TransCirc數據庫整合了各種與翻譯相關的證據,檢索的結果能直觀的呈現翻譯產物的相關證據信息。數據共分析了328080種已知人類circRNA的翻譯潛能,有蛋白質譜證據(MS)的circRNA有168個,核糖體印跡或多聚核糖體分析(RP/PP)的證據428...
多囊卵巢綜合征(PCOS)是一種復雜的內分泌和代謝紊亂疾病,通常伴有氧化應激。Tempol是一種超氧化物歧化酶(SOD)模擬物,可預防由氧化應激引起的多種疾病。但是,目前尚不清楚tempol對PCOS的影響。本文通過腸道微生物組的16S rDNA測序和非靶...
三、在體內,tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制 為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸,我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GF...
miR-144通過FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路發揮促血管生成功能 我們確定NPC-EV來源的miR-144是否通過介導FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路促進HUVECs的血管樣管形成。免疫印跡分析結果表明,在miR-144抑制劑...
染色質可及性是驅動腎元發育的動態過程,而腎元祖細胞具有不同的染色質可及性譜,且隨其分化而變化。染色質可及性在促進或抑制腎臟修復和再生中的作用對于設計急性和慢性腎臟疾病的治療方案具有重要意義,并可能有助于改善腎臟類***的定向分化。scRNA-seq和snA...
5、血漿外泌體S100A4和OPN水平聯合可以作為HCC患者術后的強力預后因子 在168例接受肝切除術的HCC患者中,進一步研究了血漿外泌體S100A4和OPN水平的臨床意義。結果發現外泌體S100A4水平和OPN的表達***正相關,并且外泌體S10...
采用LEfSe方法分析經DHEA和tempol處理后***改變的關鍵系統發育類型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+PBS組,而Muribaculaceae和Alloprevotella屬富集于DHEA+PBS和DHEA+tempol組(圖...
利用METABRIC數據集,我們評估了1459例ER+乳腺*中17個常見Wnt/β-catenin通路基因的表達,包括幾個Wnt靶基因(圖7a)。為了確定INPP4B是否促進PI3K和Wnt/β-catenin通路之間的對話,我們用增加劑量的PI3K抑制劑BK...
五、NF-κB調節表達VCAM1的近端小管亞群的分子特征 檢測了一組近端小管細胞,VCAM1的表達和染色質可及性增加,我們將其命名為PT_VCAM1(圖1)。免疫熒光研究表明,VCAM1在近端小管上皮中呈散在分布的表達(圖5a)。我們的單細胞研究估計...
六、多組學方法分析表征近端小管細胞子集 Cicero研究了從PT到PT_VCAM1轉變過程中染色質可及性的變化。VCAM1和TPM1轉錄增加(圖6a)與VCAM1基因體和啟動子區域染色質可及性增加相關(圖6b,c)。同樣,SLC5A12和SLC4A4...
然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉錄譜(Fig. 4G)。使用pseudobulk RNA-seq分析和預轉移體外培養的基因比較,生成了持續細胞的基因標記,其標志是記憶相關基因(Sell,Foxp1,Tcf7,Cd7,Il7r...
USF2促進circACTN4在BC中的表達為了研究 circRNA 在 BC發展中的功能,利用芯片分析檢測了4對BC組織和*旁組織中circRNA表達特征。共發現85個***差異表達的circRNAs, 63 個上調和22個下調circRNAs。熱圖顯示了1...
5)Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用 此前,我們發現IGF-1可以通過誘導補體C1q結合蛋白(C1QBP)從細胞質轉位到膜上,驅動CD44v6/C1QBP復合物的形成,從而***IGF-1下游...
造血干細胞早期命運決定的機制在很大程度上尚不清楚。據推測,譜系特異性轉錄因子(TFs)在噪聲閾值以上的隨機表達可以鎖定一個細胞進入一個獨特的細胞命運。與此相一致的是,在多能造血細胞中觀察到與拮抗譜系相關的基因的共表達,包括關鍵的TFs,這表明在多能細胞室中存在...
檢測TYRO3基因拷貝數與細胞毒性T細胞抗**活性的相關性,CD8+T細胞水平與高表達TYRO3基因的患者的生存期延長無關,但確實介導了低TYRO3基因拷貝數患者的生存期延長,表明TYRO3降低細胞毒性T細胞抗**作用的觀點。為進一步確定TYRO3和抗PD-1...
6)Pex衍生的CD44v6和C1QBP的高表達預示著PDAC患者的肝轉移和低生存率采用免疫組化和westernblot檢測肝轉移灶周圍肝組織和正常肝組織的纖維化ECM微環境。與體內實驗一致,纖維連接蛋白、I型膠原和α-SMA水平***升高,而玻連蛋白和固生蛋...
6、IFNα暴露增加CD8+T細胞的NAD+的消耗 為了了解慢性I型IFN與CD8+T細胞下游線粒體和代謝變化之間的機制聯系,首先在SLE患者CD8+T細胞的轉錄組學數據中探索了哪些通路與I型IFN信號相關。結果顯示煙酸/煙酰胺代謝途徑顯示出比較高的...
第二次Ca2+升高,與RSL3處理常見,并被Fer-1抑制,對應的是針對鐵下垂的胞質Ca2+增加(Ca2+sp) (圖2F)。在Erastin-1處理后,Ca2+un增加,隨后Ca2+sp上升,細胞周圍和**終的PI攝入(圖2C-E)。相比之下,RSL3處理的...
在Jurkat和小鼠T細胞中檢測到多個肽上特異性磷酸化位點的***缺失,包括典型的CDK4/6靶標RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是,RB在兩種細胞蛋白組學中重疊,并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的(Fig. 3B,3...
細胞間的相互作用在**進展和轉移中發揮關鍵作用。目前關于這些**細胞是如何與其他細胞相互交流的仍有很多是未知的。**釋放的外泌體被認為是**進行細胞間溝通的有效介質。Dong等探索了肝細胞*(HCC)外泌體在其轉移和預后價值中的功能。本文于2021年6月發...
PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著...
5)MAPK1-109aa對胃*有抑制作用 為了進一步研究MAPK1-109aa的生物學功能,我們將circMAPK1ATG突變質粒、circMAPK1IRES突變質粒和circMAPK1過表達質粒轉染到MKN45和BGC823細胞中。如預期的那樣,...
小泛素修飾(SUMO)結合稱為SUMO修飾,其作為生物活性分類的誘導劑分子進入細胞外囊泡(EVs),觸發淋巴管生成,進一步驅動**淋巴結(LN)轉移,但確切的機制仍不清楚。本研究發現,SUMOylation促進細胞外囊泡介導的lncRNA ELNAT1的傳...
人類的視黃酸信號通路PCR芯片用于研究參與視黃酸信號通路的84關鍵基因的表達。視黃酸(RA)具有重要的生物學功能,由維生素A(視黃醇)派生而來,其活性涉及多種生物學過程如脊椎動物發育和內穩態而中斷這個途徑會導致心臟、神經、生殖、和皮膚組織等發育異常和功能中斷。...
七、YTHDF1-FZD7-b-catenin軸促進胃*進展 A和B, Western blot分析YTHDF1、FZD7、B -catenin和***的B -catenin在YTHDF1敲低的MGC-803 (A)和HGC-27 (B)細胞中轉染F...
7)miR-155負調控SOCS6表達,***NF-κB通路 為了進一步探討外泌體miR-155誘導EndoMT和線粒體功能障礙的潛在機制,我們重點研究了miR-155的下游基因。首先,利用在線miRNA靶標數據庫預測了84個潛在靶基因。SOCS6是...
我們已經進行了snATAC-seq和snRNA-seq來研究染色質可及性如何改善我們對成熟人類腎臟中細胞狀態和功能的理解。我們生成了一個包含轉錄組和表觀基因組數據的交互式多模態圖譜。結合snRNA-seq和snATAC-seq分析提高了檢測近端小管和厚升肢...
首先這是首頁界面,可以根據自己想了解的疾病、化學品、基因和通路等進行搜索。我們以氣道梗阻為例,首先進入視野的就是進本信息,然后是化學品與基因相互作用,其次是氣道梗阻相關化學品,之后是氣道梗阻相關基因,***還有表型和通路相關數據。 該數據庫還將解剖學...
6、MAO-A阻斷**免疫***-人類TAM和臨床數據相關性研究 為了探索MAO-A阻斷***的翻譯潛力,首先研究了MAO-A對人巨噬細胞極化的調控。分析體外培養的免疫刺激M1樣和免疫抑制M2樣人單核細胞源性巨噬細胞的基因表達特征。有趣的是,在所有檢...
值得注意的是,與對照組相比,NOX4的升高增加了鐵的積累,這是鐵死亡的特異性標志(圖7D)。接下來,我們使用3D分析儀分析NOX4上調后人星形膠質細胞細胞毒性的形態學變化(圖7E)。相對于對照,NOX4的升高誘導了細胞毒性的形態學特征,包括細胞質面積縮小和...