7)在體外,上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬
自噬已被證實在AKI中發揮重要作用。因此,自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中,自噬相關指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示,上調UCP1消除AKI中的脂質積累后,細胞自噬得到促進(圖7C)。基于這些發現,為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性,我們進行了功能恢復實驗。如圖7D-F所示,氯喹抑制自噬***逆轉了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣,TUNEL染色顯示,使用氯喹抑制自噬,可以明顯逆轉UCP1促進的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結果表明,脂質積累通過作用于AKI細胞自噬,在調節細胞功能方面發揮著重要作用。 circNDUFB2敲低可降低細胞培養上清液中這些細胞因子的水平。成都可參觀實驗標書
由于p65轉位到細胞核并促進其靶向基因的轉錄,假設NFκB/p65信號通路的***可通過p65的轉錄活性上調miR-934表達。在p65和miR-934啟動子之間發現了5個潛在的轉錄結合區域和2個特異性結合位點(Fig. 8d)。隨后,用miR-934啟動子中含有p65結合區域的載體轉染SW480和RKO細胞;ChIP實驗證明p65對miR-934的轉錄在-2002和-1500 bp(區域1)之間的區域內***增高,在其他四個結合區域中未觀察到明顯變化(Fig. 8e)。這些數據表明,區域1可能在調節CRC細胞中p65介導的miR-934轉錄誘導中起關鍵作用。熒光素酶報告基因檢測證實p65對SW480和RKO細胞中miR-934啟動子的轉錄影響(Fig. 8f)。作者發現只有突變結合位點1可以下調p65的熒光素酶報告基因活性,抑制miR-934的轉錄表達,這證明p65可以通過結合位點1正向直接調節miR-934的表達(Fig. 8f)。此外,作者證明了SW480和RKO細胞中的突變結合位點1可以消除CXCL13的促進作用和NFκB/p65信號對miR-934表達的抑制作用(Fig. 8g,h)。綜上所述,這些結果證明CXCL13/CXCR5/NFκB/p65信號通路促進CRC細胞中miR-934的轉錄,形成一個正反饋回路,參與持續的M2巨噬細胞極化和CRC細胞的侵襲和轉移。肝損傷標書服務兩年GO和KEGG分析顯示circNDUFB2觸發免疫防御和I型干擾素(IFNs)信號。
5)缺氧主要通過FOXO3A轉錄抑制LINC00926的表達,***PGK1的表達
由于缺氧是**的一個關鍵現象,我們確定了LINC00926/PGK1軸是否在缺氧下糖酵解的調節中發揮作用。缺氧刺激了PGK1在mRNA和蛋白水平上的表達,并降低了LINC00926的表達(圖5A)。為了確定缺氧如何抑制乳腺*細胞中LINC00926的表達,我們研究了缺氧后對LINC00926啟動子的抑制。對不同的LINC00926啟動子缺失報告基因的分析顯示,啟動子區域在300-200bp之間包含一個缺氧抑制元件(圖5B)。該區域假定的FOXO3A結合位點的突變會導致抑制的喪失。在常氧或缺氧條件下,FOXO3A影響LINC00926和PGK1的表達,說明FOXO3A是LINC00926調控的特異性轉錄因子(圖5C和5D)。ChIP分析表明,在常氧條件下,FOXO3A被募集到LINC00926啟動子內包含FOXO3A結合位點的區域,但沒有被募集到LINC00926啟動子上游的區域,在缺氧條件下募集減少(圖5E)。FOXO3A提高了LINC00926水平,降低了PGK1水平,而且重要的是,在正常或缺氧條件下,下調LINC00926均嚴重損害了FOXO3A調節LINC00926和PGK1表達的能力(圖5F)。此外,敲除LINC00926還**削弱了缺氧對PGK1上調的影響。這些數據表明,缺氧主要通過FOXO3A轉錄抑制LINC00926的表達,***PGK1的表達。
我們發現,在circMAPK1穩定下調的SGC7901和MGC803細胞中,與對照組相比,MAPK1-109aa與MEK1的結合明顯減少,而MAPK1與MEK1的結合增加(圖7f)。在MKN45和BGC823細胞中,IRES突變時MAPK1-109aa不翻譯。因此,MAPK1與MEK1的結合沒有明顯變化。然而,過表達circMAPK1后,MAPK1與MEK1的結合***減少,而MAPK1-109aa與MEK1的結合***增加(圖7g)。因此,以上結果表明MAPK1-109aa與MAPK1競爭結合MEK1。隨后的Western blot結果也證實,在過表達circMAPK1的細胞系中,MAPK1-109aa***升高,磷酸化的MAPK1/2降低,而在circMAPK1敲低的細胞中則相反(圖7h)。此外,MAPK1的下游效應因子,如p-ELK1、p-c-Fos、p-c-JUN和p-RSK,也被過表達的circMAPK1***抑制(圖7i)。這些結果表明,circMAPK1編碼的MAPK1-109aa通過抑制MAPK1信號通路發揮抑*作用。circNDUFB2過表達影響934個基因的表達水平。
氧化應激與阿爾茨海默病(AD)的發病機制有關。線粒體功能障礙與AD期間神經毒性中的氧化應激和活性氧(ROS)有關。線粒體代謝受損與AD腦損傷中的線粒體功能障礙有關。雖然已確定NOX4在腦損傷中的作用,但NOX4調控AD中星形膠質細胞鐵死亡的機制尚不清楚。因此,小編給大家介紹于2021年3月發表于影響因子為9.986的“Redox Biology”上的文章“NOX4 promotes ferroptosis of astrocytes by oxidative stress-induced lipid peroxidation via the impairment of mitochondrial metabolism in Alzheimer’s diseases”。我們的結果表明,NOX4通過脂質過氧化損傷AD中線粒體代謝,促進星形膠質細胞的鐵死亡。circSDHC在ccRCC中過表達且其過表達與低存活率相關.肝脂肪變性標書深圳
采用LEfSe方法分析經DHEA和tempol處理后***改變的關鍵系統發育類型。成都可參觀實驗標書
npm1突變的AML原始病例中,免疫表型集群3和8的豐度明顯較高,這些集群3和8表型原始,由表達低水平的骨髓單核細胞分化標志物的CD34+ CD38lo(3)或CD34 CD38lo(8)細胞組成(圖4C, D,補充圖21)。非***白血病集群為CD34,但表達少量的骨髓單核細胞標記物。相比之下,npm1突變的急性髓細胞白血病committed 病例顯示出5個免疫表型集群(1,7,16,22和24)的豐度高于原始病例(圖4B, D)。這些免疫表型集群包括CD34?/lo CD38+ CD11c+細胞也表達CD33、CD14、CD16和HLA-DR的各種組合,顯示出異常的骨髓單核細胞分化(圖4C,補充圖21A)。在原始病例中,***原始免疫表型聚集的總豐度較低(平均值(9.4±11.4%),***分化免疫表型聚集(平均53±37%)。成都可參觀實驗標書
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗