數據庫中相關信息。結果頁面中,可以點擊相關列跳轉至參考文獻等頁面。 上海英拜生物提供可靠可信可參觀的實驗平臺。廣州ampk信號通路芯片科研
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5)Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用
此前,我們發現IGF-1可以通過誘導補體C1q結合蛋白(C1QBP)從細胞質轉位到膜上,驅動CD44v6/C1QBP復合物的形成,從而***IGF-1下游通路。因此,我們很想知道C1QBP是否通過CD44v6相互作用參與Pex誘導的HSC活化。我們的結果表明C1QBP在Pex中的表達明顯高于Npex(圖6A)。如圖6B所示,C1QBP在Pex孵育的HSCs中表達高于Npex組。同時,與Pex處理的細胞相比,C1QBP-kdPex處理HSCs后C1QBP蛋白水平***降低(圖6B)。與Pex轉移的CD44v6在HSCs中的位置一致,膜中也檢測到C1QBP,并與Pan-cadherin共定位(圖6C)。這些數據表明,C1QBP可以通過Pex傳遞到HSCs膜。免疫電鏡顯示CD44v6和C1QBP在Pex***表達(圖6D)。同時過表達CD44v6和C1QBP后,Co-IP檢測顯示CD44v6和C1QBP在Pex中相互作用(圖6E)。此外,通過近距離連接(圖6F)和免疫熒光分析(圖6G),我們發現了CD44v6和C1QBP在Pex孵化的HSCs膜上的結合。這些發現表明,CD44v6在傳遞外泌體CD44v6/C1QBP復合物中起重要作用。 造血微環境損傷模型科研國家自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗