轉錄組學 (RNA-Seq) 模塊 RNA-seq 模塊對與衰老相關的全基因組轉錄組變化進行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來自與衰老研究相關的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預（過表達、敲除等）時觀察到的轉錄組變化，該模塊還收集特定組織和...

六、改進分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs 研究者基于細胞表面標記設計了一種針對HSCs / MPP的新的熒光***細胞分選策略（簡稱CD-REF），使用CD-REF分選板對股骨BM細胞進行分選，結果顯示標記為HSCs / MPP和HSCs / M...

胰腺*(PC)是**棘手的**之一，被認為是預后**差的消化系統(tǒng)**。外泌體是微環(huán)境中**細胞和基質(zhì)細胞之間相互交流的重要介質(zhì)。**的發(fā)展不僅由*細胞決定，還受**微環(huán)境(Tumor microenvironment, TME)中缺氧、脂質(zhì)和間質(zhì)細胞這三個重要...

5、GPX4活性預防鐵死亡促進轉移作者推測細胞對鐵死亡的抗性可能使細胞能夠抗住在轉移過程中面臨的代謝和環(huán)境壓力。注射Py230-27HCS細胞的小鼠發(fā)生micrometastasis，而注射Py230-27HCR細胞的小鼠發(fā)生macrometastasis；但...

為了檢測補充NAD + 是否可以糾正IFNα刺激的下游效應，用1 mM β-煙酰胺單核苷酸(NMN)培養(yǎng)CD8 + T細胞以恢復NAD +/NADH比值（圖6e）。然后，評估了用抗CD3/CD28再刺激后的氧化反應和細胞活力。補充NMN的NAD + 增加了OC...

為了確定CRC細胞來源的外泌體miR-934是否誘導巨噬細胞的M2極化，首先生成了miR-934 mimics和anti-miR-934來過表達或抑制miR-934的表達。與對照組相比，轉染miR-934 mimics的巨噬細胞M2標記物(CD163、CD20...

總的來說，在處理與脂質(zhì)代謝失調(diào)相關的壓力時，細胞如何上調(diào)GPX4軸的活性和/或減少對GPX4的依賴以適應這種壓力，這有增加細胞轉移能力的附帶責任。急性27HC 處理通過干擾SREBPs和LXR信號傳導擾亂脂質(zhì)代謝，從而導致了細胞生長和遷移的抑制。*細胞可以適應...

本文鑒定了一種名為LncHrt的新型心肌細胞富集的lncRNA，它作為心臟代謝的重要調(diào)節(jié)因子發(fā)揮作用。LncHrt是MI反應中下調(diào)**多的lncRNA，對心臟穩(wěn)態(tài)至關重要，因為LncHrt的耗竭會損害心臟形態(tài)、代謝和功能。重要的是，心臟特異性過表達LncHrt...

為了表征RIT1相互作用組，我們進行了親和純化-質(zhì)譜篩選(圖1A)，確定MAD2(MAD2L1)和p31conmet(也稱為MAD2L1結合蛋白)作為新的和選擇性的RIT1結合伙伴，不與其他RasGTPases相互作用(圖S1A和S1B)。MAD2參與了在未附...

SIM2是否也影響AR與染色質(zhì)的結合，我們在SIM2沉默后進行AR ChIP-seq。如圖7所示，受體與大多數(shù)arb的結合沒有改變。然而,SIM2沉默影響2265 ARBs藥物通過降低和增加染色質(zhì)占用大約相同數(shù)量的地點(圖7 a、b)。當反映這些siSIM2-...

6）NOX4誘導的線粒體代謝損傷通過抑制人類星形膠質(zhì)細胞的細胞抗氧化過程而誘導氧化應激 我們研究了NOX4誘導的線粒體代謝損傷是否可以通過抑制人體星形膠質(zhì)細胞的細胞抗氧化過程來誘導氧化應激。與對照組相比，NOX4的升高***降低了谷胱甘肽(GSH)水...

外泌體circ_0072083的分泌依賴于TMZ抗性神經(jīng)膠質(zhì)瘤細胞中的Warburg效應 為了探索circ_0072083是否通過外泌體攜帶，從TMZ抗性和敏感細胞的培養(yǎng)基中分離外泌體。外泌體通過TEM 確認。大小主要在 100-200 nm，抗性細...

3、白樺素可以改善小鼠飲食導致的肥胖并增加能量消耗 接下來，研究了白樺素在體內(nèi)的作用。洛伐他汀是一種HMGCR抑制劑，具有良好的有益作用，將其與白樺素進行比較。用對照（鹽水），洛伐他汀（30mg/kg/day）或白樺素（15或30mg/kg/day）...

紡錘體裝配檢查點(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點延遲有絲分裂進入后期，直到適當?shù)娜旧w分離得到保證。這一安全機制的破壞導致基因組不穩(wěn)定和非整倍體，這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而，盡管了解了控制SAC的基本機制，但信號通路如何...

自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進行運輸、溶解。研究表明，自噬異常會影響疾病進程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會增強*細胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等...

點擊該基因的名稱，將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻中的更多詳細信息。***，在“詳細信息”部分中總結了有關疾病，細胞類型和基因的詳細信息。SC2disease還提供了從基于單細胞的結果和基于GWAS的結果得出的疾病的...

IGF2BP結合區(qū)域包含“GGAC”N6-甲基腺苷（m6A）**基序。IGF2BPs是m6A結合蛋白。為了探索circRNA和IGF2BP之間的相互作用是否通過m6A依賴性的方式進行調(diào)節(jié)，對circNDUFB2進行了MeRIP，并觀察到circNDUFB2中m...

結果1）circPDE4B在OA組織中表達較低 我們之前對3個臨床OA和3個對照樣本的軟骨細胞核糖體RNA缺失的總RNA進行了RNA-seq分析。在數(shù)量**多的50個***調(diào)控異常的circRNA中，circPDE4B的表達水平排名***。我們評估了...

1）USP35敲除抑制肺*細胞生長、集落形成和**進展 我們首先檢測了肺*組織和細胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示，USP35在肺ADC和SCC**中都***上調(diào)。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細胞系相比，USP35mRNA水平在肺*細胞...

CD163是一種免疫調(diào)節(jié)劑，是巨噬細胞清清體受體家族的成員，已知在單核細胞系的AML細胞中表達。在 committed cluster 中其他基因的高表達包括免疫相關基因，如C1QA, CD14和MARCO。msl1基因，一種已知的白血病干細胞增殖抑制因子，也...

2、miR-208b由結腸*細胞以外泌體的方式分泌 隨后，作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導。分離鑒定了3株CRC細胞系的外泌體，并檢測了其中miR-208b的表達。外泌體中miR-208b的表達模式和在細胞中的模式一致，在SW48...

CircACTN4 直接與 FUBP1 相互作用并*** MYC 的轉錄 為了探索circACTN4的分子機制，首先進行了pull down和質(zhì)譜分析circACTN4結合蛋白，發(fā)現(xiàn)FUBP1在circACTN4上顯著富集。RIP 檢測進一步證實 F...

3）STK39與SNAI1相互作用，并使T203上的SNAI1磷酸化為了描述STK39與SNAI1的相互作用，我們在HEK293T細胞***表達Myc-STK39和HA-SNAI1，并進行了共同免疫沉淀(IP)實驗。在SNAI1的IP之后，我們檢測到一個相關的...

在CRC和HC鑒定的628個和745個tDR中，每組分別有85個和202個tDR。此外，CRC患者血漿中81個tDR較HC患者明顯增加。為了驗證小RNA測序結果，對上述3例CRC和3例HC受試者血漿樣本中5例上調(diào)的候選tDR進行了qRT-PCR檢測。CRC...

胰腺*(PC)是**棘手的**之一，被認為是預后**差的消化系統(tǒng)**。外泌體是微環(huán)境中**細胞和基質(zhì)細胞之間相互交流的重要介質(zhì)。**的發(fā)展不僅由*細胞決定，還受**微環(huán)境(Tumor microenvironment, TME)中缺氧、脂質(zhì)和間質(zhì)細胞這三個重要...

PTEN是一種**抑制因子，調(diào)節(jié)多種細胞功能，包括***，PI3K/AKT信號通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此，推測PI3K/AKT信號通路可能參與CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化。WB結果顯示過表達PTEN可...

三、染色質(zhì)可及性與細胞類型特異性轉錄因子活性和染色質(zhì)相互作用網(wǎng)絡有關 HNF4A編碼驅(qū)動近端小管分化的關鍵轉錄因子。chromVAR檢測到近端小管DAR中HNF4A結合基序的富集(圖3b，基序活性)，這是HNF4A中染色質(zhì)可及性增強(圖3b，基因活性...

CircCwc27能直接與Pur-α蛋白結合，并影響Pur-α蛋白分布為進一步探索CircCwc27引起AD的分子機制，作者假設CircCwc27具有翻譯功能，但通過RegrRNA2.0分析，并未發(fā)現(xiàn)CircCwc27序列中包含開放的閱讀框架(ORF)，表明C...

利用METABRIC數(shù)據(jù)集，我們評估了1459例ER+乳腺*中17個常見Wnt/β-catenin通路基因的表達，包括幾個Wnt靶基因(圖7a)。為了確定INPP4B是否促進PI3K和Wnt/β-catenin通路之間的對話，我們用增加劑量的PI3K抑制劑BK...

ReducedRepresentationBisulfiteSequencing(RRBS)是-種準確、高效、經(jīng)濟的DNA甲基化研究方法,通過酶切富集啟動子及CpG島區(qū)域,并進行Bisulfite測序,同時實現(xiàn)DNA甲基化狀態(tài)檢測的高分辨率和測序數(shù)據(jù)的高利用率...