與coaccessibilityscore較高的Cicero連接相比，coaccessibilityscore較低的Cicero連接在GeneHancerdoubleelite數據庫中的可能性較小(p<2.21016，卡的平方)。在近端曲小管內，大部分C...

急性腎損傷(Acute kidney injury, AKI)是一種起病急、進展快、預后差的嚴重臨床急癥。**近的證據表明，AKI伴隨著***的代謝異常，包括脂質代謝的改變。然而，脂質在AKI中的具體變化及其作用和調控機制目前尚不清楚。***小編給大家帶來于2...

越來越多的證據表明**相關巨噬細胞（TAMs）和外泌體在轉移前niche（生態位）形成中發揮重要作用。TAMs是轉移前生態位形成和結直腸*肝轉移(CRLM)的基礎。然而，**來源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機制仍然很大程度上未知。本研究發現...

***是一種系統性疾病，與炎癥細胞浸潤和免疫相關途徑的***有關。本文旨在揭示與免疫相關的變化，并探索頸***斑塊形成過程中的新型免疫學特征。首先，我們應用了集成的生物信息學方法，包括CIBERSORT和基因集富集分析（GSEA）。基因表達矩陣GSE28829...

4）USP35過表達減少erastin/RSL3觸發的鐵紊亂和鐵死亡 erastin和RLS3誘導的ROS和MDA生成因USP35過表達而減少(圖4A，B)。此外，在erastin和RLS3處理的*細胞中，HETEs水平升高，但在除12-HETE外的...

在Jurkat和小鼠T細胞中檢測到多個肽上特異性磷酸化位點的***缺失，包括典型的CDK4/6靶標RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是，RB在兩種細胞蛋白組學中重疊，并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的（Fig. 3B，3...

AP損傷后胰腺巨噬細胞的表型變化 A動物模型使用雨蛙素誘導，。為了研究AP后的修復/再生過程，用更高劑量的雨蛙素（100μg/kg，每小時10次）誘導AP，并在一周內的不同時間點收集胰腺。接受雨蛙素誘導***的AP小鼠在24小時后顯示出腺泡壞死和白細...

Circ-0004872(本研究稱為““circMAPK1”)來自MAPK1基因的第2-4個外顯子，形成一個490 nt的重疊環狀轉錄本(圖1e)。Sanger測序證實了擴增的circMAPK1的頭尾剪接(圖1f)。接下來，我們研究了circMAPK1在GC細...

總之，如Fig. 9，CRC來源的外泌體miR-934可通過下調PTEN表達和***PI3K/AKT信號通路誘導M2巨噬細胞極化。此外，外泌體miR-934極化的M2巨噬細胞可以通過CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR934正反饋環促進CRLM。...

作者收集并分析了黑色素瘤患者在***過程中的連續血液樣本，在此期間，患者接受CDK4/6i聯合靶向MEK抑制劑***，隨后接受PD-1和CTLA-4 ICB聯合***（Fig.6 F），患者達到完全緩解。使用CITE-seq技術評估一系列患者樣本，觀察到C...

4）APP/PS1小鼠大腦皮質區受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高 我們研究了NOX4來源的氧化應激在APP/PS1小鼠受損星形膠質細胞中的作用。我們用免疫熒光染色法測定了APP/PS1小鼠和野生型(WT)小鼠大腦皮層GFAP陽性星形...

2、白樺素下調SREBP靶基因，降低細胞脂質水平 由于SREBP-2是其自身的直接靶標，因此白樺素將其表達下調40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉錄因子這一觀點一致，膽固醇合成途徑中的10個被測基因，例如HMGCR，HMG-Co...

5）下調STK39可抑制乳腺*細胞EMT、遷移和侵襲為了進一步研究STK39在乳腺*中的作用，我們在MDA-MB-231和MDA-MB-157細胞中建立了STK39敲低的克隆。我們使用兩個**的shRNA實現了內源性STK3980-90%的敲除效率。在這兩個克...

2.TYRO3使**細胞對抗PD-1***耐藥 在同系BALB/c小鼠模型中比較了Tyro3過表達(Tyro3-OE)和4T1-P細胞對抗mPD-1***的反應。在荷4T1-P**的小鼠中，抗mPD-1******減少**的生長，并延長了生存期。這些...

為了確定s-flow和d-flow在體內單細胞分辨率下對ECs基因轉錄表達和染色質可及性譜的全基因組影響，我們使用小鼠PCL模型進行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結扎，以暴露于血流的對側RCA作為對照，在LCA中誘導d...

盡管轉錄組學技術在過去幾十年中發展迅速，但由于芯片和RNA-seq之間固有的可變性差異，對混合數據的綜合分析仍然具有挑戰性。本文提出了Rank-In（/rank-in/）來糾正兩種技術之間的非生物效應，從而能夠自由混合數據以進行整合分析。網站首頁如...

二、染色質的可及性明確了細胞的類型 我們使用R包Signac來研究不同細胞類型間染色質可及性的差異。細胞類型可以根據差異開放區域（DARs）是開放的還是封閉的來區分(Fig.2a）。約20%(平均比例=0.2030.04)的DAR與各自細胞類型中的差...

4）USP35過表達減少erastin/RSL3觸發的鐵紊亂和鐵死亡 erastin和RLS3誘導的ROS和MDA生成因USP35過表達而減少(圖4A，B)。此外，在erastin和RLS3處理的*細胞中，HETEs水平升高，但在除12-HETE外的...

接下來為了證明，SUMOylation對BCas誘導的淋巴內皮管的形成和遷移作用，通過其特異性抑制劑阻斷SUMOylation （2D-08）明顯抑制了該誘導過程（Figure 1 G-I）。以上數據表明，UBC9異常高表達與膀胱*進展和淋巴結轉移正相關，...

長鏈非編碼RNAlongnoncodingRNA,IncRNA)指的是長度在200-100000nt之間的RNA分子。它們不編碼蛋白,但參與細胞內多種過程調控。近年來的研究表明,IncRNA參與了X染色體沉默。基因組印記以及染色質修飾,轉錄***。轉錄干擾。核...

腸道菌群與結直腸*(CRC)之間的關聯已被***研究。然而，用于多個人群的早期診斷標記仍然難以捉摸。本研究對1056例糞便樣本進行了綜合分析，以確定與CRC相關的微生物作為早期檢測CRC的標志物。 1.meta-analysis 對來自4項研究...

4、Sirt1是在MRL/lpr小鼠中hUC-MSCs介導的CD4+T細胞衰老所必須的 接下來，檢測了Sirt1是否是hUC-MSCs促進MRL/lpr脾CD4+T細胞衰老所足夠和必要的。研究發現，使用Sirt1抑制劑-EX527預處理MRL/lpr...

核仁小RNA(snoRNAs)是一類***存在于真核生物細胞核仁的小分子非編碼RNA，長度60-300nt，能與核仁核糖**白結合形成snoRNPs復合物[1]。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內含子區域，并且經過進一...

NRF2是阻斷鐵死亡的關鍵介質，TYRO3過表達的293T細胞中NRF2轉錄活性增加。TAM激酶下游的PI3K/AKT信號通路可增加NRF2轉錄活性，TYRO3-OE介導的NRF2轉錄***被AKT抑制劑MK2206消除。這些結果表明TYRO3通過AKT/NR...

神經性疼痛和炎癥PCR基因芯片可用于研究與疼痛反應的傳導、維護和調節相關的84個基因的表達。有害環境刺激、組織損傷和疾病都可以引起疼痛。由于疼痛折磨著大約20%的人口,所以疼痛既提供了大量的***目標，同時也提供一個可以了解神經系統的功能及分子機制的途徑。雖然...

在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發現（Figure5G,H）。FRET技術分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比，熒光強度發生了巨大的變化：從520nm到570–580nm,熒光強度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TT...

7.胰腺*組織中FBW7與NR4A1、SCD1相關作者檢測了在PADC患者組織中FBW7、NR4A1和SCD1表達之間的關系。對FBW7、NR4A1、SCD1進行組織免疫熒光檢測，分別標記不同的熒光信號。結果顯示，FBW7低表達時，NR4A1和SCD1高表...

由于MLL1在HoxBlinc過表達介導的異常造血過程中至關重要，HSPC中HoxBlinc過表達可能通過增加MLL1募集來***其靶基因，從而提高H3K4me3占用率，以促進增強子/啟動子染色質的可及性。為了證實這一點，使用WT和HoxBlincTg L...

因為CXCL13是一種趨化劑，可以促進表達CXCR5的細胞趨化，使用IHC染色評估其在CRC中的表達，結果顯示CXCR-5在結直腸*組織中的染色強于正常組織，說明M2極化巨噬細胞分泌的CXCL13主要作用于CRC細胞（Fig. 7d）。PMA預處理后的THP-...

生物發光成像結果顯示，在circACTN4過表達組中檢測到更強和更多的生物發光信號，而circACTN4沉默組中的小鼠與對照組相比顯示出更少的生物發光轉移數量。與對照組相比，circACTN4 過表達組的小鼠總體存活率較低，肝轉移范圍更廣。***，我們通過 I...