L-14c-胱氨酸攝取試驗結果顯示,YTHDC2通過其YTH域抑制了H1299細胞產生的異種移植物、小鼠形成的LUAD和患者來源的LUAD細胞的胱氨酸攝取(圖3D-F)。圖3H證明了系統Xc功能受損與GSH水平降低相關。NAC和GSH給藥后發現,KPYWT小鼠...
三、SMARCA4調節AR靶基因的表達,參與細胞外基質組織和細胞粘附 使用RNA-seq研究了SMARCA4缺失對有DHT和沒有DHT的VCaP細胞基因表達的全基因組影響。后一組中,雄***(A)下調的基因占大多數(~70%),而在前一組中,雄***...
二、改進標簽轉移和差異分析 研究了方法差異對下游生物學分析的影響 A.B.去除中性粒細胞**提高了在細胞核和細胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細胞類型的能力. C使用這些工具,中性粒細胞的去除提高了標記轉移評分,與核基方法...
長鏈非編碼RNA(lncRNA)可以順式或反式發揮多種功能,包括調節基因轉錄和RNA剪接、調節RNA和蛋白質的活性或豐度以及組織核結構域。它們***參與細胞命運編程/重編程、分化、發育,尤其是與人類疾病相關。盡管近年來高通量測序技術的快速發展已經鑒...
在體外,上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬 自噬已被證實在AKI中發揮重要作用。因此,自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中,自噬相關...
由于circMAPK1在GC細胞系中穩定表達,我們推測circMAPK1可能是一種適合GC診斷或預后的標志物。qRT-PCR顯示circMAPK1在*組織中的表達低于匹配的非*組織(圖1m)。Kaplan-Meier生存分析顯示胃*組織中circMAPK1...
IFNα和抗CD3/CD28磁珠長期刺激后CD8 + T細胞中SRC能力的降低表明生物能量適應性受損。研究發現,IFNα刺激的CD8 + T細胞在初始爆發后,與*用CD3/CD28刺激的CD8 + T細胞相比,其氧化和糖酵解能力下降更快(圖4d)。總之,使...
3、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化 為了探索miR-934促進CRLM的分子和細胞基礎,通過Cytoscape軟件注釋了TCGAcohort中191個miR-934相關基因的細胞功能,發現miR-934***參與多種炎癥反應...
有趣的是,研究報道S100A4可以增強STAT3的磷酸化,而STAT3的磷酸化與OPN的表達是相關的,并且STAT3被預測是OPN的潛在轉錄因子。因此,檢測了S100A4敲除和過表達后OPN表達,STAT3表達和STAT3磷酸化,結果顯示OPN表達和STA...
其次,采用UPGMA、PCoA和NMDS評估不同群體的腸道菌群β-多樣性。UPGMA聚類方法將對照組和PCOS大鼠樣本分為兩組,表明PCOS大鼠和對照組的腸道微生物分布不同。雖然DHEA + tempol組不能完全與DHEA + PBS組分離,但與DHEA +...
為理解TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的機制作用,從4T1-P、TYRO3-OE、4T1-R和TYRO3–/–細胞中提取RNA進行全轉錄組分析。2種耐藥細胞系Tyro3-OE和4T1-R之間的轉錄組學變化高度相似,變化的重疊百分比較高,表明Tyro3在...
5)M1-Exos通過傳遞miR-155加重了EndoMT 為了研究外泌體miR-155在SCI后M1-Exos介導的BSCB破壞惡化中的作用,構建miR-155過表達(miR-155OE)和敲低(miR-155KD)BMDMs,然后分離外泌體并處理...
3、tiRNA-Gly直接與RBM17相互作用,調控RBM17在PTC細胞中的表達 為了探究tiRNA-Gly在促*中分子機制,作者合成了生物素標記的tiRNA-Gly及其反義序列,進行RNApull-down實驗,進而挖掘K1細胞中與tiRNA-G...
LC3陽性囊泡在質膜損傷后在修復部位積聚用激光照射*細胞MCF7,致使細胞膜上形成小孔。使用膜不可滲透的FM1-43染料測量膜完整性,發現在Ca2+存在下,細胞能夠在20到30s內修復它們的質膜(Fig.1,AandB,left);在缺乏Ca2+的培養基中受損...
二、染色質的可及性明確了細胞的類型 我們使用R包Signac來研究不同細胞類型間染色質可及性的差異。細胞類型可以根據差異開放區域(DARs)是開放的還是封閉的來區分(Fig.2a)。約20%(平均比例=0.2030.04)的DAR與各自細胞類型中的差...
點擊該基因的名稱,將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻中的更多詳細信息。***,在“詳細信息”部分中總結了有關疾病,細胞類型和基因的詳細信息。SC2disease還提供了從基于單細胞的結果和基于GWAS的結果得出的疾病的...
研究報道S100A4可以增強STAT3的磷酸化,而STAT3的磷酸化與OPN的表達是相關的,并且STAT3被預測是OPN的潛在轉錄因子。因此,檢測了S100A4敲除和過表達后OPN表達,STAT3表達和STAT3磷酸化,結果顯示OPN表達和STAT3磷酸化水平...
褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡 為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用,將HT-22細胞系用siRNA轉染,然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質水平。鑒于脂...
鐵死亡對瘤球體增殖和內部細胞存活的影響A549和H1437細胞中*****的脫落打擊是GPX4,形成球體后,用GPX4抑制劑ML210處理的球體顯示A549、H1437和H520細胞內腔空間的細胞存活率下降(圖A,B)。為了闡明與NRF2敲除球體內部細胞死亡是...
A.隨著從單個核中同時捕獲RNA-seq和ATAC-seq的商業平臺的發布,我們推斷通透細胞可以用于同時捕獲三個主要的分子隔間:DNA可以用scATAC-seq捕獲,RNA可以用scRNA-seq捕獲,蛋白質表位豐度可以用聚腺苷化抗體條形碼捕獲,我們根據轉錄本...
遷移體(migrasome)是清華大學生命科學院俞立團隊新發現的胞外分泌囊泡,該研究成果已于2015年發表在Cell Research期刊(IF=20.509)[1]。遷移體是在遷移細胞后部回縮纖維的前列或交叉處生長的大囊泡,直徑約為0.5μm到3μm,并且包...
Fn***的CRC細胞外泌體蛋白的鑒定和功能分類為了篩選Fn-Ex攜帶的特異性蛋白,用蛋白質組學方法研究Fn-Ex和Ex的差異蛋白表達譜。Venn圖分析顯示兩組間有197個蛋白重疊。Fn-Ex攜帶187個特異蛋白,其中85個Fn蛋白和102個細胞蛋白(圖7A)...
研究了磷脂酰肌醇3,4,5磷酸(PIP3)在DNA損傷后的細胞定位。將MCF10A細胞按上述方法同步輻照,免疫熒光法分析PTEN的亞細胞分布。PTEN-WT和PTEN-398A蛋白在細胞核和質膜穩定定位(圖6A, B)。經過IR處理后,PTEN-WT在質膜上積...
基于 RNA-seq 數據,PI3K-AKT 信號在 ADM 期間在巨噬細胞中顯著富集。當觀察PI3K-AKT 通路中這些升高的基因時,發現80%的基因與細胞外基質 (ECM)-受體相互作用、生長因子/細胞因子-受體相互作用有關,表明它們參與了巨噬細胞與相鄰細...