8、CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR-934正反饋環路在CRLM期間介導M2巨噬細胞和CRC細胞之間的相互作用
如Fig.8a所示,WB顯示,與對照組相比,SW480和RKO細胞中,CXCL13促進p65磷酸化,NFκB、MMP2和MMP9的表達上調而IκBα的表達下調。CXCR5表達下調可部分減弱CXCL13的增強作用。此外,PMA處理的THP-1細胞用miR-934mimics預處理,然后與SW480細胞或RKO細胞與anti-CXCL13抗體共培養,或與shCXCR5共培養。我們發現CRC細胞中的anti-CXCL13抗體或CXCR5敲低可以抑制miR-934過表達誘導的NFκB信號通路的活化(Fig.8b)。值得注意的是,helenalin抑制NFκB/p65信號后,SW480和RKO細胞中miR-934、MMP2和MMP9的表達***低于對照組(Fig.8c),這表明miR-934也可能通過正反饋回路被NFκB/p65信號正調控。 我們構建了生物素標記的circSDHC探針.浙江標書售后服務
2021年6月,在Oncogene雜志上發表了文章“Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells..”。此報道通過運用了一種強大的染色質導向蛋白質組學方法,稱為ChIP-SICAP,揭示去勢抗性前列腺*(CRPC)細胞中內源性AR周圍染色質蛋白網絡(染色質蛋白網絡)的組成。在CRPC細胞雄***信號通路的背景下,進一步研究了與AR相關蛋白作用的染色質重塑者SMARCA4和SIM2。通過整合ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq和功能實驗的數據,揭示SMARCA4和AR在染色質上***共存,SMARCA4缺失影響了一組AR靶基因的染色質可及性和表達,也抑制了CRPC細胞的生長,驗證了SMARCA4在CRPC細胞中的功能。雖然SIM2的沉默同樣降低了染色質的可及性,但它影響了更多的雄***調節基因的表達。在雞胚絨膜尿囊膜實驗中,SIM2沉默也降低了CRPC細胞的增殖和**的大小。總之,此研究鑒定的AR染色體是研究這一重要藥物靶點的重要資源。新疆標書省自然科學基金FMT處理加速SCI小鼠的胃腸道消化。
TCGA泛*中的m6A概況
為了表征m6A模式和篩選潛在靶點,在TCGA中的9804個泛*樣本中開發了一個四步計算框架。經過質量控制后,共有23個m6A調節因子、56個m6A交互蛋白編碼基因、10個lncRNAs和17個miRNAs被納入本研究。106個基因有密切的共表達關系(Pearsonr>0.3)。在共表達調控網絡中,大多數m6A調節因子和一些蛋白質編碼基因是與其他基因相互作用的樞紐基因。在不同**類型*旁組織的差異表達比較中,許多基因在**組織中的表達水平較高,而一些蛋白質編碼基因則表現出相反的關系。這些基因包括ASB2、P2RX6、AXL、ID2和SOCS2;miR-143、miR-29a、miR-125b-1和miR-145等4種miRNA在**組織中表達較低。所有lncRNAs在**組織中均有較高的表達。利用**和正常組織的前兩個主成分(PC),我們發現m6A模式具有良好的鑒別診斷價值。曲線下面積(AUC)在大多數**中超過90%。
4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細胞轉移中發揮作用
據報道,外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結合蛋白來轉運。通過RNApull-down分析和質譜分析,鑒定了三種可能參與miR-934轉運的RNA結合蛋白,并發現敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(Fig.4a,b)。hnRNPA2B1是一種RNA結合蛋白,通過與特定基序GGAG/CCCU結合,參與miRNAs的運輸和轉錄后調控。特別是,由于miR-934序列中有兩個GGAG基序,我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結合,介導miR-934包裝成外泌體的過程。此外,miRNApull-down分析顯示,在細胞質和外泌體中,miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結合關系,然而,突變miR-934的結合序列(GGAG)可削弱這種結合(Fig.4c)。RNA免疫沉淀分析進一步證明,無論是在CRC細胞及其外泌體裂解物中,miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集(Fig.4d)。此外,敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細胞轉移到巨噬細胞的過程(Fig.4e)。因此,這些結果證實hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結合,介導miR-934包裝到CRC細胞外泌體中,并將外泌體miR-934轉移到巨噬細胞中。 檢測circNDUFB2是否作為miRNA海綿調節NSCLC的靶標.
急性胰腺炎(AP)是**常見的炎癥性胃腸道疾病之一,在小鼠和人類模型中似乎通過外分泌腺泡細胞的再生而恢復。巨噬細胞是由組織損傷引發的炎癥和組織再生反應的重要驅動因素,包括***、自身免疫性疾病、機械或毒性損傷以及其他原因。在組織損傷時,骨髓(BM)衍生的巨噬細胞和/或組織駐留巨噬細胞被***并以促炎方式響應局部環境,然后迅速轉變為傷口修復表型。巨噬細胞的表型和作用已在急性和慢性胰腺炎中得到充分證明。然而,關于巨噬細胞如何調節損傷后的胰腺修復/再生,包括ADM和腺泡再分化,我們知之甚少。***講一篇關于巨噬細胞表型變化與AP炎癥相關的文章,該文章題名為:Macrophagephenotypicswitchorchestratestheinflammationandrepair/regenerationfollowingacutepancreatitisinjury,IF=5.737,一區雜志。評估了丙酸丁酸和異丁酸的含量是否與運動恢復或腸道完整性相關。寧夏標書服務價格
FMT***可能通過改變糞便短鏈脂肪酸介導宿主的病理生理變化。浙江標書售后服務
然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉錄譜(Fig. 4G)。使用pseudobulk RNA-seq分析和預轉移體外培養的基因比較,生成了持續細胞的基因標記,其標志是記憶相關基因(Sell,Foxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達和效應相關基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(Fig. 4H-I)。對先前的體外單細胞數據(Fig. 2H-J)的進一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續性特征的細胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig. 4J-K)。這些數據表明,抑制CDK4/6促進T細胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。浙江標書售后服務
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗