如圖4所示，與LS相比，慢性OS降低了KLF2和KLF4的表達，同時誘導了EndMT標記物(SNAI1和TAGLN)。重要的是，慢性OS誘導了兩個巨噬細胞標記基因(C1QC和C5AR1)的表達，直接證明了OS可以在體外誘導EndICLT。此外，我們利用小鼠PC...

3.IRES序列由于circRNA是共價閉環分子，沒有游離末端，因此circRNA的翻譯必須使用一種非經典的啟動機制，即不依賴5’-帽子的翻譯啟動。這種起始途徑往往通過IRES（內部核糖體進入位點）驅動，IRES是具有特殊二級結構的短RN**段。在病毒中發...

CircACTN4促進體內異種移植**的發生和轉移 為了評估circACTN4在體內的致*作用，通過皮下注射和尾靜脈注射在裸鼠中建立人BC細胞**模型。用過表達 circACTN4 慢病毒或 circACTN4 shRNA 慢病毒及其對照***的 M...

四、Multimodal分析突出了肥大的上行肢體的細胞異質性 為了確定我們是否能夠檢測出具有可變claudin表達模式的細胞亞群，在snRNA-seq數據集的umap圖上劃分三個亞種群(TAL1,TAL2和ATL)。ATL，上升細肢。顯示了TAL各亞...

一、LC3陽性囊泡在質膜損傷后在修復部位積聚 用激光照射*細胞MCF7，致使細胞膜上形成小孔。使用膜不可滲透的FM1-43染料測量膜完整性，發現在Ca2+存在下，細胞能夠在20到30s內修復它們的質膜(Fig.1,AandB,left)；在缺乏Ca2...

***，分析了MAOA基因表達水平與幾種**病人臨床預后的關系，結果顯示瘤內MAOA基因與卵巢*，淋巴*和乳腺*患者的臨床總生存率呈現負相關關系（圖6o-q）。此外，黑色素瘤患者**內高水平的MAOA表達很大程度上抵消了PD-1***提供的生存好處，提示MAO...

人PTC組織中tRFs和tiRNAs的表達為了鑒定人PTC組織中的tRFs和tiRNAs，收集3對PTC*組織和*旁組間，用于高通量測序，其結果比對至tRNAlibraryGtRNAdb文庫，并從中去除線粒體tRNA。**終累計獲得1723個tRN**段，其中...

此外，GFP-INPP4B的表達在基礎和wnt刺激條件下降低了GSK3β蛋白水平，與GSK3β的增強破壞一致(圖6d)。通過HrsshRNA消耗抑制晚期核內體形成后，降低的GSK3β蛋白水平得以恢復(圖6f,g)。GFP-INPP4B而不是gfp載體細胞表現出...

基因芯片 (gene chip)是目前生物芯片家族中**完善、應用*****的芯片，將許多特定的寡聚核苷酸或DN**段(稱為探針)固定在芯片的每個預先設置的區域內，將待測樣本標記后同芯片進行雜交，利用堿基互補配對原理進行雜交，通過檢測雜交信號并進行計算機分析，...

二、染色質的可及性明確了細胞的類型 我們使用R包Signac來研究不同細胞類型間染色質可及性的差異。細胞類型可以根據差異開放區域（DARs）是開放的還是封閉的來區分(Fig.2a）。約20%(平均比例=0.2030.04)的DAR與各自細胞類型中的差...

4）SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導m6A修飾 為了檢測m6A在RNA上的變化，我們在SsD處理的白血病細胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示，SsD***增加了m6A在轉錄組中的豐度。此外，HPLC-MS/MS定量證實了SsD處...

WNT信號通路qBiomarker拷貝數PCR芯片用于研究WNT信號傳導通路上已報道發生頻繁突變的23個基因的拷貝數。芯片上基因的選擇包括WNT通路組件、與WNT通路交互作用的分子或通路以及WNT通路效應器。這些基因編碼細胞粘附分子、受體、轉錄因子和調節細胞周...

5）SsD可***抑制AML在體內的進展 為了研究SsD在體內對白血病的***效果，我們建立了C1498和FLT3+白血病小鼠模型(圖5A)。對照組小鼠的白細胞生長較快。0.1mg/kg或0.5mg/kg劑量的SsD***抑制WBC生長(圖5B)。與...

2021年5月，***一篇發表在cancer research（IF=12.7000）的文章（YTHDF1 Promotes Gastric Carcinogenesis by Controlling Translation of FZD7）。此研究分析了cB...

基序分析發現E2F TF基序在乙?；档拖嚓P區域***富集，在T細胞記憶驅動因子相關基序乙?；黾?，包括含叉頭框因子(Fig. 2F)。為了確定這些變化是否伴隨著對不同細胞狀態的長期表觀遺傳影響，在CDK4/6抑制后對體外活化的T細胞進行了ATAC-seq，觀...

circACTN4增加遷移和侵襲并調節BC細胞的細胞周期進程 為了進一步評估circACTN4在BC進展中的作用，在circACTN4過表達或敲低后研究了BC細胞的遷移、侵襲和細胞周期。劃痕和transwell試驗表明，BC細胞的侵襲和遷移能力因ci...

與CRC細胞共培養可通過ALKBH3增加血細胞5’-tRF-GlyGCC 與所有檢測的CRC細胞共培養可***提高PENG-EBV細胞中的5’-tRF-GlyGCC水平。與CRC細胞共培養可***提高THP-1細胞中5’-tRF-GlyGCC水平。與...

表達PTENWT的細胞，在雙胸苷激酶阻斷和輻射釋放后被阻滯在S期，表現出低水平的CDK2磷酸化(圖5A)。相反，經過相同處理的PTEN-398A細胞有更高水平的磷酸化CDK2(圖5A)，這與DNA損傷檢查點的缺陷***一致。與PTEN-WT細胞相比，PTEN-...

A.29名兒童在進行異體造血干細胞移植前、移植時、移植后即刻以及后期隨訪時均進行了監測。監測患者的基線特征、臨床結果、免疫細胞計數以及炎癥和***標志物。表S1(附加文件1)詳細描述了患者特征。宿主免疫系統參數與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動力學相關，這...

了解流量調節內皮基因的表達在轉錄和體內外遺傳性染色質易訪問性水平,我們和其他人使用批量rna或dna從池獲得ECs暴露s-flow或維使用鼠標部分頸動脈結扎(PCL)模型或豬動脈。我們建立了PCL模型，并顯示在2周內，d-flow快速誘導，而s-flow阻止，...

在Fth- KO小鼠中， TBI后褪黑素對神經的保護作用被**取消 為了進一步探索神經元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導的鐵死亡的影響，測量了鐵死亡的幾種假定的生物標志物。發現***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平沒有影響。令人驚訝的是，盡管褪黑...

我們接下來試圖識別circPDE4B上游調節器。我們首先對circPDE4B側翼序列進行RNA pull-down-MS檢測，發現兩個與RNA剪接相關的RBP，包括DExH-box helicase 9和FUS(圖1G)。RT-qPCR結果顯示，FUS敲除后，...

3）LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解 由于PGK1是一種關鍵的糖酵解酶，而LINC00926被鑒定為負調控PGK1的lncRNA，我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導的乳腺*細胞增殖抑制中發揮作用。我們測試...

蛋白質生物標志物 MarkerDB中142個蛋白質生物標志物覆蓋了160多種疾病。MarkerDB中的所有蛋白質生物標記物數據都是從OncoMX、CBD和UPBD原始文獻中提取的，結構數據從蛋白質數據庫PDB收集。目前，MarkerDB中的所有蛋白質...

6.大腸腺瘤預測模型的特異性驗證 提高標志物的特異性可以減少臨床診斷中的假陽性，因此有必要進一步評估腺瘤標志物的特異性，在此分析中，考慮了5種非CRC疾病，包括克羅恩病（CD），潰瘍性結腸炎（UC），腸易激綜合征（IBS），非酒精性脂肪肝疾?。∟AF...

2.Lnc-PMIF抑制OPCs遷移到骨形成表面 在成骨細胞分化過程中，lnc-PMIF在早期增加，在礦化啟動后減少，表明lnc-PMIF可能在成骨分化的早期階段發揮作用。過表達/敲低lnc-PMIF不影響OPCs的增殖和成骨分化。敲低lnc-PMI...

8.EVs介導的ELNAT1上調HLECs中SOX18的表達 qRT-PCR分析UM-UC-3-EV1載體或UM-UC-3-EVELNAT1處理的HLECs中淋巴管生成相關基因的表達，結果顯示SRY-box轉錄因子18（SOX18）是**明顯的與EV...

SIM2是否也影響AR與染色質的結合，我們在SIM2沉默后進行AR ChIP-seq。如圖7所示，受體與大多數arb的結合沒有改變。然而,SIM2沉默影響2265 ARBs藥物通過降低和增加染色質占用大約相同數量的地點(圖7 a、b)。當反映這些siSIM2-...

人類的視黃酸信號通路PCR芯片用于研究參與視黃酸信號通路的84關鍵基因的表達。視黃酸(RA)具有重要的生物學功能，由維生素A(視黃醇)派生而來，其活性涉及多種生物學過程如脊椎動物發育和內穩態而中斷這個途徑會導致心臟、神經、生殖、和皮膚組織等發育異常和功能中斷。...