細胞凋亡甲基化芯片

來源: 發(fā)布時間:2021-10-11

藥物基因組學(老年保護化合物)模塊

該老年保護化合物模塊專注于老年保護劑,允許用戶查詢與衰老相關的化合物,根據衰老表型、靶點、途徑和與年齡相關的疾病,提供應用于模型生物的相關化合物的匯總數據。該模塊目前包含來自藥物治療分析(體內和體外)的數百種化合物和組學數據集的列表,揭示由特定壽命/延長健康壽命的藥物引起的基因表達變化。在該模塊的首頁,用戶可以瀏覽“熱門小分子”功能,每周更新列出搜索**多的化合物;“臨床試驗”提供了老年保護劑的臨床試驗數據;“專題文章”展示了衰老領域的***研究。重要的是,用戶可以通過藥物名稱、目標基因或來源論文的 DOI 輕松搜索,以獲取有關老年保護化合物的詳細信息。該模塊不僅提供了延長壽命和延長健康期的化合物列表,還提供了有關藥物引起的基因調控和表達變化的信息。 深耕科研行業(yè)提高科研的高效。細胞凋亡甲基化芯片

四、TEA-seq轉錄本、表位和可及性的三峰測量

A.隨著從單個核中同時捕獲RNA-seq和ATAC-seq的商業(yè)平臺的發(fā)布,我們推斷通透細胞可以用于同時捕獲三個主要的分子隔間:DNA可以用scATAC-seq捕獲,RNA可以用scRNA-seq捕獲,蛋白質表位豐度可以用聚腺苷化抗體條形碼捕獲,我們根據轉錄本、表位表位和可及性將其稱為TEA-seq。經過試驗和關鍵步驟的優(yōu)化后,我們能夠在10倍基因組MultiomeATAC+基因表達平臺上獲得文庫,該平臺使用46個低聚標記抗體組合了數千個單細胞的所有三種測量結果.

B.D.在對裝入4孔的細胞進行初始數據處理后,我們鑒定出29264個通過上述scATAC-seqQC標準的細胞條形碼,有2,500,500個獨特的ATAC-seq片段(中值=8762個獨特的ATAC片段),有>500個基因被scRNA-seq檢測到(中值=2399個RNAUMIs;中位數=檢測到129,249個基因),500個ADTUMIs.

G.H.更敏感的蛋白質豐度測量允許檢測許多附加的相關標準物質,例如CCR2/CD192.

I.J.一種單核細胞上表達的趨化因子受體和CD38,一種表達于多種免疫細胞表面的糖蛋白. 蛋白質解決了對確定因果調節(jié)機制網絡的方法的關鍵需求。

二、胎兒造血過程中分化軌跡的推斷

接下來,研究者使用力導向圖繪制算法推斷了人類胚胎發(fā)育期間造血細胞的分化軌跡。結果顯示HSCs/MPPs位于軌跡頂端,并且在HSCs/MPPs下游,研究者鑒定了三個高度增殖的寡能祖細胞群,即MEMPs(紅系細胞、MKs和肥大細胞);GPs(粒細胞);LMPs(淋巴樣細胞、單核細胞和樹突狀細胞)(圖2A和2B)。并使用Scanpy的paga_path函數顯示了沿三條分化途徑(MEMPs、GPs和LMPs)的譜系特異性基因動態(tài)表達(圖2C)。MEMPs將hsc / mpp與MKs、紅細胞和肥大細胞連接起來。與此一致的是,HSC/MPP向MEMPs轉化的差異調控基因包括MK/紅系/肥大細胞譜系特異性基因,如GATA1、ITGA2B、PLEK、KLF1、HDC和MS4A3(圖2C)。

接下來,我們使用3D分析儀分析NOX4上調后人星形膠質細胞細胞毒性的形態(tài)學變化(圖7E)。相對于對照,NOX4的升高誘導了細胞毒性的形態(tài)學特征,包括細胞質面積縮小和起泡(圖7E)。此外,與對照組相比,NOX4升高后,形態(tài)死亡細胞數量***增加(圖7F)。與形態(tài)學分析結果一致,相對于對照,NOX4的升高***增加了細胞毒性水平(圖7G)。這些結果表明,NOX4通過氧化應激誘導的人星形膠質細胞脂質過氧化促進了鐵死亡。結論:NOX4通過線粒體代謝損傷,氧化應激誘導的脂質過氧化作用促進星形膠質細胞的鐵死亡,這是AD期間星形膠質細胞損傷的一種重要分子機制。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環(huán)境形成和轉移的關鍵。

H&E染色顯示oil+ PBS組卵巢在不同發(fā)育階段均出現卵泡和少量新鮮黃體(圖1C)。與對照組相比,DHEA + PBS組的囊泡數量較多,黃體數量較少。另一方面,tempol處理減少了囊泡的數量,增加了黃體的形成(圖1C-E)。檢測了血清睪酮、eE2、LH、PRGE、FSH 5種性類固醇***水平。DHEA + PBS組血清睪酮水平明顯高于oil+ PBS組。Tempol***降低PCOS大鼠血清睪酮和eE2水平,但對血清LH、PRGE、FSH水平無明顯影響(圖1F)。DHEA處理的大鼠血清膽汁酸水平***降低,但這種減弱在DHEA + tempol組消失了(圖1G)。在DHEA + PBS組大鼠卵巢中,cleaved caspase-3的表達增加,而在tempol作用下,cleaved caspase-3的表達減少(圖1H)。TUNEL染色顯示,tempol***降低DHEA處理大鼠的凋亡細胞比例(圖1I)。提示tempol可改善PCOS大鼠卵巢功能障礙及卵巢組織病理損傷。致力于醫(yī)學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫(yī)學課題的研究。生產發(fā)育

高通量測序的后續(xù)成文服務。細胞凋亡甲基化芯片

紡錘體裝配檢查點(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點延遲有絲分裂進入后期,直到適當的染色體分離得到保證。這一安全機制的破壞導致基因組不穩(wěn)定和非整倍體,這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而,盡管了解了控制SAC的基本機制,但信號通路如何直接與有絲分裂檢查點活動相互作用和調節(jié)仍是未知的。在對細胞外刺激的反應中,參與細胞生長、生存和分化的多種信號通路網絡被***,這一過程***受到Ras家族小鳥苷三磷酸酶(GTPases)的調控。RIT1是一種ras相關的GTPase,調節(jié)細胞存活和應激反應,是通過有絲分裂和適當的染色體分離及時進展的必要條件。細胞凋亡甲基化芯片

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。

3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究

4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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