2)阿爾茨海默病患者皮質區受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高
由于NOX4蛋白水平在AD患者受損星形膠質細胞中升高,我們研究NOX4在AD患者受損星形膠質細胞氧化應激中的作用。我們用免疫熒光染色法檢測了AD患者或非AD供者大腦顳葉皮質組織中GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE的蛋白水平(圖2A)。免疫熒光染色顯示,AD患者(AD)皮質區分子層GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度相對于非AD供者增加(圖2A、B)。此外,AD患者皮質區ML中受損的GFAP陽性星形膠質細胞4-HNE陽性染色強度高于非AD供者(圖2A和B)。AD患者中4-HNE與GFAP亞細胞共定位陽性的受損星形膠質細胞數量***增加(圖2C)。此外,相對于非AD供體,4-HNE在AD患者的NOX4陽性星形膠質細胞***定位(圖2D)。AD患者的NOX4和4-HNE陽性星形膠質細胞數量相對于非AD供者***增加(圖2E)。這些結果提示AD患者受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高。 課題外包服務找英拜放心安心。單細胞相關課題課題省自然科學基金
二、YTHDF1缺乏可抑制胃*進展和轉移
YTHDF1在不同胃*細胞株中的蛋白表達水平,遠高于正常胃腺細胞GES-1。為了進一步探討YTHDF1在胃*中的作用,采用了胃*細胞系、細胞系來源的異種移植(CDX)和PDX模型(圖2A)。首先,通過產生兩種穩定的shRNA表達人胃*細胞株MGC-803和HGC-27,研究了YTHDF1的抑制作用,這兩種細胞株在所有被檢測的胃*細胞株中YTHDF1的表達相對較高(補充圖S2B)。YTHDF1基因敲除確實降低了胃*細胞的增殖(圖2B)。此外,在MGC-803和HGC-27細胞中YTHDF1敲除降低細胞的遷移和侵襲能力(圖2C)。隨后通過皮下注射YTHDF1敲除的MGC-803細胞到免疫缺陷裸鼠,研究YTHDF1的抑制是否會影響體內胃*的發生。 cancer免疫課題創新服務TRF測序課題整體服務。
關聯研究已將血液來源的microRNA(miRNA)的改變與結直腸*(CRC)聯系起來。miRNA譜可能在CRC進展過程中多樣化,并在血液中反映CRC進展水平。但是,尚無研究評估不同CRC階段血液中miRNA的變化。本研究對來自不同階段的健康供體、結直腸腺瘤、結直腸憩室炎和CRC患者(UICCstagesI/II,III,andIV)的80份血液樣本中的2,549種miRNA的譜進行了基于微陣列的比較。
接下來通過RT-PCR進行確認,并對另外 36 份血液樣本中miRNA進行驗證。與健康對照相比,有 179 個 CRC 相關 miRNA 的豐度差異。只有三個(miR-1225-5p、miR-1207-5p 和 miR-4459)在所有 CRC 階段表現出增加的水平。
對3個miRNA進行通路分析,發現了miRNAs 以各種方式對幾種**相關通路起作用。
這項研究為改進 CRC 篩查的生物標志物發現提供了線索,是***項提供 CRC 血液表達譜的研究,******評估了不同 CRC不同階段血液中 miRNA 的變化。 這也為其他疾病biomarker的研究提供了新的思路。
*細胞產生的外泌體miR-138-5p下調巨噬細胞中KDM6B的表達
接下來探索miR-138-5p的水平如何增加。為此測量了巨噬細胞中初級 (pri-) 和前體 (pre-) miR-138 的水平。發現處理后THP-1細胞中pri-或pre-miR-138沒有增加,表明miR-138-5p是外源供應的。此外,與用 RNase A 加 Triton X-100 處理相比,當我們用 RNase A 處理 MDA-MB-23 的 CM 時,miR-138-5p的水平沒有變化。這些發現支持細胞外miR-138-5p被包裹在膜結構中的結論。通過觀察到與未處理的CM相比,GW4869 處理的CM或外泌體耗盡的 CM 中miR-138-5p的水平顯著降低,獲得了進一步的證據,表明外泌體miR-138-5p參與了KDM6B表達的調節。這些結果表明 miR-138-5p 被包裹在乳腺*細胞釋放的外泌體中。 小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構。
紡錘體裝配檢查點(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點延遲有絲分裂進入后期,直到適當的染色體分離得到保證。這一安全機制的破壞導致基因組不穩定和非整倍體,這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而,盡管了解了控制SAC的基本機制,但信號通路如何直接與有絲分裂檢查點活動相互作用和調節仍是未知的。在對細胞外刺激的反應中,參與細胞生長、生存和分化的多種信號通路網絡被***,這一過程***受到Ras家族小鳥苷三磷酸酶(GTPases)的調控。RIT1是一種ras相關的GTPase,調節細胞存活和應激反應,是通過有絲分裂和適當的染色體分離及時進展的必要條件。RIT1在有絲分裂期間從質膜(PM)分離,并直接與SAC蛋白MAD2和p31conmet相互作用,該過程受周期蛋白依賴性激酶1 (CDK1)活性的調節。此外,致病水平的RIT1沉默了SAC,并通過將MAD2從有絲分裂檢查點復合體(MCC)中分離出來,加速了通過有絲分裂的轉運。此外,致病性RIT1抑制SAC促進染色體分離錯誤和非整倍體。我們的研究結果突出了RIT1與其他Ras GTPases相比的獨特功能,并闡明了信號通路與SAC之間通過一種新的調節機制的直接聯系。根據自身需要檢索相關基因或者化學品。焦亡生物相關課題創新服務
caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。單細胞相關課題課題省自然科學基金
Lnc-DC促進他莫昔芬耐藥
為了證實Lnc-DCgRNA對上調Lnc-DC表達的作用,從gRNA區域和支架區域設計了引物來檢測外源性的Lnc-DCgRNA水平。雖然該SAM文庫中包含5種不同的Lnc-DCgRNA,但選擇后只有Lnc-DCgRNA1(Lnc-DC1)高度富集。另外,只有LncDC1能夠***內源性的Lnc-DC表達,這表明雖然不是所有的gRNA都能誘導內源性基因表達,但那些能夠誘導內源性基因表達的gRNA可以通過雌***剝奪等選擇手段富集。接下來,作者確定了Lnc-DC對他莫昔芬耐藥的貢獻。用它莫西芬處理Lnc-DC1細胞和載體對照細胞。如圖2C所示,Lnc-DC1細胞對他莫昔芬的抗性是載體對照細胞的3倍。同樣,Lnc-DC1導致的凋亡率低于載體對照。此外,Lnc-DC1細胞顯示Bcl2和Bcl-xL水平升高,這可能是觀察到的對他莫昔芬耐藥的部分原因。Lnc-DC也降低了PARP和Caspase3的裂解水平。 單細胞相關課題課題省自然科學基金
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗