同源異形盒(HOX)基因甲基化PCR芯片研究文獻中已經報道的態參與多細胞生物的發展的22個基因的啟動子甲基化狀態。HOX基因編碼一組包含同源結構域的轉錄因子，**初被描述為發育過程控制節段性模式。HOX基因的異常表達一直在各種類型的**中觀察到。雖然這些HOX...

5、MAO-A阻斷**免疫***-小鼠**模型研究 MAO-A作為TAM免疫抑制極化的關鍵調控因子的鑒定使得MAO-A成為**免疫***的一個有前途的藥物靶點。由于已知的MAO-A在大腦中的功能，小分子MAOIs已經被開發和臨床用于***各種神經系統...

單細胞轉錄組學 (scRNA-Seq) 模塊 scRNA-seq 模塊系統地組織了基因表達隨年齡增長的組織和細胞類型特異性異質變化。該模塊提供不同細胞類型或亞型的高分辨率、綜合參考圖，以及它們的時空分布信息，以及在不同衰老相關或疾病條件下每種細胞類型...

Fth -KO小鼠易患TBI引起的鐵死亡 為了進一步研究神經元Fth在TBI誘導的鐵死亡中的作用，首先研究了神經元Fth在TBI誘導的皮質鐵超負荷中的作用。與對照小鼠相比，Fth- KO小鼠在TBI后受損皮層和血清中出現了更嚴重的鐵過載。Fth- K...

PPAR靶基因PCR基因芯片可以同時檢測參與過氧化物酶增殖物***受體(PPAR)活化和響應的84個關鍵基因的表達。PPARs是重要的核***受體,參與調節脂質代謝,細胞分化和增殖。3種PPAR的亞型都具有類似的功能,但具有特定的組織分布特性:a(脂肪組織,肝...

6、IFNα暴露增加CD8+T細胞的NAD+的消耗 為了了解慢性I型IFN與CD8+T細胞下游線粒體和代謝變化之間的機制聯系，首先在SLE患者CD8+T細胞的轉錄組學數據中探索了哪些通路與I型IFN信號相關。結果顯示煙酸/煙酰胺代謝途徑顯示出比較高的...

HOXBLINC的缺失擾亂了NPM1c+介導的轉錄程序和白血病發生 隨后鑒定了NPM1c+AML和NPM1cWTAML病人中的差異表達基因，與WT相比，有871個下調基因和980個上調基因，包括HoxBlinc和NPM1c+的特征基因HoxB2-5，...

2021年6月，***一篇發表在Nat Immunol.（IF=25.600）的文章（Mitochondrial stress induced by continuous stimulation under hypoxia rapidly drives T c...

進一步檢測S100A4的功能，結果顯示敲除S100A4***降低高轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力，過表達S100A4則***增強低轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力（圖3d）。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達的HCC細胞的外泌體，結果...

值得注意的是，與對照組相比，NOX4的升高增加了鐵的積累，這是鐵死亡的特異性標志(圖7D)。接下來，我們使用3D分析儀分析NOX4上調后人星形膠質細胞細胞毒性的形態學變化(圖7E)。相對于對照，NOX4的升高誘導了細胞毒性的形態學特征，包括細胞質面積縮小和...

為了在體內檢測這些效應，我們將Kas-1尼洛替尼耐藥細胞移植給裸鼠。細胞接種后，為了保持耐藥表型，我們繼續每周兩次腹腔注射尼洛替尼，直到**體積接近100mm3。然后，隨機分組給予次優劑量的SsD(圖7H)。SsD本身略微減緩了耐藥**的生長(圖7I和7J...

YTHDF1水平的降低導致MGC-803移植**的**進展延遲(補充圖S2D和S2E)；與對照組相比，YTHDF1缺陷**的重量和體積***減少(圖2D)。因此，在YTHDF1缺陷**中，增殖標記物Ki-67下調，凋亡標記物cleavedcaspase-3上調...

與coaccessibilityscore較高的Cicero連接相比，coaccessibilityscore較低的Cicero連接在GeneHancerdoubleelite數據庫中的可能性較小(p<2.21016，卡的平方)。在近端曲小管內，大部分C...

根據我們的研究結果，與第1天相比，第3天的胰腺巨噬細胞具有更高的增殖能力。這可能部分解釋了第3天巨噬細胞的增加。此外，流式細胞術數據顯示M2樣巨噬細胞(CD206+IL4RA+)的百分比在第1天（急性炎癥期）下降并從第3天開始增加（ADM階段），而這些M2...

接下來，我們使用3D分析儀分析NOX4上調后人星形膠質細胞細胞毒性的形態學變化(圖7E)。相對于對照，NOX4的升高誘導了細胞毒性的形態學特征，包括細胞質面積縮小和起泡(圖7E)。此外，與對照組相比，NOX4升高后，形態死亡細胞數量***增加(圖7F)。與形態...

再生胰腺中胰腺巨噬細胞的動態轉錄組譜 為了進一步了解AP恢復過程中巨噬細胞的表型和功能，分離出胰腺巨噬細胞用于RNA-seq分析。顯著性差異表達基因繪制熱圖。為了評估這些基因簇的功能，使用網絡工具DAVIDGeneOntology(GO)進行了功能注...

宏基因組測序是對特定環境樣品中的微生物群體基因組(尤其是那些種類眾多的難于培養的微生物)。進行序列測定和功能基因的發掘，來分微生物群體基因組成及功能,解讀微生物群體的多樣性與豐度,發覺和研究新的、具有特定功能的基因。目前宏基因組學研究在發現新基因,開發新的微生...

1）DRD2通過啟動子甲基化在轉錄上下調 為了研究新的潛在TSGs，采用BrCa組織和正常組織進行RNA-seq篩選。與正常乳腺組織相比，BrCa組織中DRD2mRNA表達明顯下調(圖1A)。免疫組化染色發現，與BrCa組織相比，正常乳腺組織中DRD...

七、急性腎損傷和慢性腎臟疾病患者PT_VCAM1的比例升高 對小鼠缺血再灌注損傷(IRI)實驗中獲得的大量RNA-seq進行反卷積，以確定PT_VCAM1的比例是否與急性腎損傷有關。BisqueRNA使用基于scRNA-seq參考的反褶積方法從整體R...

越來越多的證據表明細胞外囊泡（EVs）通過促進實體**中**-內皮細胞之間的通訊來刺激血管生成。先前的研究表明miR-144是鼻咽*（NPC）細胞來源的EVs中的內含物之一，但EVs miR-144對**內皮細胞和血管生成的影響尚不清楚。2021年3月發表于“...

還檢測到β-肌動蛋白***升高，與免疫沉淀的HuR蛋白結合。接下來研究HuR-β-actin介導的調節機制是否參與OPC的遷移調節。β-actin的mRNA和蛋白表達以及細胞遷移能力在HuR基因過表達的細胞中***增加， HuR基因敲低細胞中降低。β-肌動蛋白...

***是心肌梗死、缺血性中風和外周動脈疾病(PAD)的主要潛在原因，是世界范圍內的主要死亡原因。***是一種慢性炎癥性疾病，優先發生在暴露于紊亂血流(d-flow)的動脈區域，而暴露于穩定血流(s-flow)的動脈區域則受到保護。血流被內皮細胞(ECs)中的機...

褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡 為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用，將HT-22細胞系用siRNA轉染，然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質水平。鑒于脂...

4）USP35過表達減少erastin/RSL3觸發的鐵紊亂和鐵死亡 erastin和RLS3誘導的ROS和MDA生成因USP35過表達而減少(圖4A，B)。此外，在erastin和RLS3處理的*細胞中，HETEs水平升高，但在除12-HETE外的...

2021年6月，***一篇發表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiota long-term dynamics and prediction of acute graft-versus-host disease in pediat...

一、PBMC單核、單細胞ATAC序列優化 A.snATAC、scATAC和ICICLE-seq方法的主要步驟概要。ficoll純化的PBMCs和白細胞分離純化的PBMCs之間的一個主要區別是ficoll純化樣品中存在殘留的中性粒細胞。我們使用熒光**...

急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學上的異質性疾病，其特征是克隆擴增和突變的造血干細胞和祖細胞分化受損。在AML**常見的驅動突變中，NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩定的，在20%-30%的病例中發生。由于其生物學意義和預后影響，NPM1突變在...

6）M1-Exos通過傳遞miR-155上調ROS水平，損害bEnd.3細胞線粒體功能 我們研究了外泌體miR-155與bEnd.3細胞中線粒體功能的關系。我們發現，與miR-NCOE-Exos相比，miR-155OE-Exos處理上調了ROS水平(...

本文在一組臨床定義明確的SLE伴活檢證實的腎炎患者中進行的T細胞轉錄組學和代謝研究表明，高IFN信號可驅動CD8 + T細胞線粒體代謝途徑的變化，使其生物能量不適應且更容易死亡。本文證明在SLE患者的CD8 + T細胞中觀察到的代謝重編程是延長IFNα暴露和T...

結果1）circPDE4B在OA組織中表達較低 我們之前對3個臨床OA和3個對照樣本的軟骨細胞核糖體RNA缺失的總RNA進行了RNA-seq分析。在數量**多的50個***調控異常的circRNA中，circPDE4B的表達水平排名***。我們評估了...