五、NF-κB調節表達VCAM1的近端小管亞群的分子特征 檢測了一組近端小管細胞,VCAM1的表達和染色質可及性增加,我們將其命名為PT_VCAM1(圖1)。免疫熒光研究表明,VCAM1在近端小管上皮中呈散在分布的表達(圖5a)。我們的單細胞研究估計...
1.FBW7促進胰腺*細胞脂質過氧化作者以分析在SW1990轉染pCMV-FBW7或空載體(GEO:accessionnumbersGSE76443)的高通量基因表達譜陣列研究FBW7在胰腺*中的作用。以谷胱甘肽代謝和脂肪酸代謝相關的氨基酸為重點,結果顯示,F...
4)circPDE4B促進了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成,促進了RIC8A的降解 我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是,MS結果顯示circPDE4B也結合了兩個E3連接酶,包括RNF2和MID1。然而,由于RN...
4、Sirt1是在MRL/lpr小鼠中hUC-MSCs介導的CD4+T細胞衰老所必須的 接下來,檢測了Sirt1是否是hUC-MSCs促進MRL/lpr脾CD4+T細胞衰老所足夠和必要的。研究發現,使用Sirt1抑制劑-EX527預處理MRL/lpr...
雄***和雄***受體(AR)是******轉錄因子(TF),是驅動前列腺*(PCa)發***展的關鍵因素。因此AR是晚期PCa******的主要分子靶點。雄***剝奪療法,特別是第二代抗雄***和雄***合成抑制劑**初是有效的。然而,由于患者仍然可以從晚期...
褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經元損傷 為了進一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經元損傷中的假定作用,在TBI后第3天,在受傷的皮層中觀察到了Fe2 +,Fe3+,總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導的血清和同側皮層中鐵含量的上...
FOXP4在MB細胞中起致*基因的作用 我們首先通過qPCR檢測FOXP4在MB**組織中的表達水平。FOXP4在MB**組織中的表達水平高于相鄰腦組織樣本。為了進一步闡明靶向FOXP4是否可以介導MB**進展,我們在Daoy細胞中進行了一系列功能檢...
C.為了評估這種差異對每種方法獲得的數據的影響,在TSS和CTCF轉錄因子結合位點附近覆蓋了Tn5足跡。在透性細胞中,TSS的信號被保留,但是與孤立的核相比,TSS的側翼位置(被鄰近的核小體占據)的信號減少了 D.用白細胞分離純化的pbmc比用Fic...
此外,circPDE4B不影響MID1水平(圖4E)。RPD和序列IP分析都顯示circPDE4B促進了RIC8A和MID1的結合(圖4F,G)。與這一發現相一致的是,體外結合試驗表明,circPDE4B增加了重組RIC8A和MID1蛋白之間的關聯(圖4H)。...
3、心肌LncHrt過表達挽救心肌梗死的轉錄組 為了探究LncHrt的分子機制,作者對LncHrt過表達的MI發生7天后的心臟組織和對照組進行了基因組RNA測序,鑒定差異表達基因(DEGs)。KEGG分析顯示這些上調的DEGs主要富集到代謝相關通路,...
越來越多的證據表明**相關巨噬細胞(TAMs)和外泌體在轉移前niche(生態位)形成中發揮重要作用。TAMs是轉移前生態位形成和結直腸*肝轉移(CRLM)的基礎。然而,**來源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機制仍然很大程度上未知。本研究發現...
細胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物,目前正在其他**類型的數百項臨床試驗中進行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內在細胞抑制機制,而其作為免疫調節劑的新作用知之甚少。本研究利...
5)MAPK1-109aa對胃*有抑制作用 為了進一步研究MAPK1-109aa的生物學功能,我們將circMAPK1ATG突變質粒、circMAPK1IRES突變質粒和circMAPK1過表達質粒轉染到MKN45和BGC823細胞中。如預期的那樣,...
外泌體成分包含蛋白質、miRNA、tRFRNA、LncRNA、circRNA,可調節多種生理或病理反應,包括血管生長、兔疫應答等。同時,miRNA也可以作為**診斷以及預后標志物。其中的tRFRNA也是目前的研究熱點,其在體內參與多種生理及病理過程,包括病毒*...
為了檢測該多肽產物,我們使用了一種識別MAPK1中間部分的抗體(圖4d)。Western Blot檢測40對胃*組織(圖4e)和細胞系(圖4f)中MAPK1-109aa和MAPK1的水平。通過半定量分析,胃*組織中MAPK1-109aa水平較正常胃組織中降低。...
哺乳動物細胞DNA損傷反應(DDR)信號的**是共濟失調***擴張癥突變(ATM)和ATM-和rad3相關(ATR)蛋白激酶。ATM和ATR磷酸化并***另外兩個激酶CHK1和CHK2, CHK1和CHK2與ATM和ATR一起,是細胞周期檢查點[24]的主調節...
外泌體circ_0072083與膠質瘤患者的TMZ耐藥、診斷和生存有關 為了分析外泌體 circ_0072083 在膠質瘤患者中的價值,從患者的血清樣本中分離外泌體。通過 TEM 和特定標記物(CD63、CD81 和 TSG101)驗證外泌體。此外,...
CircRNF13在鼻咽*臨床樣本中低表達 作者對NPC細胞進行高通量測序獲得cicRNA表達譜,總計鑒定到6153個circRNAs,并包括了5種類型的circRNA。其中豐度較高的circRNF13相對于非**的鼻炎上皮細胞(NPE),在NPC中...
有趣的是,通過蛋白-RNA,RNA-RNA相互作用預測工具(catRAPID61和IntaRNA62-65)進行分析,發現PTBP1和NAS1分別與NR2F1-5 '的多嘧啶和gc富集區域結合。通過RIP和pull down實驗對NR2F1 mRNA不同區域的...
外泌體可調節多種生理或病理反應,包括**細胞侵襲與轉移、血管生長免疫應答等。外泌體中的SmallRNA分子比較穩定,含量相對豐富,是目前外泌體研究的重點。外泌體的miRNA與多種疾病的**、心血管疾病、免疫疾病、神經系統疾病的發生、耐藥密切相關,同時外泌體mi...
五、急性GvHD的嚴重程度可以在造血干細胞移植之前通過口腔微生物群的組成來預測 A.相對豐度:隨著時間的推移,在0級aGvHD患者的口腔中12個**豐富的家族。B.svmLinear模型識別出的前20名口腔預測ASV的重要性圖,重要性分數表示剔除該A...
為了進一步鑒定IGF2BPs泛素化的E3連接酶,RNA pulldown質譜結果中在156種潛在的相互作用蛋白中發現了兩種E3連接酶TRIM25和HECTD3。 使用WB分析, TRIM25與circNDUFB2特異性相關。 RIP分析進一步證實了circND...
了解流量調節內皮基因的表達在轉錄和體內外遺傳性染色質易訪問性水平,我們和其他人使用批量rna或dna從池獲得ECs暴露s-flow或維使用鼠標部分頸動脈結扎(PCL)模型或豬動脈。我們建立了PCL模型,并顯示在2周內,d-flow快速誘導,而s-flow阻止,...
VD可修復高糖誘導的HK-2細胞自噬缺陷 我們探討了pari對體外DN細胞自噬和炎癥的影響。我們用高水平葡萄糖(HG)處理HK-2細胞。如圖4A所示,在高糖條件下,LC3-II和SQSTM1的表達增加,在自噬抑制劑氯喹(CQ)作用下,LC3-II和S...
piRNA-30473在DLBCL中升高,是DLBCL患者的不良預后因素 作者首先研究小RNA的表達水平與DLBCL患者的臨床相關性。通過分析微陣列數據,與預后不良組(PP)比較,在預后良好(FPP)的病例中發現了4個***下調或上調的piRNAs(...
由于p65轉位到細胞核并促進其靶向基因的轉錄,假設NFκB/p65信號通路的***可通過p65的轉錄活性上調miR-934表達。在p65和miR-934啟動子之間發現了5個潛在的轉錄結合區域和2個特異性結合位點(Fig. 8d)。隨后,用miR-934啟動子中...
MAP4K4是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族的成員,可以通過磷酸蛋白MEKK1***MAPK通路。構建pCMV-NM_4834.4和pCMV-NM_1242560.1質粒,分別轉染K1細胞,并通過qRT-PCR驗證了其轉染效率(圖6E)。這兩種變異***增強了...
6)SsD抑制患者原代細胞 我們從吉林大學***醫院**組織/生物標本庫獲取AML患者外周血,進一步評估SsD對白血病進展的影響。SsD***抑制了白血病細胞增殖(圖6A)、集落形成能力(圖6B)、誘導細胞周期阻滯(圖6C)。在機制上,這是由FTO介...
接下來,我們合成了野生型HuR蛋白(WT)和HuR蛋白的截短突變體(即分別為單獨HuR的RNA識別基序(RRM)1的突變體B1、單獨HuRRRM2的突變體B2和單獨HuRRRM3的突變體B3)(圖4C)。同時,我們設計并合成了生物素標記的或未標記的探針,分別特...
1、在響應CDK4/6抑制中瘤內記憶類CD8+T細胞的表現 為了***評價CDK4/6抑制對抗**T細胞免疫的影響,使用多模式單細胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或對照處理的MC38-OVA**小鼠的瘤內T細胞...