巨噬細胞在 AP 恢復不同階段的不同作用 鑒于 AP 恢復過程中巨噬細胞的表型變化，接下來試圖通過用脂質體***巨噬細胞來檢查巨噬細胞在不同修復/再生階段的作用。首先，我們在急性炎癥反應后（從第 1 天到第 2 天）立即消耗了胰腺巨噬細胞，并在第 3...

4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細胞轉移中發揮作用 據報道，外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結合蛋白來轉運。通過RNApull-down分析和質譜分析，鑒定了三種可能參與miR-934轉運的RNA結合蛋白，并發現敲除hnRNP...

4、CDK4/6預處理增強功能性記憶CD8+T細胞的持久性 長期生存能力是T細胞記憶的基本特征。為了確定CDK4/6i處理的細胞在體內是否表現出優越的存活率，將未處理和CDK4/6i預處理的體外活化CD45.1OT-iT細胞轉移至同源CD45.2小鼠...

10.EVs介導的ELNAT1與BCa淋巴結轉移相關 確定EVs介導的ELNAT1在BCa淋巴結轉移中的臨床意義十分重要。首先，作者發現來自BCa患者的尿中EVs與配對BCa組織的ELNAT1表達呈正相關，這意味著EVs介導的ELNAT1是BCa中E...

QKI促進NSCLC細胞中circNDUFB2的生物發生 circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA，而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調。因此，推測circNDUFB2的下調在轉錄后發生。我們在circNDUF...

1）circPDE4B在OA組織中表達較低 我們之前對3個臨床OA和3個對照樣本的軟骨細胞核糖體RNA缺失的總RNA進行了RNA-seq分析。在數量**多的50個***調控異常的circRNA中，circPDE4B的表達水平排名***。我們評估了每個...

PTEN是一種**抑制因子，調節多種細胞功能，包括***，PI3K/AKT信號通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此，推測PI3K/AKT信號通路可能參與CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化。WB結果顯示過表達PTEN可...

單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術可以在單細胞水平下研究復雜的多細胞生物的轉錄組譜。這為科學家提供了一種研究表達模式中細胞異質性的新工具，尤其是疾病細胞的異質性。更重要的是，scRNA-seq的快速發展帶來了在疾病微環境中探索細胞亞群的見識，這有助...

snoRNAs的生物合成 snoRNAs主要包含兩個家族：C/DboxsnoRNAs與H/ACAboxsnoRNAs[5](圖1)。大多數snoRNAs主要位于由RNA聚合酶II轉錄的基因的內含子區域。但snoRNAs也可以來源于長鏈非編碼RNA（l...

我們鑒定出了幾個可能與LINC00926相互作用的蛋白，包括兩個E3連接酶，STUB1和E6AP(圖4F)。免疫印跡進一步證實，只有STUB1與LINC00926相互作用，而E6AP則沒有(圖4G)。此外，RIP分析也表明，PGK1和STUB1免疫沉淀中，LI...

五、gata1調控靶基因的染色質可及性及表達動態 檢測了pySCENIC鑒定的**頂層gata1調控靶基因的scRNA-seq和scATAC-seq數據(根據AUCell評分排序)(圖5)。 我們觀察了兩個基因啟動子(距轉錄起始位點3kb[TS...

A.29名兒童在進行異體造血干細胞移植前、移植時、移植后即刻以及后期隨訪時均進行了監測。監測患者的基線特征、臨床結果、免疫細胞計數以及炎癥和***標志物。表S1(附加文件1)詳細描述了患者特征。宿主免疫系統參數與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動力學相關，這...

6.分析hubgene與臨床免疫指標的相關性根據cBioPortal數據庫、TIMER數據庫對上述6基因進行進一步分析，并且計算了與CD8+T細胞浸潤水平的相關性，發現METTL8，HSPB3和ERLIN2）浸潤水平之間的***相關。 7.鑒定預后標...

一、異種HSCT前后監測腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統。 在1年的時間里，從29名兒童的10個時間點收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次，HSCT當天，HSCT后1個月每周，以及HSCT后12個月的3個隨訪時間點(圖1)。通過...

IFNα和抗CD3/CD28磁珠長期刺激后CD8 + T細胞中SRC能力的降低表明生物能量適應性受損。研究發現，IFNα刺激的CD8 + T細胞在初始爆發后，與*用CD3/CD28刺激的CD8 + T細胞相比，其氧化和糖酵解能力下降更快（圖4d）?？傊?，使...

snoRNAs派生的小RNAs miRNA在一系列調控過程中起著重要作用，如細胞存活和細胞增殖的調控,由snoRNAs產生的sno-miRNAs產生的小RNA具有雙重功能,同樣的轉錄本可以作為snoRNA和miRNA的前體。ACA45是***個被報道...

四、FZD7是YTHDF1中真正的m6A修飾靶標 對于***腹肌Hippo或Wnt通路的13個轉錄本，我們采用了多步驟篩選策略(圖4A)。使用RIP結合qPCR驗證確定YTHDF1相互作用的轉錄本（4B）。Wnt途徑的FZD1、FZD7、CTBP2、MAP...

m6A酶系統 METTL3是早先被鑒定為結合SAM的組件，其缺失引起小鼠胚胎干細胞、Hela細胞和HepG2 細胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細胞核內亞細胞器－核小斑（Nuclear s...

三、pten - s38a突變誘導細胞凋亡抵抗 為了進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應，我們使用抗體陣列評估了表達PTEN-wt或PTEN-398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。Pten+/...

6.翻譯產物的序列組成 所有天然蛋白質的氨基酸（aa）序列*占據可能序列空間的一小部分，主要是因為只有一小部分序列可以形成穩定的蛋白質。因此，具有“非天然”序列的蛋白質傾向于快速降解，并且與所有天然蛋白質的序列相似性可以作為強有力的預測指標，以鑒定隨...

二、INPP4B增強pik3a突變ER+乳腺*和乳腺上皮細胞增殖 GFP-INPP4B在MCF-7和T47D ER+乳腺*細胞中表達，這兩種細胞分別有PIK3CAE545K和PIK3CAH1047R高活化突變.*細胞進行非錨定細胞生長的能力是細胞轉化...

circ_0072083 與 miR-1252-5p 相互作用以調節 TMZ 抗性 神經膠質瘤細胞中的 ALKBH5/NANOG 軸和 TMZ 抗性為了分析circ_0072083如何調節ALKBH5/NANOG軸，探索了潛在的 miRNA作為串擾。...

4）circPDE4B促進了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成，促進了RIC8A的降解 我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是，MS結果顯示circPDE4B也結合了兩個E3連接酶，包括RNF2和MID1。然而，由于RN...

1）USP35敲除抑制肺*細胞生長、集落形成和**進展 我們首先檢測了肺*組織和細胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示，USP35在肺ADC和SCC**中都***上調。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細胞系相比，USP35mRNA水平在肺*細胞...

NRF2是阻斷鐵死亡的關鍵介質，TYRO3過表達的293T細胞中NRF2轉錄活性增加。TAM激酶下游的PI3K/AKT信號通路可增加NRF2轉錄活性，TYRO3-OE介導的NRF2轉錄***被AKT抑制劑MK2206消除。這些結果表明TYRO3通過AKT/NR...

APCmRNA上的METTL3依賴性m6A上調抑制APC表達 為了確定METTL3依賴的m6A調控對APC表達的影響，構建了一個熒光素酶報告基因，熒光素酶分析顯示，METTL3缺失**增加了WTAPC的熒光素酶活性，而突變的APC提高了熒光素酶活性并...

6）MAPK1-109aa通過競爭性結合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化 為了研究MAPK1-109aa抑制GC的分子機制，我們將標記的MAPK1-109aa質粒轉染HEK293T細胞。在flag標記的MAPK1-109aa免疫沉淀復合物中，潛在的相...

確定關鍵驅動突變在原始和committed亞型中的分布(圖1C，補充討論中的亞型和突變部分和補充表6 17)。盡管亞型中富含某些突變(原始組的FLT3-ITD和承諾組的DNMT3A)，驅動突變的遺傳改變對原始和committed亞型的預測較差(補充圖3 16和...

在缺氧條件下的持續***誘導不同的細胞內程序 已知的缺氧信號靶點BNIP3在缺氧下升高，mTORC1在持續刺激下被***(圖3a)。從這四種條件中獲得的RNA序列被用來比較培養物和之前公布的數據之間的轉錄組。主成分分析顯示，所有四個群體的轉錄組都不同...

4）體外實驗表明，上調UCP1以減輕AKI期間的脂質積累，可通過影響炎癥和凋亡，***抑制疾病進展 越來越多的證據表明，在AKI中有明顯的脂質積累和UCP1的異常表達，并與腎損傷的嚴重程度有很強的相關性。為了確定脂質積累是否影響AKI期間的細胞功能，...