2IFNγ也會促進PD-L1-Lnc的表達已有研究發(fā)現(xiàn)，T細胞分泌的IFN-γ（干擾素-γ）能上調(diào)PD-L1mRNA和蛋白的表達，那么**細胞是否能連接T細胞表面的PD-1進而抑制細胞免疫有待進一步驗證。與PD-L1-mRNA相比，PD-L1-Lnc在638-744和832-899處存在缺失，進一步假設(shè)IFNγ會增強PD-L1-Lnc的轉(zhuǎn)錄。為進一步驗證，在沒有IFN-γ的前提下對五個細胞系中的PD-L1蛋白含量、PD-L1mRNA，以及PD-L1-Lnc水平進行檢測，結(jié)果發(fā)現(xiàn)IFNγ確實能極大地促進PD-L1蛋白的表達。5個肝*細胞系中進行IFNγ***也明顯提高了PD-L1mRNA的表達水平，為了進一步研究PD-L1-Lnc在肺*細胞中的分布，從A549細胞系中分離純化了PD-L1-Lnc，分離的細胞核和細胞質(zhì)部分都表現(xiàn)出高水平的標(biāo)記蛋白，組蛋白H3和***DH證實了分離產(chǎn)物中細胞核和細胞質(zhì)富集的富集情況，RT-PCR結(jié)果顯示IFNγ處理上調(diào)細胞核和細胞質(zhì)中PD-L1-Lnc和PD-L1mRNA的表達。英拜提供分子生物學(xué)以及免疫病理相關(guān)實驗。細胞核仁科研服務(wù)兩年
3、外泌體S100A4是HCC細胞轉(zhuǎn)移潛力的關(guān)鍵增強子
為了探究通過HMH-exo增強HCC轉(zhuǎn)移能力的關(guān)鍵，作者對LMH-exo和HMH-exo進行了iTRAQ質(zhì)譜篩選。結(jié)果從HMH-exo中鑒定到116個***上調(diào)和43***下調(diào)的蛋白質(zhì)；結(jié)果發(fā)現(xiàn)了4個蛋白家族的聚類：Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結(jié)合蛋白家族（圖3a-b）。經(jīng)過文獻分析，作者主要關(guān)注了S100鈣結(jié)合蛋白家族，并以其中*****差異表達的4個蛋白為主：依次是S100A4，S100A6，S100A10，和S100A11。作者檢測了這4個蛋白在5個HCC細胞系外泌體中的表達豐度，結(jié)果發(fā)現(xiàn)依然是S100A4的表達水平比較高（圖3c）。因此，初步選擇S100A4進行下一步分析。 上海修復(fù)甲基化科研METTL14是其***的潛在靶點。
CircCwc27下調(diào)可預(yù)防APP/PS1小鼠Aβ沉積及相關(guān)的神經(jīng)退行性影響行為測試后，進一步探索CircCwc27對AD病理的影響。研究中用抗Aβ抗體對APP/PS1小鼠的腦切片進行染色，結(jié)果顯示，注射LV-shCircCwc27的小鼠斑塊負荷明顯減輕，還發(fā)現(xiàn)注射LV-shCircCwc27后，皮質(zhì)和海馬的可溶性和不可溶性aβ40和aβ42也持續(xù)減少。此外，APP/PS1小鼠中，CircCwc27的表達與Aβ40和aβ42的水平呈正向關(guān)。鑒于LV-sh-CircCwc27注射液對斑塊沉積的保護作用，我們通過LAMP1抗體免疫染色檢測了CircCwc27敲低是否影響軸突萎縮，因為在AD小鼠模型中，LAMP1陽性營養(yǎng)不良神經(jīng)突與Aβ斑塊密切相關(guān)。我們發(fā)現(xiàn)注射LV-sh-CircCwc27的小鼠海馬中Aβ與營養(yǎng)不良神經(jīng)突共定位的面積***減少(Figs.3H)。此外，還確定了CircCwc27對突觸完整性的，LV-sh-CircCwc27注射并不影響突觸相關(guān)蛋白的表達，而在APP/PS1小鼠中則***防止突觸相關(guān)蛋白降低(Figs.3I)。小鼠腦切片免疫熒光染色進一步證實了上述結(jié)果。神經(jīng)炎癥是AD的另一個重要病理標(biāo)志。研究中注射LV-sh-CircCwc27***降低了APP/PS1小鼠小膠質(zhì)細胞和星形膠質(zhì)細胞的活性(Figs.3J)。以上結(jié)果表明，敲除CircCwc27在AD的神經(jīng)炎癥和神經(jīng)退行性影響中具有保護作用。
PTEN是一種**抑制因子，調(diào)節(jié)多種細胞功能，包括***，PI3K/AKT信號通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此，推測PI3K/AKT信號通路可能參與CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細胞極化。WB結(jié)果顯示過表達PTEN可以部分減弱miR-934和HCT-8細胞源外泌體對p-AKT和p-PI3K表達的增強作用，而沉默PTEN則相反（Fig.5k）。更重要的是，當(dāng)與HCT-8細胞來源的外泌體和PI3K抑制劑(LY294002)共培養(yǎng)時，PMA處理的THP-1細胞中p-AKT和M2標(biāo)記物(CD206、arginase-1和CD163)的表達下調(diào)（Fig.5l,m）。綜上所述，CRC細胞來源的外泌體miR-934可以通過下調(diào)PTEN表達和***PI3K/AKT信號通路誘導(dǎo)M2巨噬細胞極化。結(jié)腸炎也會導(dǎo)致促炎細胞因子或趨化因子的增加。
6.ELNAT1通過UBC9誘導(dǎo)的hnRNPA1的SUMOylation被封裝到EVs中
UBC9可以催化靶蛋白的SUMOylation來調(diào)節(jié)它們與生物分子的相互作用和細胞運輸。Figure6A顯示，通過co-IP分析，觀察到一個明顯的15~25kDa條帶被hnRNPA1特異性富集。此外，IP分析顯示UBC9過表達增強了hnRNPA1的SUMO2連接，表明UBC9誘導(dǎo)hnRNPA1的SUMOylation（Figure6B）。將hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點賴氨酸3（K3）和賴氨酸113（K113）用精氨酸替代（Figure6C），并通過co-IP分析表明，證明了hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點是K113（Figure6D）。ELNAT1過表達上調(diào)了hnRNPA1K113的SUMO化，而敲除UBC9則消除了這個影響（Figure6E）。 METTL14的上調(diào)可以通過m6A修飾降低PERP水平。深圳輸卵管阻塞科研
降低腸上皮細胞尿酸的產(chǎn)生。細胞核仁科研服務(wù)兩年
METTL3增強APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結(jié)合抑制APC表達
YTHDF1-3介導(dǎo)mRNA降解，針對YTHDF1的抗體進行RIP分析，實時定量PCR分析顯示，在KYSE180中，與APCmRNA結(jié)合的YTHDF2的數(shù)量遠遠多于YTHDF1和YTHDF3的數(shù)量，并且由于METTL3缺失而減少。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A，在很大程度上促進了YTHDF2與APCmRNA的結(jié)合。
為了研究YTHDF2與APCmRNA結(jié)合在APC表達中的作用，我們?nèi)コ薡THDF2，這增加了KYSE450細胞中APC的mRNA（圖5d和補充圖5e）和蛋白質(zhì)表達。YTHDF1–3的聯(lián)合缺失進一步增加了這些細胞中APC的mRNA和蛋白質(zhì)表達。此外，還進行了熒光素酶報告子分析，結(jié)果表明，缺失YTHDF2增強了由含m6A的WTAPCCDS序列驅(qū)動的熒光素酶活性，而突變的APC增強了熒光素酶活性，并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調(diào)節(jié)。此外，METTL3過表達抑制由WTAPCCDS序列驅(qū)動的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復(fù)，其不影響突變的APC增強的熒光素酶活性。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A，隨后的YTHDF結(jié)合抑制了APC的表達。 細胞核仁科研服務(wù)兩年
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學(xué)實驗