7）NOX4通過氧化應激誘導的人體星形膠質細胞的脂質過氧化促進鐵死亡 為了探討NOX4調控AD星形膠質細胞氧化應激誘導的細胞死亡的分子機制，我們檢測NOX4的升高是否能通過氧化應激誘導的人星形膠質細胞脂質過氧化促進鐵死亡。我們用免疫熒光染色法測定了4-HNE在人星形膠質細胞中的蛋白水平。免疫熒光染色顯示，與對照組相比，NOX4的升高增加了4-HNE蛋白的水平，增加了質膜中脂質過氧化源性液滴的含量，細胞的形狀出現收縮(圖7A)。NOX4過表達使4-HNE陽性細胞數量***增加(圖7B)。NOX4過表達增加了4-HNE水平和MDA水平(圖7C)。值得注意的是，與對照組相比，NOX4的升高...

通過circMYH9驗證了某些蛋白質是否參與調節p53前mRNA的穩定性。ChIP結合MS用于鑒定circMYH9的結合蛋白，在此過程中鑒定了42種蛋白質，包括 hnRNPA2B1。為了驗證MS結果，進行了RIP測定并觀察到circMYH9在由hnRNPA2B1抗體沉淀的復合物中的富集。hnRNPA2B1和circMYH9之間的相互作用被非生物素化的 circMYH9 以劑量依賴性方式競爭性抑制。免疫熒光共定位分析顯示 circMYH9 和 hnRNPB2A1 共定位在 CRC 細胞的細胞核中、皮爾遜相關分析（Rx）和相關系數分析（R）顯示顯示高度相關。英拜有一支高精尖的團隊。武漢斷鏈脂肪酸科...

miR-101-3p的表達在**細胞系和**組織中下降 作者檢測了6株肺*細胞系A549，L78，NCI–H460，GLC-82，SPC-A1，PC9和一株人上皮細胞系BEAS-2B中miR-101-3p的表達，結果顯示與BEAS-2B相比，miR-101-3p的表達在肺*細胞系中***低表達。隨后檢測了32個肺*組織（LC）樣本和同源相鄰正常組織（ANT）樣本中的表達，結果顯示與ANT相比，在LC中***低表達。隨后將32例LC樣本根據**大小分為兩組，結果發現miR-101-3p在**體積大的樣本中的表達要***低于**體積小的。這些結果表明miR-101-3p的表達在**細胞系...

在TYRO3-OE 4T1**細胞中，阻斷鐵死亡的基因上調（Slc40a1、Slc7a11、Slc3a2、Gpx4、Fth1和Blvrb），而增強鐵死亡的基因下調（Slc5a1、Tfrc）。在接受抗PD-1***的黑色素瘤患者中，阻止脂質過氧化和鐵死亡的分子SLC3A2與TYRO3***共表達。抗PD-1***后，Tyro3-OE CD45-**細胞的脂質ROS水平低于4T1-P CD45-**細胞，而加入抗PD-1***增加4T1-P**細胞的脂質ROS，但不增加Tyro3-OE**細胞的脂質ROS，表明Tyro3抑制抗PD-1誘導的**細胞鐵死亡。在體外用鐵死亡誘導劑erastin和鐵死亡...

**近有報道稱，ALS/FTD中TDP-43的聚集可以隔離核孔蛋白、轉運蛋白和其他因子，表明TDP-43的聚集強烈破壞核質轉運(NCT)和核孔復合體。此外，在AD、ALS和亨廷頓氏病(HD)中NCT也被破壞，提示在這些神經退行性疾病中有一個共同的功能失調途徑。然而，TDP-43在反復顱腦損傷致神經退行性變中的病理機制尚不清楚。此報道之前曾證明，重復的創傷導致果蠅大腦中的泛素、p62和TDP-43包涵體以及應激顆粒病理。在這里，我們對果蠅的大腦進行了蛋白質組學分析，以確定創傷損傷后改變的分子通路。英拜提供春節回家探親車費補貼。湖北造血微環境損傷模型科研 9）M1-Exos通過miR-155/S...

3）LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解 由于PGK1是一種關鍵的糖酵解酶，而LINC00926被鑒定為負調控PGK1的lncRNA，我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導的乳腺*細胞增殖抑制中發揮作用。我們測試了LINC00926對葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調節作用。結果表明，LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉染的細胞中，PGK1的表達逆轉了這些作用。LINC00926還顯示出細胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉染的細胞中重新表達挽救了這些效果。在PGK...

1）NOX4水平在阿爾茨海默病患者皮質區受損星形膠質細胞中升高 為了探討NOX4在AD患者星形膠質細胞損傷中的作用，我們分析了AD患者大腦皮質星形膠質細胞中NOX4蛋白水平是否升高。我們采用免疫熒光染色法檢測AD患者或非AD供者(正常)顳葉皮質組織GFAP陽性星形膠質細胞中的NOX4蛋白水平(圖1A和B)。免疫熒光染色顯示AD患者皮質區分子層GFAP陽性星形膠質細胞中NOX4陽性染色強度相對于非AD供者增加(圖1A)。此外，AD患者皮質區ML中受損的GFAP陽性星形膠質細胞中的NOX4陽性染色強度高于非AD供者(圖1A和B)。值得注意的是，AD患者中NOX4與GFAP亞細胞共定位陽性...

創傷性腦損傷(TBI)是世界范圍內**常見的死亡和殘疾原因之一。事實上，創傷性腦損傷導致的繼發性損傷可導致長期的神經和神經精神后遺癥，包括神經退行性疾病，如肌萎縮性脊髓側索硬化癥(ALS)、阿爾茨海默病(AD)和帕金森病。TBI還與慢性創傷性腦病(CTE)的發展有關，CTE是一種與反復頭部創傷相關的進行性神經退行性綜合征。反復創傷患者(如CTE)的死后腦組織以及創傷性腦損傷動物模型顯示微管相關蛋白(TAU)和TAR DNA/RNA結合蛋白(TDP-43)病理變化。TDP-43病理是神經退行性變的標志，在~ 97%的ALS病例、~ 45%的額顳葉癡呆(FTD)病例和~ 60%的AD病例中均有TD...

前，PROTAC-DB包括1662個PROTAC，202個彈頭（靶向目標蛋白質的小分子），65個E3配體（能夠募集E3連接酶的小分子）和806個接頭，以及它們的化學結構，生物學活性和理化性質。除了彈頭和E3配體的生物活性外，PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力，結合親和力和細胞活性。 數據庫的查詢和瀏覽為了方便對PROTAC-DB中的數據進行檢索，作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上，PROTAC-DB可以進行基于文本的檢索和基于結構的檢索。基于文本的搜索是在整個PROTAC-DB中進行搜索的一種簡單方式，只需輸入單個術語，如目標名稱、化合物名稱或ID。對于基于結構的搜索...

褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡 為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用，將HT-22細胞系用siRNA轉染，然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質水平。鑒于脂質過氧化是鐵死亡的標志，使用DCF和BODIRY 581/591 C11作為評估了溶質ROS。與對照組+刮擦損傷組相比，siFth +刮擦損傷組細胞的熒光強度顯著增加，表明siFth增強了HT-22細胞中機械刮擦損傷引起的ROS產生的上調。重要的是，與未經***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉染的HT-22細胞未能顯著減少刮擦...

5、GPX4活性預防鐵死亡促進轉移作者推測細胞對鐵死亡的抗性可能使細胞能夠抗住在轉移過程中面臨的代謝和環境壓力。注射Py230-27HCS細胞的小鼠發生micrometastasis，而注射Py230-27HCR細胞的小鼠發生macrometastasis；但是無論是從micrometastasis還是從macrometastasis處分離出的轉移病灶表現出相似的對鐵死亡誘導劑（RSL3和ML210）相同的抗性。因此，27HCR細胞轉移表型的增加可能是促進27HC抗性的適應性事件的結果，而不是與羥甾醇***相關的基因表達/生化活性的特定變化。此外，GPX4的敲除***降低了B16F10細胞27...

四、原始和committed亞型的免疫表型 我們采用質譜耦合流式細胞儀(CyTOF)分析，在單細胞水平上探討9例原始AML npm1突變和8例committed npm1突變的患者的免疫表型差異。我們使用細胞術(diffcyt)27管道來計算定義具有相似高維表型的細胞群(免疫表型簇)。每個免疫表型聚類映射到二維t-隨機近鄰嵌入(t-SNE)圖上的離散區域(圖4A;補充圖20、21)，證實它們表達不同的免疫表型。分析顯示，七種不同水平的CD45和造血祖細胞標記物(CD34, CD38)或骨髓單核細胞分化標記物(CD33, CD14, CD11c, CD16, HLA-DR)的惡性免疫表...

LCAT3與FUBP1發生物理作用，FUBP1在LUAD中也過表達 為了闡明LCAT3在肺*細胞中作用的潛在分子機制，我們進行了RNA下拉試驗來鑒定LCAT3結合蛋白。從凝膠中剪切LCAT3義和反義之間的明顯波段用于質譜分析。FUBP1因其與LCAT3的特異性結合而被選擇進行進一步研究。此外，采用抗FUBP1抗體進行RIP檢測，進一步證明FUBP1與LCAT3之間的相互作用。與FUBP1結合的**序列為LCAT3的208-342nt，形成莖環結構。因此，我們使用LCAT3的208-342nt片段進行RNA拉下分析。結果證實該莖環區(208-342nt)確實負責LCAT3和FUBP1之...

越來越多的證據表明，circRNAs作為功能性RNA在各種**中發揮著關鍵作用。然而，大多數circRNA參與食管鱗狀細胞*(ESCC)的機制仍未明確，其介導的分子機制也大多不清楚。小編給大家分享2021年7月發表于“CELL DEATH & DISEASE”（IF=8.469）的文章“Circular RNA hsa_circ_0000277 sequesters miR-4766-5p to upregulate LAMA1 and promote esophageal carcinoma progression”。在這里，我們篩選了circRNA在ESCC組織中的表達譜，發現與正常對照組...

ROS及其細胞副產物是酪氨酸磷酸酶的有效抑制劑，、用抗霉素A培養T細胞可導致酪氨酸磷酸化的持續和升高(圖6a)，這被魚藤酮或NAC阻斷(圖6a,b)。免疫印跡分析顯示，在aa誘導的ROS下，酪氨酸磷酸化的***數量增加，但幾種不同的蛋白在NAC處理下有差異的磷酸化(圖6b)。TCR-reporter Nur77-GFP小鼠研究表明在TCR信號缺失的情況下，抗霉素A誘導GFP表達;在低于連續刺激條件下誘導的信號時，抗霉素A處理產生的GFP與酪氨酸磷酸酶抑制劑orthovandate (50 μm)培養的T細胞表型相匹配(圖6c)。磷酸酪氨酸級聯促進NFAT1的核積累，單獨的ROS誘導(通過抗霉素...

在缺氧條件下的持續***誘導不同的細胞內程序 已知的缺氧信號靶點BNIP3在缺氧下升高，mTORC1在持續刺激下被***(圖3a)。從這四種條件中獲得的RNA序列被用來比較培養物和之前公布的數據之間的轉錄組。主成分分析顯示，所有四個群體的轉錄組都不同(圖3b)。缺氧條件下的持續刺激并沒有誘導持續刺激和缺氧誘導基因的組合，而是驅動了一個不同的轉錄譜(圖3c）。基因本體論表明，連續刺激條件之間共享的基因簇與負調控和代謝變化相關(簇3和簇5)(圖3b)。與缺氧條件下持續刺激相關的基因(聚類1和7)主要由抗病毒和抗增殖基因驅動。 鑒定的前列腺瘤細胞內源性雄***受體網絡。安徽科研氧化應激增強...

細胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物，目前正在其他**類型的數百項臨床試驗中進行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內在細胞抑制機制，而其作為免疫調節劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉錄組學和蛋白質組學分析，證明了CDK4/6抑制劑在促進免疫T細胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強抗**T細胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。神經保護科...

4）circPDE4B促進了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成，促進了RIC8A的降解 我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是，MS結果顯示circPDE4B也結合了兩個E3連接酶，包括RNF2和MID1。然而，由于RNF2定位于細胞核內，我們選擇MID1進行進一步研究。實際上，通過免疫沉淀分析，MID1被發現與RIC8A結合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實了它們在HCs***定位(圖4B)。IP結果表明，MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過表達的泛素化作用，增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實驗也顯示，與對照...

褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經元損傷 為了進一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經元損傷中的假定作用，在TBI后第3天，在受傷的皮層中觀察到了Fe2 +，Fe3+，總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導的血清和同側皮層中鐵含量的上調的。Perls的藍色染色表明，TBI后第7天鐵陽性細胞的數量顯著增加，褪黑素或Lip-1***組的鐵陽性細胞少于對照組。鑒于TBI誘導的鐵超載伴隨著Fth表達的上調，使用免疫熒光染色觀察了TBI后神經元中Fth的表達。發現與假手術組相比，模型組中Fth陽性神經元的***增加，而褪黑素和Lip-1處理顯著降低了Fth陽性神經元。與假手術組...

一、異種HSCT前后監測腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統。 在1年的時間里，從29名兒童的10個時間點收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次，HSCT當天，HSCT后1個月每周，以及HSCT后12個月的3個隨訪時間點(圖1)。通過16SrRNA基因譜測定這些樣本中的微生物群落動態。共對709份患者樣本(212份糞便樣本、248份口腔拭子和249份鼻拭子來自10個時間點)進行了鑒定。發現移植前患者的微生物群落組成與健康對照不同；三個身體部位性在HSCT后微生物α多樣性下降；在一年中，微生物群落動態呈現出三個階段：第一階段(在檢查前和適應開始時的樣本)，第二階段(HS...

5）MAPK1-109aa對胃*有抑制作用 為了進一步研究MAPK1-109aa的生物學功能，我們將circMAPK1ATG突變質粒、circMAPK1IRES突變質粒和circMAPK1過表達質粒轉染到MKN45和BGC823細胞中。如預期的那樣，當轉染ATG突變質粒和IRES突變質粒時，沒有出現circMAPK1編碼的MAPK1-109aa13-kDa帶(圖5a)。CCK8實驗(圖5b)、集落形成實驗(圖5c，d)和EdU實驗(圖5e，f)顯示過表達circMAPK1明顯抑制了細胞的增殖能力。流式細胞術顯示，處于S期的GC細胞數量也明顯減少(圖5g)。然而，當circMAPK1的...

雄***和雄***受體(AR)是******轉錄因子(TF)，是驅動前列腺*(PCa)發***展的關鍵因素。因此AR是晚期PCa******的主要分子靶點。雄***剝奪療法，特別是第二代抗雄***和雄***合成抑制劑**初是有效的。然而，由于患者仍然可以從晚期PCa進展到致命性去勢抗性前列腺*(CRPC)，需要新的***靶點和生物標志物。靶蛋白的一個來源可能是ar相關的染色質蛋白。大多數目前已知的核受體(NR)相互作用蛋白，包括那些AR，已經通過遺傳篩選，如雙雜交系統，免疫共沉淀和基于肽段的體外方法。盡管親和純化-質譜耦合(MS)已經啟發了NRs的輔助調節器，但它很少在**NRs自然環境的條件...

外泌體可調節多種生理或病理反應,包括**細胞侵襲與轉移、血管生長免疫應答等。外泌體中的SmallRNA分子比較穩定,含量相對豐富，是目前外泌體研究的重點。外泌體的miRNA與多種疾病的**、心血管疾病、免疫疾病、神經系統疾病的發生、耐藥密切相關，同時外泌體miRNA也可以作為**診斷及預后標志物。英拜生物可以為您提供包含外泌體分離,鑒定、RNA提取等技術服務。用于分離外泌體樣本類型及所需量:■血清樣本:3-5mL(全血8-10mL)■血漿樣本:3-5mL(全血8-10mL)■無血清培養細胞.上清:50-100mL■體液:15-20mL總體生存率低與m6A水平增高***相關。人神經束膜細胞科研省...

N6-甲基腺苷（m6A）是一種真核mRNA修飾，通過改變mRNA穩定性、剪接、運輸、定位、翻譯、微RNA（miRNA）處理和RNA-蛋白質相互作用來調節基因表達，并改變修飾RNA分子的命運。新的證據表明m6A修飾與**增殖、分化、**發生、侵襲和轉移相關，并在**發展中發揮重要作用。此外，m6A修飾還受許多蛋白質編碼基因調控，非編碼RNA（如miRNAs、lncRNAs）通過相互作用控制切割、定位、運輸、穩定性和降解以及影響**細胞的增殖、浸潤和轉移等生物過程。***我們來講一篇關于泛*m6A相互作用的RNA的文章，文章題名為：Comprehensiveanalysesofm6Aregulat...

六、改進分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs 研究者基于細胞表面標記設計了一種針對HSCs / MPP的新的熒光***細胞分選策略（簡稱CD-REF），使用CD-REF分選板對股骨BM細胞進行分選，結果顯示標記為HSCs / MPP和HSCs / MPPs-Cycle簇的CD-REF細胞約占88％。為了評估CD-REF細胞譜系輸出的分化潛力和穩健性，研究人員在小鼠MS5飼養層或更具生理相關性的人類胎兒間充質干細胞（fMSCs）上對三個胎兒的單個細胞進行了分選，結果顯示MS5和fMSCs上分別存在著四系、三系、雙系、單系和未分化的譜系集落。接下來，又對單個CD-REF和免疫表型HSCs...

piRNA-30473在DLBCL中升高，是DLBCL患者的不良預后因素 作者首先研究小RNA的表達水平與DLBCL患者的臨床相關性。通過分析微陣列數據，與預后不良組(PP)比較，在預后良好(FPP)的病例中發現了4個***下調或上調的piRNAs(圖1A)。在這四個差異表達RNA的基礎上，作者進一步發現與預后良好(FPP)的患者相比，預后不良患者(PP)的piRNA-30473表達水平***升高(圖1B)，且DLBCL患者高水平的piRNA-30473與較差的總生存率相關(圖1C)。綜上所述，piRNA-30473可作為預后的生物標志物，并可用于DLBCL患者的預后分層。 文章檢測...

2）SsD響應相關基因和通路的鑒定 為了進一步確定可能與白血病細胞中SsD敏感性相關的潛在靶點，我們對SsD處理過的NB4細胞進行了RNA測序。我們共發現3732個上調基因和3442個下調基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機制，我們進行了富集分析并研究了差異基因相關的通路。我們篩選了上調和下調基因富集的**個通路(圖2B)。此外，我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號通路(圖2C)。我們的數據顯示，SsD處理導致MYC靶點、E2F靶點和G2M檢查點信號級聯受到抑制。有趣的是，這些發現與FTO抑制劑和內源性FTO的下調抑制的信號通路相一致。因此，SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制...

6）FPN蛋白在肺*細胞中的穩定性需要USP35 USP35屬于DUBs家族，在控制各種蛋白質的Ub依賴性降解中起關鍵作用。此外，FPN泛素化和隨后的內吞作用導致鐵超載和鐵死亡。因此，我們研究了USP35是否通過影響其蛋白質穩定性來調節FPN表達。如圖8A所示，USP35敲除增加，而USP35過表達降低泛素化FPN水平。用MG132蛋白酶體抑制劑***后，shUSP35***細胞的全部或膜裂解物中FPN水平的降低被阻止(圖8B)。隨后，我們檢查了USP35是否是FPN的直接結合伙伴。IP分析的數據揭示了內源性USP35和FPN之間的聯系(圖8C)。總之，這些數據表明USP35可以直接...

五、gata1調控靶基因的染色質可及性及表達動態 檢測了pySCENIC鑒定的**頂層gata1調控靶基因的scRNA-seq和scATAC-seq數據(根據AUCell評分排序)(圖5)。我們觀察了兩個基因啟動子(距轉錄起始位點3kb[TSS])和遠端調控區域(距TSS50kb)的可及性，以及沿MEMP分化軌跡所選靶基因的表達水平(圖5A)。我們觀察到，在造血干細胞/mpp中，gata1調控靶基因的啟動子在任何明顯的基因表達之前通常是開放的(圖5A)。因此，與我們之前的觀察一致，造血干細胞/mpp的染色質可及性發生在*存在于分化程度更高的細胞中的轉錄變化之前。有趣的是，與第1類(hsc/...

抑制piRNA-30473可降低DLBCL的發生 為了進一步探索piRNA-30473在DLBCL中的功能作用，作者使用antiagomir-30473在DLBCL細胞中去除piRNA-30473。結果發現，與對照組相比，在DLBCL細胞中耗盡piRNA-30473導致增殖減少(圖2A)。此外，細胞周期分析顯示，在DLBCL細胞中抑制piRNA-30473可以增加G1期細胞的比例，減少S期和G2期細胞的比例(圖2B,2C)。然而，耗盡piRNA-30473并不誘導細胞凋亡(圖2D)。此外，通過SU-DHL-8異種移植DLBCL模型，以評估piRNA-30473對體內DLBCL進展的影...