為了進一步分析LncRNA-HGBC-miR-502-3p-SET-AKT之間的關聯，作者在43對GBC組織中進行分析，發現LncRNA HGBC與miR-502-3p呈負相關，與SET和HuR mRNA水平呈正相關，與非**組織相比，HuR在GBC組織中表達上調，通過IHC分析發現，與非**組織相比，SET或p-AKT在GBC組織中表達上調，此外，LncRNA -HGBC表達與SET和p-AKT表達呈正相關。綜上所述，LncRNA HGBC能通過競爭性結合miR-502-3p發揮作用，然后***下游SET和AKT表達，從而加強**細胞的**性。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。腸道充盈
一、人胎肝和骨髓造血室的單細胞轉錄組
為獲取胚胎發育期間造血細胞的全部譜系，研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對表型確定的血液群體進行單細胞分類，并對15個胚胎的單個細胞進行scRNA-seq檢測（圖1）?；诓町惐磉_分析和標準化表達***性排名前20的標記基因，標注了23個不同的群體，發現在肝臟或股骨中檢測不到任何T細胞或先天淋巴細胞（ILCs），單細胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在大量的轉錄異質性，其中一些表型祖細胞群體（如HSCs，MPPs，CMPs，GMPs，MEPs和CLPs）由10多個不同的轉錄表型定義群體組成，這進一步證明人類臍帶血的祖細胞室具有高度的異質性。此外，該研究分析表明當前使用的細胞表面標記物不能很好地預測人類胚胎造血祖細胞的轉錄狀態。 TBI課題實驗檢測服務也是***PDAC肝轉移的潛在靶點。
c-Myc可以與PD-L1-Lnc的雙螺旋結構結合，作者接下來預測了7個C-Myc與PD-L1-Lnc可能的結合位點，為進一步驗證，作者構建了兩個預測結合位點突變(PDL1- Lnc mut)或缺失(PD-L1-Lnc del) 載體，將其轉染到A549細胞系中，發現 PD-L1 mRNA和蛋白表達不受影響。免疫沉淀試驗表明，c-Myc與野生型PD-L1-Lnc產生免疫共沉淀，進一步通過pulldown觀察PD-L1-Lnc與c-Myc的結合情況，發現只有野生型PD-L1-Lnc GFP mRNA與c-Myc進行結合，而突變型PD-L1-Lnc GFP mRNA未和Myc結合，免疫共沉淀實驗再次驗證了這一點。
近日，美國圣路易斯華盛頓大學醫學院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發布了Single cell transcriptional and chromatin accessibility profiling redefine cellular heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中，作者采用單細胞核轉錄組snRNA-seq和單細胞核染色質可及性snATAC-seq技術，對5個健康成人（50歲到62歲，男性(n = 3)和女性(n = 2)）腎臟樣本進行檢測。此文揭示腎臟內獨特的細胞狀態，并重新定義近端小管和粗升肢的細胞異質性。TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。
二、改進標簽轉移和差異分析
研究了方法差異對下游生物學分析的影響
A.B.去除中性粒細胞**提高了在細胞核和細胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細胞類型的能力.
C使用這些工具，中性粒細胞的去除提高了標記轉移評分，與核基方法相比，滲透性細胞產生了更多具有高標記轉移評分的細胞.
D所有方法產生的CD16+單核細胞均少于流式細胞術觀察到的CD16+單核細胞，這表明無論是使用核或通透細胞的scATAC-seq過程中，CD16+單核細胞可能丟失，或者標簽轉移方法不利于識別這種細胞類型. 使用motif和CHIP-seq預測影響基因簇表達的轉錄因子。chip課題產學研合作
高通量測序后續的機制實驗。腸道充盈
接下來，確定p53缺失是否在奧拉帕尼誘導的ferroptosis中具有與SLC7A11過表達類似的作用。用shRNA敲除HEY細胞中的SLC7A11，在奧拉帕尼處理的HEY細胞中，SLC7A11敲低(sh-SLC7A11)進一步降低了奧拉帕尼消耗的GSH水平，并***降低了細胞活力，表明SLC7A11敲低使細胞對奧拉帕尼更加敏感。與NAC處理相比，L -丁硫氨酸亞砜亞胺(BSO)處理HEY細胞進一步增強了奧拉帕尼對GSH生物合成的抑制，并***地使細胞對奧拉帕尼敏感，這與SLC7A11基因敲低一致?？傊?，這些結果表明，PARP抑制劑奧拉帕尼至少部分通過抑制SLC7A11介導的谷胱甘肽合成來促進ferroptosis，而且奧拉帕尼的功效可以通過基因改變SLC7A11的表達或藥理上調節卵巢*細胞中谷胱甘肽的水平來調節。腸道充盈
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗