比較SLE-1和SLE-2組的轉(zhuǎn)錄表達譜,結(jié)果顯示,除ISGs外,mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達差異比較大(Fig. 1c, d)。總之,SLE患者純化T細胞的轉(zhuǎn)錄組學分析根據(jù)ISG表達水平將其分為兩組,表達高I型IFN標記的患者顯示線粒體編碼基因...
2、hUC-MSCs增加MRL/lpr小鼠脾CD4+T細胞的衰老通過Sirt1/p53信號 作者推測hUC-MSCs***MRL/lpr小鼠的潛在機制可能是通過增強CD4+T細胞的衰老來抑制其積累。為了驗證這一點,作者從脾細胞懸液中分離出單核細胞,然...
來自4個不同腺泡性LUAD患者的PDX模型被給予XC-系統(tǒng)抑制劑erastin(PKE)和多激酶抑制劑索拉非尼(sorafenib)。與DMSO***的對照組相比,PKE和sorafenib給藥時觀察到***的**消退(圖7G-J)。此外,PKE和sora...
二、INPP4B增強pik3a突變ER+乳腺*和乳腺上皮細胞增殖 GFP-INPP4B在MCF-7和T47D ER+乳腺*細胞中表達,這兩種細胞分別有PIK3CAE545K和PIK3CAH1047R高活化突變.*細胞進行非錨定細胞生長的能力是細胞轉(zhuǎn)化...
1.核糖體印跡與多聚核糖體分析證據(jù) mRNA的翻譯是由核糖體進行的,它可以在主動翻譯的mRNA中形成多聚核糖體(Polysome)。因此,與核糖體/多核糖體的結(jié)合可以作為可翻譯circRNA潛力的強有力的預(yù)測證據(jù)。數(shù)據(jù)庫整合了已發(fā)表的核糖體印跡(Ri...
創(chuàng)傷性腦損傷(TBI)是重要的健康問題,每年有超過5000萬新發(fā)TBI病例。在TBI的病理生理過程中,會發(fā)生各種形式的細胞死亡,包括細胞凋亡,壞死,程序性壞死,自噬,焦亡和鐵死亡。目前尚未充分挖掘TBI中鐵死亡的發(fā)病機理。***我們講一篇蘇州大學團隊在JOUR...
外泌體可調(diào)節(jié)多種生理或病理反應(yīng),包括**細胞侵襲與轉(zhuǎn)移、血管生長免疫應(yīng)答等。外泌體中的SmallRNA分子比較穩(wěn)定,含量相對豐富,是目前外泌體研究的重點。外泌體的miRNA與多種疾病的**、心血管疾病、免疫疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生、耐藥密切相關(guān),同時外泌體mi...
1)circMAPK1的鑒定和circMAPK1的臨床特征 由于MAPK信號通路在**發(fā)生和進展中起著重要的病理作用,我們首先根據(jù)在線數(shù)據(jù)庫circBase中的circRNA測序數(shù)據(jù)分析了來自MAPK通路相關(guān)基因的circRNA。然后我們清點了MAP...
5)SsD可***抑制AML在體內(nèi)的進展 為了研究SsD在體內(nèi)對白血病的***效果,我們建立了C1498和FLT3+白血病小鼠模型(圖5A)。對照組小鼠的白細胞生長較快。0.1mg/kg或0.5mg/kg劑量的SsD***抑制WBC生長(圖5B)。與...
5)NOX4的升高通過抑制人類星形膠質(zhì)細胞線粒體呼吸和ATP的產(chǎn)生來促進線粒體代謝的損傷,從而促進氧化應(yīng)激 我們研究了AD期間NOX4升高誘導(dǎo)受損星形膠質(zhì)細胞氧化應(yīng)激的潛在分子機制。與對照組相比,NOX4過表達***抑制了OCR的基礎(chǔ)水平,且***降...
**近有報道稱,ALS/FTD中TDP-43的聚集可以隔離核孔蛋白、轉(zhuǎn)運蛋白和其他因子,表明TDP-43的聚集強烈破壞核質(zhì)轉(zhuǎn)運(NCT)和核孔復(fù)合體。此外,在AD、ALS和亨廷頓氏病(HD)中NCT也被破壞,提示在這些神經(jīng)退行性疾病中有一個共同的功能失調(diào)途徑。...
在沒有RNA配體的情況下,RIG-I采用一種自動抑制的構(gòu)象,CARDs發(fā)出信號。因此假設(shè)circNDUFB2可能通過促進其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測RIG-I的CARDs(FLAG-CARD)和螺旋酶結(jié)構(gòu)域(HA-ΔCARD)之間的相互作...
由于p65轉(zhuǎn)位到細胞核并促進其靶向基因的轉(zhuǎn)錄,假設(shè)NFκB/p65信號通路的***可通過p65的轉(zhuǎn)錄活性上調(diào)miR-934表達。在p65和miR-934啟動子之間發(fā)現(xiàn)了5個潛在的轉(zhuǎn)錄結(jié)合區(qū)域和2個特異性結(jié)合位點(Fig. 8d)。隨后,用miR-934啟動子中...
為了研究ESCRT-III在ferroptosis中的功能作用,作者評估了抑制CHMP4B對NIH-3T3細胞死亡的影響(圖5A, B)。與對照組相比,CHMP4B敲除細胞的死亡發(fā)生率更高、更快,特別是在早期時間點(1-3 h),這表明CHMP4B的缺失導(dǎo)...
4.篩選關(guān)鍵模塊(hubmodule)并進行富集分析分析發(fā)現(xiàn),棕色模塊與CD8+T細胞***相關(guān)(R2=-0.05,P=9e-05),因此選擇棕色模塊為hubmodule進行富集分析。 5.在hubmodule中篩選出關(guān)鍵基因(hubgene)并驗證...
再生胰腺中胰腺巨噬細胞的動態(tài)轉(zhuǎn)錄組譜 為了進一步了解 AP 恢復(fù)過程中巨噬細胞的表型和功能,分離出胰腺巨噬細胞用于 RNA-seq 分析。顯著性差異表達基因繪制熱圖。為了評估這些基因簇的功能,使用網(wǎng)絡(luò)工具 DAVID Gene Ontology (G...
褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經(jīng)元損傷 為了進一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經(jīng)元損傷中的假定作用,在TBI后第3天,在受傷的皮層中觀察到了Fe2+,F(xiàn)e3+,總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導(dǎo)的血清和同側(cè)皮層中鐵含量的上調(diào)...
2021年,來自加拿大多倫多大學和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學等團隊合作在Nature communication雜志上發(fā)表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of N...
接下來,通過體外復(fù)制、配對子細胞實驗和體內(nèi)競爭移植研究了HoxBlinc過表達對造血干細胞自我更新和再生能力的影響。在HoxBlincTg LSK細胞中,連續(xù)4輪的復(fù)制電位均***高于WT細胞(圖3d)。使用WT和HoxBlincTg原始CD34?LSK細胞的...
在Jurkat和小鼠T細胞中檢測到多個肽上特異性磷酸化位點的***缺失,包括典型的CDK4/6靶標RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是,RB在兩種細胞蛋白組學中重疊,并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的(Fig. 3B,3...
4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用 據(jù)報道,外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來轉(zhuǎn)運。通過RNApull-down分析和質(zhì)譜分析,鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運的RNA結(jié)合蛋白,并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNP...
隨后,通過進行spearman分析,研究了所有三組循環(huán)代謝產(chǎn)物豐度與腸道微生物群之間的聯(lián)系,以測試33個屬與52個代謝產(chǎn)物之間的關(guān)聯(lián),其中有11個代謝物與各屬均無***相關(guān)(圖7A)。其余甘油磷脂類只與一兩種屬相關(guān),而多不飽和脂肪酸(8-HETE, 8,9 -...
USF2促進circACTN4在BC中的表達為 了研究 circRNA 在 BC發(fā)展中的功能,利用芯片分析檢測了4對BC組織和*旁組織中circRNA表達特征。共發(fā)現(xiàn)85個***差異表達的circRNAs, 63 個上調(diào)和22個下調(diào)circRNAs。...
五、YTHDF1以m6a依賴的方式調(diào)控FZD7的表達 在GC-803和胃*細胞株基礎(chǔ)上,進行m6A-qPCR和YTHDF1 RIP qPCR的基因特異性分析。確實,在FZD7 mRNA中觀察到兩個m6A峰,并且在MGC-803和HGC-27細胞中證實...
背景:RIT1突變已被確定為肺腺*的致*因素和努南綜合征的病因因素。RIT1有一組獨特的效應(yīng)蛋白,但與其他Ras GTPases共享MAPK通路的***。然而,由于缺乏確定的同源GTPase***蛋白或交換因子,RIT1 GTPase周期的調(diào)控仍不清楚。盡管如...
5、確認PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴增中的作用 隨后探究了PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴增中的作用。如圖A-C所示,成功構(gòu)建了PDCD4的過表達和干擾表達細胞系。與對照組相比,PDCD4過表達***降低了Treg細胞的擴增率,而干擾其表達則***提高了Tr...
Blimp-1在持續(xù)刺激下抑制PGC1α 持久抗原對于改變向衰竭分化至關(guān)重要,但其代謝后果尚不清楚。由于連續(xù)的刺激不產(chǎn)生明顯的代謝抑制,持續(xù)的刺激可能***一個轉(zhuǎn)錄抑制因子,阻止代謝重編程。Blimp-1(由Prdm1編碼)就是這樣一種抑制因子,在B...
接下來,測定了分泌的miR-208b對體內(nèi)Treg和存活的影響,如圖8A-B所示,CD4+- CD25+ Foxp3+ Treg在外周血和脾臟分離的總CD4+ T細胞群中的比例在miR-208b-OE組和miR-208b-OE + OXA組***升高,而在mi...
這些基因的體細胞突變狀態(tài)如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53(31.4%)、PTEN(5.7%)、NOTCH1(3.6%)、CTNNB1(3.6%)、XIST(3.4%)和MALAT1(3.4%)。還觀察到在子宮內(nèi)膜體*(UCEC)中有相對較高的突...
Fth-KO小鼠易患TBI引起的鐵死亡為了進一步研究神經(jīng)元Fth在TBI誘導(dǎo)的鐵死亡中的作用,首先研究了神經(jīng)元Fth在TBI誘導(dǎo)的皮質(zhì)鐵超負荷中的作用。與對照小鼠相比,F(xiàn)th-KO小鼠在TBI后受損皮層和血清中出現(xiàn)了更嚴重的鐵過載。Fth-KO小鼠...