4）miR-337-3p/miR-137在子宮內(nèi)膜*組織中表達(dá)較低，miR-337-3p/miR-137是MIR210HG的靶點(diǎn) qPCR結(jié)果顯示，**組織中miR-337-3p和miR-137的表達(dá)明顯下調(diào)(圖4A)。此外，采用Pearson等級(jí)相關(guān)法分析miR-337-3p、miR-137與MIR210HG表達(dá)的相關(guān)性(圖4B)。隨后，我們分析了HMGA2與miR-337-3p/137表達(dá)的關(guān)系(圖4C)。我們進(jìn)行了熒光素酶實(shí)驗(yàn)，以確定MIR210HG是否可以直接靶向miR-337-3p和miR-137在預(yù)測的結(jié)合位點(diǎn)(圖4D)。為了確定MIR210HG是否與miRNA核糖**白...

10.EVs介導(dǎo)的ELNAT1與BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān) 確定EVs介導(dǎo)的ELNAT1在BCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的臨床意義十分重要。首先，作者發(fā)現(xiàn)來自BCa患者的尿中EVs與配對(duì)BCa組織的ELNAT1表達(dá)呈正相關(guān)，這意味著EVs介導(dǎo)的ELNAT1是BCa中ELNAT1調(diào)控的重要參與者（Figure10A）。同時(shí)，BCa患者的尿中EV介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)與BCa的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān)（Figure10B）。EV介導(dǎo)的ELNAT1表達(dá)較高的BCa患者總生存期（OS）和無病生存期（DFS）率較短（Figure10C-D）。ROC分析顯示尿液中EV介導(dǎo)的ELNAT1可有效區(qū)分BCa患者與健康志愿者...

作者構(gòu)建了 (WT) SLC7A113’-UTR和突變型(Mut) 3’-UTR兩種質(zhì)粒(圖6H)。結(jié)果表明，只有過表達(dá)YTHDC2WT降低SLC7A11 mRNA在H1299細(xì)胞中的穩(wěn)定性，敲除YTHDC2可以提高SLC7A11 mRNA在H1975細(xì)胞中的穩(wěn)定性。然而，與WT 3’-UTR相比，Mut報(bào)告基因的這些作用減弱(圖6I和J)。在檢測外源性F-Luc-SLC7A11融合mRNA的RNA穩(wěn)定性后，得到了類似的結(jié)果(圖6K-M)。總的來說，3’-UTR上的m6A位點(diǎn)對(duì)于YTHDC2使SLC7A11 mRNA不穩(wěn)定至關(guān)重要。 7.抑制YTHDC2對(duì)XC-系統(tǒng)靶向***敏感，并...

2021年，來自加拿大多倫多大學(xué)和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學(xué)等團(tuán)隊(duì)合作在Nature communication雜志上發(fā)表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報(bào)道描述了npm1突變AML患者的分子異質(zhì)性。基于rna-seq的基因表達(dá)譜分析，確定了兩種新亞型，稱為原始型和committed型。基于基因表達(dá)、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異，在**的AML隊(duì)列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態(tài)和患者生存聯(lián)系起來。此外，表明了在缺...

五、YTHDF1以m6a依賴的方式調(diào)控FZD7的表達(dá) 在GC-803和胃*細(xì)胞株基礎(chǔ)上，進(jìn)行m6A-qPCR和YTHDF1 RIP qPCR的基因特異性分析。確實(shí)，在FZD7 mRNA中觀察到兩個(gè)m6A峰，并且在MGC-803和HGC-27細(xì)胞中證實(shí)了與YTHDF1的關(guān)聯(lián)(圖5A和B)。標(biāo)記YTHDF1突變體(YTHDF1- mut)具有兩個(gè)關(guān)鍵氨基酸突變(K395A, Y397A)以消除其m6binding口袋(44)，將其轉(zhuǎn)染到MGC-803和HGC- 27細(xì)胞中(圖5C)。在YTHDF1野生型(YTHDF1- wt)轉(zhuǎn)染的胃*細(xì)胞中觀察到的FZD7表達(dá)上調(diào)在YTHDF1- mu...

為了進(jìn)一步確定過表達(dá)的Caspase-11是否足以加重MCD誘導(dǎo)的NASH，我們給小鼠使用了Caspase-1抑制劑belnacasan。belnacasan******降低MCD***對(duì)照組小鼠的脂肪變性評(píng)分(圖8H)。相比之下，belnacasan***不影響MCD處理的Caspase-11過表達(dá)小鼠的脂肪變性評(píng)分。同樣，belnacasan處理***降低了MCD處理對(duì)照組小鼠的腫脹評(píng)分(圖8I)、血清ALT(圖8J)、AST(圖8K)和肝臟甘油三酯(圖8L)，而MCD處理過表達(dá)Caspase-11小鼠的這些指標(biāo)沒有明顯影響。綜上所述，過表達(dá)Caspase-11足以促進(jìn)MCD誘導(dǎo)的小鼠...

7）FOXO3A/LINC00926/PGK1軸調(diào)節(jié)乳腺***生長和肺轉(zhuǎn)移 為了證實(shí)FOXO3A/LINC00926/PGK1通路的體內(nèi)表型，我們首先通過將MDA-MB-231細(xì)胞注射到BALB/c小鼠的乳腺脂肪墊上，研究了LINC00926/PGK1軸對(duì)乳腺*生長的影響。與預(yù)期的一樣，下調(diào)LINC00926***增加了乳腺**的生長。相反，當(dāng)PGK1被敲除時(shí)，**生長被抑制。更重要的是，當(dāng)PGK1被敲除時(shí)，LINC00926敲除對(duì)**生長的影響***減弱(圖7A-7C)。接下來，我們研究了FOXO3A/LINC00926軸對(duì)乳腺*生長的影響。結(jié)果顯示FOXO3A過表達(dá)***降低了乳...

2017年俞立團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，整合素與ECM蛋白的配對(duì)結(jié)合決定了遷移體的形成[2]，該研究成果也發(fā)表在CellResearch期刊。2108年俞立團(tuán)隊(duì)明確闡述了收集和檢測遷移體的實(shí)驗(yàn)方法[3]。2019年，俞立團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)Tspan4和膽固醇在遷移體形成時(shí)組織成為微米級(jí)大型微結(jié)構(gòu)域，這一結(jié)構(gòu)即遷移體的基本結(jié)構(gòu)，還證實(shí)遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結(jié)構(gòu)的剛度增加而產(chǎn)生的一種生物物理過程[4]，該研究成果發(fā)表于NatureCellBiology期刊中（IF=）。并同年在同期刊中發(fā)表，遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生，Tspan4a和Tspan7（遷移體生...

2021年6月，***一篇發(fā)表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiota long-term dynamics and prediction of acute graft-versus-host disease in pediatric allogeneic stem cell transplantation.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細(xì)菌可能預(yù)測急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測HSCT患者不同身體部位的微生物群，特別是通過移植前樣本的參與，...

為了確定METTL3促進(jìn)**細(xì)胞增殖的機(jī)制，檢測了METTL3在ESCC細(xì)胞上轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中的作用。METTL3缺失降低了KYSE180細(xì)胞中m6A的總豐度。甲基化RNA免疫沉淀（MeRIP）和m6A特異性抗體，然后進(jìn)行RNA測序（MeRIP-seq），發(fā)現(xiàn)KYSE180的mRNA中鑒定的m6A位點(diǎn)與RRACH序列一致。m6A信號(hào)在mRNAs的終止密碼子和3′-非翻譯區(qū)富集。在MeRIP-seq中METTL3缺失減少了1101個(gè)基因的mRNAs中1199個(gè)m6A峰。轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)METTL3缺失調(diào)節(jié)2973個(gè)基因的表達(dá)。二者取交集發(fā)現(xiàn)共有93個(gè)基因重疊。MeRIP-seq中細(xì)胞成分（CC）項(xiàng)的基因...

6、CDK4/6抑制誘導(dǎo)T細(xì)胞表型與免疫檢查點(diǎn)***的良好反應(yīng)相關(guān) 在臨床小鼠模型中，CDK4/6抑制劑與ICB顯示出***的協(xié)同作用。鑒于**近的研究強(qiáng)調(diào)**微環(huán)境中的干細(xì)胞樣T細(xì)胞是ICB反應(yīng)的關(guān)鍵介質(zhì)，作者假設(shè)CDK4/6i介導(dǎo)的T細(xì)胞記憶誘導(dǎo)產(chǎn)生了更有利的T細(xì)胞池用于免疫檢查點(diǎn)靶向***，因此將有助于該聯(lián)合***的療效。事實(shí)上，這種CDK4/6i應(yīng)答特征富集在ICB應(yīng)答患者的CD8+TIL中，在單細(xì)胞和患者水平準(zhǔn)確分為應(yīng)答者和非應(yīng)答者（Fig.6A-D）。這表明CDK4/6i誘導(dǎo)了T細(xì)胞內(nèi)基因特征，該特征與患者對(duì)ICB的良好反應(yīng)相關(guān)。 可以上傳原始的fast文件。凋亡 課題實(shí)...

UCP1激動(dòng)劑CL316243也得到了類似的結(jié)果。這些結(jié)果表明，UCP1參與了AKI中脂質(zhì)積累的調(diào)節(jié)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證這一調(diào)控關(guān)系，提高證據(jù)的可靠性，我們采用腎多點(diǎn)注射UCP1特異性過表達(dá)腺病毒的方法建立AKI過表達(dá)UCP1的動(dòng)物模型(圖3C-D)。油紅O染色顯示，過表達(dá)UCP1可***緩解AKI動(dòng)物模型中的脂質(zhì)積累(圖3E)。***，使用UCP1激動(dòng)劑CL316243在AKI動(dòng)物模型中誘導(dǎo)UCP1過表達(dá)，也觀察到了相同的結(jié)果(圖3F-H)。因此，所有證據(jù)表明，隨著UCP1表達(dá)的增加，AKI模型中的脂質(zhì)含量降低。提供整體課題外包實(shí)驗(yàn)構(gòu)思。NF-kB課題協(xié)同創(chuàng)作接下來，我們合成了野生型HuR蛋白(...

接下來，在低氧條件下，在HCCLM3和Hep3B細(xì)胞中敲低CFL1的表達(dá)（圖5A）。結(jié)果表明，CFL1敲除***逆轉(zhuǎn)了缺氧誘導(dǎo)的HCCLM3細(xì)胞增殖、細(xì)胞遷移和侵襲以及EMT（圖5A-D）。綜上所述，這些結(jié)果表明CFL1表達(dá)受HIF-1α的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，介導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)的HCC進(jìn)展。 6、CFL1通過抑制泛素介導(dǎo)的PLD1降解來維持PLD1的表達(dá)為了進(jìn)一步探索CFL1在HCC中致*作用的下游機(jī)制，利用KEGG數(shù)據(jù)庫篩選了受CFL1影響的通路。其中CFL1的高表達(dá)與細(xì)胞膜中細(xì)胞粘附分子和蛋白的定位密切相關(guān)（圖6A）。然后，基于蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫預(yù)測了CFL1和PLD1之間的潛在相互作用（圖6...

DNA生物標(biāo)志物 DNA生物標(biāo)記物是MarkerDB中比較大的一類標(biāo)記物。MarkerDB中的DNA生物標(biāo)記進(jìn)一步分為26021個(gè)與209種疾病相關(guān)的DNA突變標(biāo)記、353個(gè)與70種疾病相關(guān)的SNP標(biāo)記和23個(gè)與16種傳染病相關(guān)的微生物/病毒基因。DNA突變數(shù)據(jù)（和臨床批準(zhǔn)的突變?cè)囼?yàn)）來自GeneticTestingRegistry，序列數(shù)據(jù)從GenBank中提取，DNASNP生物標(biāo)記物的主要來源是數(shù)據(jù)庫GWAS-ROCS，疾病信息從OMIM或GeneticsHomeReference中提取，關(guān)于微生物/病毒生物標(biāo)記基因的剩余數(shù)據(jù)通過原始文獻(xiàn)或?qū)＠麢z索獲得。目前，MarkerDB中的...

三、通過RNA-seq、RIP-seq和MeRIP-seq鑒定ythdf1調(diào)控的轉(zhuǎn)錄本 對(duì)YTHDF1基因敲除MGC-803細(xì)胞和對(duì)照細(xì)胞進(jìn)行RNA-seq。RNA圖譜顯示YTHDF1抑制導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄異常(圖3A)。基因本體論(GO)分析表明，下調(diào)的基因在血管生成、細(xì)胞遷移、粘附和細(xì)胞生長等方面富集;而定位于負(fù)調(diào)控**進(jìn)展的基因表達(dá)上調(diào)(圖3B)。RIP-seq獲得了9082個(gè)結(jié)合YTHDF1的候選基因。我們分析了功能富集變化*****的**000個(gè)基因，表明它們高度參與了**相關(guān)途徑(圖3C)。但累積分布分析表明，YTHDF1結(jié)合基因與YTHDF1未結(jié)合基因在轉(zhuǎn)錄水平上沒有***差異(圖3D...

二、INPP4B增強(qiáng)pik3a突變ER+乳腺*和乳腺上皮細(xì)胞增殖 GFP-INPP4B在MCF-7和T47D ER+乳腺*細(xì)胞中表達(dá)，這兩種細(xì)胞分別有PIK3CAE545K和PIK3CAH1047R高活化突變.*細(xì)胞進(jìn)行非錨定細(xì)胞生長的能力是細(xì)胞轉(zhuǎn)化的一個(gè)標(biāo)志。GFP-INPP4B***增加了軟瓊脂中MCF-7細(xì)胞集落大小(2.1倍)和T47D細(xì)胞集落大小(1.8倍)，但對(duì)集落數(shù)量沒有影響(圖2a-c)。與細(xì)胞增殖增加相一致。與載體對(duì)照相比，GFP-INPP4B在血清剝奪后增強(qiáng)了MCF-7細(xì)胞的增殖(1.7倍)(圖2d, e)，但不影響在含血清培養(yǎng)基中生長的MCF-7細(xì)胞的增殖。過表...

蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物 MarkerDB中142個(gè)蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物覆蓋了160多種疾病。MarkerDB中的所有蛋白質(zhì)生物標(biāo)記物數(shù)據(jù)都是從OncoMX、CBD和UPBD原始文獻(xiàn)中提取的，結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫PDB收集。目前，MarkerDB中的所有蛋白質(zhì)標(biāo)記都有一個(gè)或多個(gè)疾病關(guān)聯(lián)，以及MarkerDB ID、序列、結(jié)構(gòu)、詳細(xì)的蛋白質(zhì)描述、蛋白質(zhì)名稱/同義詞、蛋白質(zhì)理化數(shù)據(jù)、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍，生物流體、一個(gè)或多個(gè)文獻(xiàn)參考和其他在線數(shù)據(jù)庫的外部超鏈接。 IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。非酒精性脂肪性肝炎 二、腸道微生物群落動(dòng)態(tài)變化 確定每個(gè)個(gè)體部位...

為了使細(xì)胞在G1/S檢查點(diǎn)同步，我們對(duì)它們施加雙胸腺嘧啶脈沖。這種處理有效地抑制了PTEN-WT和PTEN-398A細(xì)胞在G1/S邊界(圖4B)。然后在正常生長培養(yǎng)基中釋放細(xì)胞，在S期進(jìn)展期間用IR處理，6小時(shí)后收集細(xì)胞，用流式細(xì)胞術(shù)分析細(xì)胞周期分布(實(shí)驗(yàn)方案見補(bǔ)充圖7A)。大部分PTEN-WT細(xì)胞被阻滯在s期，而PTEN-398A細(xì)胞未能阻滯細(xì)胞周期，而是發(fā)展到G2/M期(圖4C)。通過測定表達(dá)磷酸化組蛋白H3(Ser10)的細(xì)胞比例，證實(shí)了這一觀察結(jié)果。磷酸化組蛋白H3(Ser10)標(biāo)志著細(xì)胞處于有絲分裂階段。(圖4d)。完善的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)提供可視化的建模服務(wù)。microRNA課題產(chǎn)學(xué)研合作越...

核磷蛋白(Nucleophosmin，NPM1)是急性髓系白血病(AML)中**常見的突變基因，會(huì)導(dǎo)致編碼的核仁蛋白(NPM1c+)發(fā)生異常胞漿易位。NPM1c +維持一個(gè)獨(dú)特的白血病基因表達(dá)程序，以***HOXA/B簇和MEIS1*基因?yàn)樘卣鳎龠M(jìn)白血病發(fā)生。然而，NPM1c+控制這種基因表達(dá)模式促進(jìn)白血病發(fā)生的機(jī)制仍在很大程度上未知。本文揭示了HOXBLINC lncRNA***在NPM1c +白血病中扮演促*作用。HOXBLINC和其合作者M(jìn)LL1是NPM1c+ AML的潛在***靶點(diǎn)。本文于2021年3月發(fā)表在《Nature Communications》IF:14.919。zVAD預(yù)...

通過circRNA芯片分析了三對(duì)NSCLC樣品中circRNA的表達(dá)譜，總共鑒定出109個(gè)circRNA失調(diào)，33個(gè)上調(diào)，76個(gè)下調(diào)。qRT-PCR驗(yàn)證52個(gè)配對(duì)NSCLC樣品中**差異circRNA的表達(dá)。circNDUFB2是**顯著下調(diào)的circRNA。臨床分析發(fā)現(xiàn)circNDUFB2高表達(dá)與NSCLC患者的**大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和分期呈負(fù)相關(guān)。結(jié)果表明，circNDUFB2在NSCLC中經(jīng)常被下調(diào)，并且與NSCLC的惡性特征呈負(fù)相關(guān)。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產(chǎn)生，長度為249nt。circNDUFB2可由發(fā)散引物擴(kuò)增，收斂引物不能擴(kuò)增。核酸酶消化證實(shí)circN...

circRNA是一種新型的非編碼RNA，已被報(bào)道通過多種機(jī)制參與疾病的發(fā)生和發(fā)展。MAPK通路是一種常見的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路，參與細(xì)胞增殖、炎癥和凋亡，在**中起著特別重要的作用。然而，與MAPK通路相關(guān)的circRNA在胃*中的作用尚未被探索。因此，小編為大家?guī)硪黄?021年4月發(fā)表于影響因子為15.302的雜志Molecular Cancer上的文章“A novel protein encoded by circMAPK1 inhibits progression of gastric cancer by suppressing activation of MAPK signaling”。在...

進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，膜損傷后形成了兩個(gè)不同的囊泡池。較大的囊泡較早從質(zhì)膜形成， Rab5、EEA1（早期內(nèi)吞作用）、肌動(dòng)蛋白、Rab35 呈陽性， LC3 偶爾呈陽性。相比之下，后來形成的囊泡較小且 LC3 呈陽性，**終出現(xiàn)在靠近 Rab5 陽性囊泡的位置。 二、內(nèi)化囊泡通過滲透作用在細(xì)胞質(zhì)中收縮，與溶酶體融合 GFP-Rab35、RFP-Rab5轉(zhuǎn)染MCF7，研究胞吞小體的“行動(dòng)軌跡”。胞吞小體囊泡移動(dòng)至細(xì)胞質(zhì)，在細(xì)胞質(zhì)中收縮成小囊泡，***與溶酶體融合。 三、巨胞飲由質(zhì)膜完整性觸發(fā) 實(shí)驗(yàn)表明巨胞飲作用在損傷后被***，需要重組，從而保持質(zhì)膜的完整性。此外，LC3囊...

circACTN4增加遷移和侵襲并調(diào)節(jié)BC細(xì)胞的細(xì)胞周期進(jìn)程 為了進(jìn)一步評(píng)估circACTN4在BC進(jìn)展中的作用，在circACTN4過表達(dá)或敲低后研究了BC細(xì)胞的遷移、侵襲和細(xì)胞周期。劃痕和transwell試驗(yàn)表明，BC細(xì)胞的侵襲和遷移能力因circACTN4的上調(diào)而顯著增加，但被circACTN4的下調(diào)顯著抑制。WB結(jié)果發(fā)現(xiàn)過表達(dá)或敲低BC細(xì)胞中MMP9和MMP2蛋白水平明顯升高或降低，nm23-H1表達(dá)明顯降低或升高。式細(xì)胞術(shù)測定細(xì)胞周期分析，結(jié)果顯示與對(duì)照組相比，circACTN4的敲低導(dǎo)致S期BC細(xì)胞比例較低，G1期BC細(xì)胞比例較高，這表明circACTN4沉默導(dǎo)致G1期...

非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是一種結(jié)果嚴(yán)重的炎癥性疾病。肝細(xì)胞死亡，包括凋亡、壞死和焦亡，在NASH的病理生理學(xué)中已被證實(shí)。到目前為止，Caspase-11在NASH中的確切作用仍不清楚。本文詳細(xì)介紹了2021年4月發(fā)表于“Cell Mol Gastroenterol Hepatol”（IF=7.706）的文章“Caspase-11–Mediated Hepatocytic Pyroptosis Promotes the Progression of Nonalcoholic Steatohepatitis”。本研究探討了Caspase-11在NASH中的潛在作用。NASH小鼠肝臟中Cas...

作者進(jìn)行了PAR-CLIP實(shí)驗(yàn)，以評(píng)估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結(jié)果表明，在H1299細(xì)胞中，通過過表達(dá)METTL3來提高m6A的甲基化水平，促進(jìn)YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結(jié)合(圖6D)。無論METTL3是否過表達(dá)，YTH結(jié)構(gòu)域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進(jìn)行RNA-pull down實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)YTHDC2WT，優(yōu)先結(jié)合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR，而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外，YTHDC2傾向于結(jié)合m6A共識(shí)...

2.Tempol能中度改善DHEA誘導(dǎo)的PCOS大鼠的糖耐量 由于多囊卵巢綜合征與代謝紊亂密切相關(guān)，評(píng)估了不同組的胰島素敏感性和葡萄糖穩(wěn)態(tài)。DHEA+PBS組大鼠的空腹血糖水平雖然沒有明顯差異，但其空腹血清胰島素水平和HOMA-IR值均高于油+PBS組。Tempol***降低了空腹胰島素水平，而對(duì)PCOS大鼠的空腹血糖水平和HOMA-IR值無***影響(圖2A-C)。OGTTs顯示PCOS大鼠葡萄糖***延遲和曲線下面積增加，這表明DHEA處理降低了葡萄糖排泄能力。經(jīng)tempol***后，糖耐量受損情況得到改善(圖2D)。ITTs證明，三組大鼠對(duì)胰島素的反應(yīng)相同(圖2E)。 Pex調(diào)...

我們發(fā)現(xiàn)，在circMAPK1穩(wěn)定下調(diào)的SGC7901和MGC803細(xì)胞中，與對(duì)照組相比，MAPK1-109aa與MEK1的結(jié)合明顯減少，而MAPK1與MEK1的結(jié)合增加(圖7f)。在MKN45和BGC823細(xì)胞中，IRES突變時(shí)MAPK1-109aa不翻譯。因此，MAPK1與MEK1的結(jié)合沒有明顯變化。然而，過表達(dá)circMAPK1后，MAPK1與MEK1的結(jié)合***減少，而MAPK1-109aa與MEK1的結(jié)合***增加(圖7g)。因此，以上結(jié)果表明MAPK1-109aa與MAPK1競爭結(jié)合MEK1。隨后的Western blot結(jié)果也證實(shí)，在過表達(dá)circMAPK1的細(xì)胞系中，MAPK1...

為了進(jìn)一步探索Pex調(diào)控HSC行為的機(jī)制，我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測序基因表達(dá)譜(圖3A)。在差異表達(dá)基因中，我們觀察到41個(gè)重疊的上調(diào)基因在Pan02 exo組與Npex組和KPC exo組與Npex組之間存在部分交集(圖3B)。主要涉及的基因參與細(xì)胞外空間、細(xì)胞外區(qū)域和ECM(圖3C)，表明Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。此外，GO和KEGG通路分析顯示，IGF-1及其下游PI3K/AKT是受Pex影響的排名比較高的信號(hào)通路(圖3D，E)。western blot分析支持了Pex***增加HSC中IGF- 1R、IRS-1和AKT磷酸化的發(fā)現(xiàn)(圖3F)。當(dāng)使用IGF-1...

五、npm1突變的AML亞型可預(yù)測總生存率 評(píng)估了原始亞型和committed亞型是否與患者總生存期相關(guān)(圖5A;補(bǔ)充圖22)。與committed亞型相比，原始亞型與明顯更差的生存率相關(guān)(Log-rank檢驗(yàn)p = 0.002)。為了確定我們的聚類是否超出了已建立的預(yù)測因素，我們還擬合了一個(gè)多變量Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型，調(diào)整了臨床病理參數(shù)，如性別、白細(xì)胞計(jì)數(shù)、年齡、核型和突變，包括FLT3- itd、FLT3- TKD、DNMT3A、NRAS和KRAS。多變量分析顯示，原始亞型和committed亞型具有***的互補(bǔ)預(yù)后價(jià)值(p-值= 0.01，圖5B)。 阻斷atm依賴的磷酸化會(huì)損害...

USP35敲除增加了脂質(zhì)活性氧的產(chǎn)生和丙二醛的產(chǎn)生(圖2D)。過量的活性氧導(dǎo)致多不飽和脂肪酸氧化損傷并分裂成各種產(chǎn)物，包括HETEs。我們觀察到，USP35沉默促進(jìn)了H460和H1299細(xì)胞中5-HETE、11-HETE和15-HETE的釋放，而不影響12-HETE的釋放(圖2F)。GSH/GPX4為基礎(chǔ)的ROS***機(jī)制在防止鐵缺乏期間的脂質(zhì)過氧化中起著不可或缺的作用。研究表明在USP35缺乏的細(xì)胞中GSH水平降低并伴隨著對(duì)GPX4活性的抑制(圖2G，H)。此外，shUSP35***細(xì)胞中的鐵和Fe2+水平***高于對(duì)照組。相比之下，補(bǔ)充GSH或鐵螯合劑***減少了shUSP35***細(xì)胞的...