在MKN45和BGC823細胞中，IRES突變時MAPK1-109aa不翻譯。因此，MAPK1與MEK1的結合沒有明顯變化。然而，過表達circMAPK1后，MAPK1與MEK1的結合***減少，而MAPK1-109aa與MEK1的結合***增加(圖7g)。因此，以上結果表明MAPK1-109aa與MAPK1競爭結合MEK1。隨后的Western blot結果也證實，在過表達circMAPK1的細胞系中，MAPK1-109aa***升高，磷酸化的MAPK1/2降低，而在circMAPK1敲低的細胞中則相反(圖7h)。此外，MAPK1的下游效應因子，如p-ELK1、p-c-Fos、p-c-JUN...

2021年5月，在Elife 雜志上發表了文章“Traumatic injury compromises nucleocytoplasmic transport and leads to TDP-43 pathology.”。此報道在體內，反復的創傷會上調核孔蛋白，改變核孔蛋白的穩定性，改變NCT蛋白，改變Ran***1和核孔蛋白的分布，改變NCT。此外，核輸出的藥理抑制可以防止tbi介導的致命性和NCT缺陷。有趣的是，在體內和體外，核孔蛋白的上調導致TDP-43定位錯誤、聚集、磷酸化和溶解性改變，并降低運動功能和壽命。對NUP62病理和CTE患者腦組織中NUP62濃度升高的研究結果表明NCT...

意味著先前接受過CAR-T細胞***的小鼠的**控制***增強(Fig.5H-I)。值得注意的是，第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+T細胞的數量呈***負相關(Fig.5J)，表明CDK4/6i處理的CAR-T細胞的持久性增強是驅動**控制的關鍵因素。事實上，**接種后40天，接受預處理的CAR-T細胞的小鼠浸潤CD4+和CD8+CAR-T細胞的數量***增加(Fig.5K)。接下來通過將未處理或預處理的抗LeYCAR-T細胞轉移到OVCAR-3荷瘤小鼠體內，檢測了CDK4/6i預處理對CAR-T細胞急性療效的影響。用CDK4/6i預處理CAR-T細胞可***增強其抗**活性（Fig...

將A375-A2-ESO人黑色素瘤細胞、ESO-T細胞和IL-4/IL-13極化的MDMs以2:2:1的比例混合，放置在模擬TME的3D**類***培養物中（圖6k）。IL-4/IL-13極化MDMs有效抑制ESO - T細胞介導的A375-A2-ESO**細胞的殺傷；在MDM極化過程中，苯乙肼的***在很大程度上緩解了這種免疫抑制作用（圖6l）。因此，與苯乙肼處理的MDMs共培養的ESO-T細胞相比，與非苯肼處理的MDMs共培養的ESO-T細胞顯示了T細胞活化的增強（圖6m）。總的來說，這些數據表明MAOI誘導的人類TAM重編程具有改善抗**T細胞反應的潛力。此外，人和小鼠的TAM都高表達M...

另外，相對于對照組，在生理條件下，單獨使用siFth不能顯著增加ROS的產生。對鐵死亡的抗性與抑制BODIRY-C11氧化有關。與上述ROS結果一致。測量了鐵死亡的幾種推定生物標志物，包括xCT，Cox2和4HNE表達。如預期的那樣，與對照組+刮擦損傷組相比，在siFth轉染的HT-22細胞中，刮擦損傷的xCT表達顯著下降，而Cox-2和4HNE的表達顯著增加。重要的是，與未經***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉染的HT-22細胞在刮傷后未能顯著改變xCT，Cox2和4HNE的表達。另外，在生理條件下，單獨的siFth與對照組之間上述蛋白質的表達沒有顯著差異。這些結果表明，用si...

OARSI分級(圖6E)進一步提示小鼠SHAM+載體和DMM+circPde4b組軟骨降解較少，而DMM+載體和DMM+circPde4b+RIC8A組軟骨降解情況相反。熱板試驗、膝關節伸展試驗和電擊刺激跑步機試驗顯示，DMM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組的不適和膝關節疼痛多于SHAM+載體組和DMM+circPde4b組(圖6F)。小鼠膝關節的三維微CT重建顯示，DMM+NC組和DMM+circPde4b+RIC8A組比SHAM+載體和DMM+circPde4b組有更多的骨贅(圖6G)。此外，四組中RIC8A和p-p38標記的免疫組化染色顯示過表達circPde4b下...

食道*是世界上第六大**常見的**，據報道患者5年生存率只有12-20%。N6-甲基腺苷(m6A)修飾是真核生物mRNA中**豐富的RNA修飾，主要由m6A調節劑介導。m6A修飾調節RNA穩定性和翻譯效率、染色質狀態、替代聚腺苷酸化和前體mRNA剪接。***我們來講一篇刊登在NatureCommunications（IF=14.91）上的一篇文章，題名為METTL3promotestumourdevelopmentbydecreasingAPCexpressionmediatedbyAPCmRNAN6-methyladenosine-dependentYTHDFbinding。 上調...

上海英拜主營業務是為醫學研究人員提供管家式的實驗技術外包服務，提供課題設計和實施的整體解決方案，致力于提高醫學研究的效率和成功率。公司擁有細胞生物學研究平臺、分子生物學研究平臺、病理學研究平臺、免疫學研究平臺、動物模型研究平臺、蛋白質與多肽研究平臺、測序和芯片研究平臺。至今，我們已經成功開展了數千個科研服務項目，與協和、海軍總醫院、首醫、北醫、湘雅、瑞金、仁濟、長海等三甲醫院保持長期合作關系，為數百家三甲醫院、高校、科研院所提供了大量的科研幫助。我們的研發團隊按照基礎醫學科研的研究路徑開發了一個完整的基礎醫學科研體系，從臨床問題出發，挖掘有效的科學問題，設計具備可行性和創新性的課題方案...

5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯體，通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾 為了探索ELNAT1誘導BCa淋巴轉移的分子機制，我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞（Figure5A），由于SUMOylation已經被證明可以調節特異性RNA的識別，并參與RNA分選進入EVs的過程，因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關靶基因。在受ELNAT1調控的925個基因中，作者發現UBC9是SUMOylation相關基因變化*****的（Figure5B-D）。接著通過RNA純化（ChIRP）檢驗ELNAT1與UBC9中P1（153~...

ROS通過作為磷酸酶抑制劑來驅動衰竭 **浸潤PGC1α oe Pmel-1 T細胞在**浸潤時線粒體ROS減少(圖5a)，表明PGC1α部分作用于**浸潤時ROS的減少。 內源性B16 TIL檢查顯示，**終耗盡的T細胞含有大量的mtROS(圖5b)。體外缺氧條件下的持續***也產生了高水平的mtROS(圖5c)，表明ROS可能是T細胞衰竭的驅動因素(圖5d,e)。低、無毒劑量的藥物用于培養T細胞數天，***T細胞(24小時)，然后在抗霉素A存在的情況下擴增，會導致衰竭樣功能障礙:共同抑制分子高表達，多功能性減少(干擾素-g (IFN-γ)和TNF的產生)(圖)。5 f, g)。添...

彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)是**常見的淋巴惡性**亞型，它的開始和進展受到遺傳和表觀遺傳的畸變控制。N6-甲基腺苷(m6A)作為**豐富的真核信息RNA修飾，通過調控靶基因影響多種基礎生物過程；然而，m6A修飾在DLBCL中的作用尚不清楚。此外，piwi相互作用RNA (piRNAs)已被證明是**的表觀遺傳效應。目前，有研究發現piRNA-30473通過調控DLBCL中m6A RNA甲基化而促進**發生和不良預后，該研究于2021年3月發表在《Blood》雜志，IF為17.543。英拜的高通量測序服務質量。重慶線粒體能量代謝芯片科研在沒有RNA配體的情況下，RIG-I采用一種自動抑制...

此外，有報道稱DRD2可在神經系統中與EGFR結合。在BrCa細胞中，293T和MDA-MB231中也證實了DRD2和EGFR的結合(圖6E)。DRD2的表達下調ERBB1 (EGFR)和ERBB2 (HER2)的表達(圖6F)。在異位表達DRD2的BrCa細胞中，DDX5可以促進p-IκBα的磷酸化，增加磷酸化p65的蛋白水平(圖6G)。eEF1A2可直接***上調p-p65的表達，而不影響IKKα/β或IκBα，甚至在沒有LPS的情況下，eEF1A2可上調表達DRD2的MDA-MB231的p-p65蛋白水平(圖6G)。以上結果表明，DDX5和eEF1A2對NF-κB信號通路的促進作用受...

基因表達譜測序為對組織或細胞在特定狀態下產生的mRNA進行高通量測序分析,得到基因差異表達的情況。測序法進行基因表達分析具有定量準確，重復性、特異性、靈敏性高的特點。與全轉錄組測序研究相比,表達譜測序采用單端或雙端讀長的策略,測序通量較小，成本較低;與芯片法相比,測序法具有無需樣本序列信息即可實現任一物種已知和未知轉錄本差異研究的開放性特點,對低豐度轉錄本的檢測具有靈敏性和特異性高的優點。客戶可根據實驗目的,靈活選擇合適的測序深度，以達到對不同豐度轉錄本的檢測要求。-般10M~20Mreads數的測序量即可檢測到此芯片更多的差異基因。如果對低豐度表達基因的關注度高,建議至少測30M以上的rea...

IFNα和抗CD3/CD28磁珠長期刺激后CD8 + T細胞中SRC能力的降低表明生物能量適應性受損。研究發現，IFNα刺激的CD8 + T細胞在初始爆發后，與*用CD3/CD28刺激的CD8 + T細胞相比，其氧化和糖酵解能力下降更快（圖4d）。總之，使用健康對照CD8 + T細胞的體外研究表明，雖然單獨延長IFNα處理能夠觸發可檢測的代謝改變，但只有IFNα暴露和T細胞活化的聯合才能表型復制IFN-High SLE患者CD8 + T細胞中觀察到的線粒體和代謝異常。 5、IFNα暴露誘導慢性***CD8+T細胞死亡 在建立重現SLECD8+T細胞代謝變化的實驗條件后，接下來研...

二、G4穩定性在基因區和非基因功能區之間存在差異 根據穩定性得分將G4基因座分為2組，高于19分的為“穩定G4基因座”（342778個），低于19分的為“不穩定G4基因座”（327298個），繪制穩定性得分分布圖： 三、G4功能受到不同基因區域的限制 HKT檢驗顯示，G4基因座的進化取決于它們位于哪個基因組件內。G4基因座在上游、下游基因區域、5'UTR、3'UTR的優勢比***大于1。位于增強子、復制起點以及在TAD邊界區域的G4基因座優勢比都很高，這一發現表明這三種區域的G4基因座是有功能的。 這項工作表明， G4 的覆蓋率、密度、預測穩定性和選擇壓力取決于它們...

血清和血漿miRNA384HCPCR芯片用于研究血清、血漿和其他體液中可見的和差異表達的372個miRNA的表達。這個芯片為疾病和毒理學研究人員提供了一個快速方便的方法來分析與病理生理條件**相關的miRNA。這些miRNAL來自基于已發表的文獻顯示與血清表達水平和特定疾病相關得miRNA。這些主要調控分子在血清和生物體液中以及它們的表面監管水平的發現,表明miRNA在正常和病理生理過程中的機械作用。他們的非侵襲性樣本獲得的容易使得它們為研究目的提供了現成的素材。這個芯片的分析結果可以作為心臟和肝臟損傷或疾病、***、糖尿病、瀑特異**有用的分子標記。其他常規存在于血清的miRNA作為成功檢測...

與CD44v6敲低實驗的結果相似，敲低Pex中的C1QBP在很大程度上抑制了α-SMA表達(圖6H)。過表達C1QBP并沒有上調α-SMA的表達(圖6I)。同時過表達CD44v6和C1QBP***增加了α-SMA的表達(圖6I)。與我們的體外研究一致，敲除Pex中的CD44v6或C1QBP逆轉了Pex誘導的HSC***、肝臟剛度增加和肝臟ECM重塑的作用(圖6J-L)。脾內注射肝轉移模型(圖6M)顯示，與Pex組相比，注射了CD44v6-kd或C1QBP-kd的Pex組小鼠的肝轉移減少。這些結果表明，Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。大...

支持了轉錄組學分析，流式細胞術表明帶有**記憶(Tcm)表型(CD44+CD62L+)的CD8+ TILs的比例***更高，這在不同的**模型中是一致的(Fig. 1H)。為了檢驗抑制CDK4/6對抗**T細胞免疫的長期功能效應，用CDK4/6i在短時間 (抗**T細胞反應**活躍的3-13天)處理MC38-OVA荷瘤小鼠，然后停藥。在停止***時，CDK4/6i處理小鼠和對照小鼠的**體積是相等的(Fig. 1I-J)。引人注目的是，在停止***后，既往使用CDK4/6i***的小鼠中有21只小鼠**完全***，而對照組只有9只(Fig. 1K)。總之，這些數據表明CDK4/6的藥理抑制促進...

值得注意的是，與對照組相比，NOX4的升高增加了鐵的積累，這是鐵死亡的特異性標志(圖7D)。接下來，我們使用3D分析儀分析NOX4上調后人星形膠質細胞細胞毒性的形態學變化(圖7E)。相對于對照，NOX4的升高誘導了細胞毒性的形態學特征，包括細胞質面積縮小和起泡(圖7E)。此外，與對照組相比，NOX4升高后，形態死亡細胞數量***增加(圖7F)。與形態學分析結果一致，相對于對照，NOX4的升高***增加了細胞毒性水平(圖7G)。這些結果表明，NOX4通過氧化應激誘導的人星形膠質細胞脂質過氧化促進了鐵死亡。 結論：NOX4通過線粒體代謝損傷，氧化應激誘導的脂質過氧化作用促進星形膠質細胞的...

首先這是首頁界面，可以根據自己想了解的疾病、化學品、基因和通路等進行搜索。我們以氣道梗阻為例，首先進入視野的就是進本信息，然后是化學品與基因相互作用，其次是氣道梗阻相關化學品，之后是氣道梗阻相關基因，***還有表型和通路相關數據。 該數據庫還將解剖學及其相關表型與環境化學物質聯系起來，使它們可計算用于薈萃分析，并使 CTD 中化學和表型景觀的解剖學視角成為可能。2020 年， CTD 利用醫學主題詞中“解剖學”分支的修改子集作為其受控詞匯源，其中包括 1799 個用于解剖結構和區域、生理系統、流體和組織、細胞和亞細胞成分的術語。 Th1/Th2細胞失衡也是結腸炎的一個重要特...

一、腦損傷改變了果蠅的大腦蛋白質組，擾亂了NCT蛋白和Nup蛋白水平 為了研究創傷性腦損傷的機制，我們使用了一個具有良好特征的創傷性腦損傷果蠅模型，該模型顯示了強大的表型，如TDP-43同源物(Tbph)、p62、應激顆粒和泛素病理，以識別和研究創傷性腦損傷后大腦蛋白質組的變化(圖1A)。對暴露于重復TBI的三齡果蠅幼蟲大腦中的2000個蛋白質進行了無偏性蛋白質組學分析(w1118)，發現361個蛋白質在創傷損傷后發生了***變化(p 0.05，學生t檢驗)。基于基因本體論(GO)的復雜網絡分析在BiNGO (Cytoscape 3)中對tbi相關腦蛋白質組與非tbi對照進行了關聯分...

6、外泌體miR-138-5p促進乳腺*肺轉移 極化的巨噬細胞在決定**細胞的表型中起著重要的作用。因此，探究M2巨噬細胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺*小鼠異**模型的**轉移。使用氯膦酸鈉***小鼠巨噬細胞，然后轉移使用過表達miR-138-5p的T47D或T47D細胞來源的外泌體處理的Raw264.7細胞。小鼠模型通過尾靜脈注射4T1-熒光素酶細胞構建（圖6A）。結果顯示，外泌體miR-138-5p處理組***促進小鼠體內乳腺*細胞的**體積和肺轉移，同時增加了CD206和Arg-1陽性細胞數（圖6B-E）。這些結果表明外泌體miR-138-5p誘導的M2巨噬細胞...

circExp數據庫收集整理了11個不同平臺上18種**類型的48個circRNA表達譜，鑒定了 189193 個在正常和**樣本之間顯著不同的差異表達特征的circRNA,為人類**提供整合和標準化的 circRNA 表達譜。該數據庫分析結果可以進行批量下載。 用戶可以通過3中途徑進行搜索：circRNA名稱，實驗設計，宿主蛋白。搜索結果包括circRNA來源的表達譜及表達譜全部circRNA的表達信息 用戶可以根據**類型進行查詢，可以獲得circExp數據庫中該**所有表達譜 當用戶瀏覽某一表達譜時，點擊右上角“Check probe annotation”即可獲得...

我們已經進行了snATAC-seq和snRNA-seq來研究染色質可及性如何改善我們對成熟人類腎臟中細胞狀態和功能的理解。我們生成了一個包含轉錄組和表觀基因組數據的交互式多模態圖譜。結合snRNA-seq和snATAC-seq分析提高了檢測近端小管和厚升肢內獨特細胞狀態的能力，并重新定義了可能有助于腎臟再生和細胞特異性離子通透性的細胞異質性。 一、人類成年腎臟的單細胞轉錄和染色質可及性分析 1）成人腎臟中的單細胞轉錄和染色質可及性分析 snRNA-seq基于譜系特異性標記的表達(圖1c，補充圖1b)，鑒定了腎皮質內所有主要細胞類型(圖1b，補充圖1a)。檢測了近端小管(P...

1）USP35敲除抑制肺*細胞生長、集落形成和**進展 我們首先檢測了肺*組織和細胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示，USP35在肺ADC和SCC**中都***上調。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細胞系相比，USP35mRNA水平在肺*細胞系(A549、H358、H460、H1299和H1650)中也高度表達(圖1B)。鑒于H460和H1299細胞中USP35mRNA的豐度較高，我們在下一項研究中使用了這兩種細胞系。與mRNA水平一致，在H460和H1299細胞中USP35蛋白也增加了(圖1C)。為了闡明USP35在肺*發病機制中的作用，我們在H460和H1299細胞中沉默...

L-14c-胱氨酸攝取試驗結果顯示，YTHDC2通過其YTH域抑制了H1299細胞產生的異種移植物、小鼠形成的LUAD和患者來源的LUAD細胞的胱氨酸攝取(圖3D-F)。圖3H證明了系統Xc功能受損與GSH水平降低相關。NAC和GSH給藥后發現，KPYWT小鼠的**負荷明顯高于給藥對照小鼠，且水平與KPE小鼠相似(圖3H、I)。與KPE小鼠相比，GSH和NAC給藥*導致KPYWT小鼠**中GSH/GSSG比值***增加。NAC和GSH的補充降低了KPYWT小鼠的脂質過氧化并縮短了存活時間(圖3K、L)。METTL14的上調可以通過m6A修飾降低PERP水平。骨折鼠模型科研 瀏覽工具將PROT...

隨著全球老齡化人口的逐步增長，研究和制定健康老齡化戰略的需求變得越來越重要，并呈現出新的緊迫性。衰老是一個復雜的過程，受遺傳和表觀遺傳調控、翻譯后調控、代謝調控、宿主-微生物組相互作用、生活方式和許多其他因素的影響。近年來，高通量組學技術（包括基因組學、轉錄組學、表觀基因組學、代謝組學、蛋白質組學、藥物基因組學和宏基因組學）已廣泛應用于衰老研究，從而對衰老相關的分子變化進行大規模分析。因此，與衰老相關的有價值的數據量越來越大，需要一個開放和集成的數據庫來支持新的衰老研究領域。大黃酸處理對正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應。WB科研省自然科學基金 四、atm依賴性PTEN磷酸化缺失的細胞中G...

相反，miR-199a-5p抑制劑處理可提高WT小鼠脾CD4+ T細胞中Sirt1的表達(圖5E)，并降低衰老標志物p21, p16和乙酰p53水平(圖5F)。***，與MRL/lpr相比，hUC-MSCs可增加miR-199a-5p的產生，表明hUC-MSCs是miR-199a-5p來源的關鍵調控因子 (圖5G)。在transwell系統中，hUC-MSCs與MRL/lpr脾CD4+ T細胞共培養48 h后，細胞內miR-199a-5p升高，Sirt1基因表達降低，CD4+ T細胞中衰老標志物的表達水平恢復，而miR-199a-5p抑制劑處理后仍處于抑制狀態(圖5G-I)。總的來說，這些數據...

2、白樺素下調SREBP靶基因，降低細胞脂質水平 由于SREBP-2是其自身的直接靶標，因此白樺素將其表達下調40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉錄因子這一觀點一致，膽固醇合成途徑中的10個被測基因，例如HMGCR，HMG-CoA合酶（HMGCS）和角鯊烯環氧酶（SE），都被白樺素處理抑制了（圖3A）。類似地，與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關的所有9個基因，例如SREBP-1c，脂肪酸合酶（FAS）和乙酰輔酶A羧化酶α（ACC），都被白樺素顯著下調（圖3B）。與早期觀察結果一致（圖1A），包括ABCG5和ABCG8在內的LXR靶基因不受白樺素的影響（圖3C）。 Ca...

三、在體內，tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制 為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸，我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中，GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而，定量分析顯示，在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中，核GFP信號減少的細胞百分比***增加，而核GFP強度***降低(圖3B和C)，說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來，我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的...